Foi descrito como uma nova espécie em 1869 pelo naturalista alemão Wilhelm Peters. Peters colocou-o no agora extinto género de morcegos Vesperus com um binômio de V. bottae. O holótipo foi colectado na Península Arábica por Paul-Émile Botta em 1837. Mais tarde, foi determinado que o local exacto do tipo era especificamente no sudoeste do Iêmen. Botta é o epônimo para o nome da espécie "bottae". Em 1878, George Edward Dobson escreveu que ele a considerava sinónimo do morcego serotina, Vesperugo (= Eptesicus) serotinus. Em 1967, foi referida como sua combinação de nome actual, Eptesicus bottae.
SIMMONS, N. B. Order Chiroptera. In: WILSON, D. E.; REEDER, D. M. (Eds.). Mammal Species of the World: A Taxonomic and Geographic Reference. 3. ed. Baltimore: Johns Hopkins University Press, 2005. v. 1, p.312-529.
