As coníferas e as Gnetales são morfologicamente tão diferentes que o grupo praticamente não tem características morfológicas comuns. Assim, a existência do grupo enquanto clade depende exclusivamente de evidências obtidas a partir da filogenética molecular.
Sistemática
A classe Coniferopsida inclui dois grupos recentes e um extinto agrupados nas seguintes ordens:
†Voltziales, os presumíveis precursores extintos das coníferas.
A posição das Gnetales dentro das Coniferopsida é apoiada por muitos estudos de genética molecular. No entanto, alguns também mostram as Gnetales como o grupo irmão de todas as outras plantas com sementes recentes. As análises cladísticas que incluem plantas com sementes fósseis, no entanto, vêem-nas num clado juntamente com as angiospérmicas e Bennettitales.
Hipótese GnePin
Vários estudos também indicam que as Gnetophyta pertencem às coníferas, apesar de suas aparências distintas, colocando-as como um grupo irmão de Pinales (a hipótese 'gnepina', 'gnepine' ou 'GnePin') ou como sendo mais derivadas que Pinales, mas irmãs do resto do grupo. Os estudos mais recentes favorecem a hipótese 'GnePin'.
↑A. Bresinsky, Ch. Körner, J. W. Kadereit, G. Neuhaus, U. Sonnewald: Strasburger – Lehrbuch der Botanik. 36. Auflage. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2008, ISBN 978-3-8274-1455-7.
↑A. Bresinsky, Ch. Körner, J. W. Kadereit, G. Neuhaus, U. Sonnewald: Strasburger – Lehrbuch der Botanik. 36. Auflage. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2008, ISBN 978-3-8274-1455-7.
↑Thomas N. Taylor, Edith L. Taylor, Michael Krings: Paleobotany. The Biology and Evolution of Fossil Plants. Second Edition, Academic Press 2009, ISBN 978-0-12-373972-8.
↑Sarah Matthews: Phylogenetic relationships among seed plants: Persistent questions and the limits of molecular data. American Journal of Botany, Band 96, 2009, pp. 228–236. doi:10.3732/ajb.0800178