Uma semana após seu lançamento, "Gee" alcançou a primeira posição do Music Bank; entretanto, dúvidas surgiram quando o grupo não apareceu no programa por motivos desconhecidos, com rumores alegando uma possível racha entre a SM Entertainment e a KBS. "Gee" também atingiu a primeira posição do Inkigayo da SBS uma semana após o retorno do grupo.
"Gee" inicialmente empatou com "Nobody", de Wonder Girls, como canção com mais semanas em número #1 na Mnet (6 semanas). A canção quebrou o recorde ao permanecer no topo pela sétima semana, ficando ainda na primeira posição na oitava semana. Também quebrou o recorde de canção com mais semanas em número #1 do Music Bank da KBS, superando as sete semanas conquistadas anteriormente por "One More Time" (2008) de Jewelry. "Gee" alcançou seu nono #1 no programa em 13 de março de 2009 e recebeu sua 10ª vitória em 26 de junho de 2009.[carecede fontes]?
A canção também teve grande impacto em outras paradas, alcançando o topo das paradas Mujikon, MelOn e Mnet por oito semanas consecutivas, a parada Dosirak por sete semanas, a parada Muse por seis semanas, e a parada Baksu por quatro semanas. "Gee" atingiu o topo da parada horária da Cyworld no dia de seu lançamento. A canção também alcançou a primeira posição em todas as principais tabelas musicais digitais, em dois dias. "Gee" foi classificada como a canção da década por um dos sites mais populares de música da Coreia do Sul, MelOn.
Desempenho comercial
SM Entertainment divulgou que mais de 100.000 cópias do mini-álbum foram enviadas para as lojas, enquanto a empresa de análise de vendas Hanteo relatou vendas superiores a 30.000 cópias nos primeiros 10 dias de seu lançamento. De acordo com a SM Entertainment, o mini-álbum vendeu cerca de 65.000 cópias. Gee eventualmente conseguiu vender mais de 100.000 cópias.
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