MUSCLE MUSCLE é frequentemente utilizado como um substituto para o Clustal , uma vez que normalmente (mas não sempre) dá melhor alinhamentos de seqüência e, além disso, o MUSCLE é significativamente mais rápido do que o Clustal , especialmente para alinhamentos maiores (Edgar 2004).
MUSCLE está integrado a ferramenta de bioinformática UGENE como um plugin .
Referências
Bases de dados
Sequências: GenBank , Arquivo Europeu de Nucleotídeos , DNA Data Bank of Japan e China National GeneBank
Bases secundárias: UniProt , base de sequências de proteínas que reúne Swiss-Prot , TrEMBL e Protein Information Resource
Outras bases: BioNumbers , Protein Data Bank , Ensembl , InterPro , KEGG e Gene Ontology
Bases genômicas especializadas: BOLD , Saccharomyces Genome Database , FlyBase , VectorBase , WormBase , Rat Genome Database , PHI-base , Arabidopsis Information Resource , GISAID e Zebrafish Information Network Programas Outros recursos Instituições
Broad Institute Departamento de Biologia Computacional , CBDCentro de Biologia Computacional e de Sistemas da Microsoft Research e da Universidade de Trento , COSBIDatabase Center for Life Science , DBCLSDNA Data Bank of Japan , DDBJInstituto Europeu de Bioinformática , EMBL-EBILaboratório Europeu de Biologia Molecular , EMBLFlatiron Institute Instituto J. Craig Venter , JCVIJoint Genome Institute , JGIInstituto Max Planck de Genética Molecular , MPIMGInstituto Max Planck de Biologia Celular Molecular e Genética , MPI-CBGNational Center for Biotechnology Information , NCBIInstituto Nacional de Genética , JapãoNetherlands Bioinformatics Centre , NBICCentro Genômico das Filipinas , PGCScripps Research Instituto Suíço de Bioinformática , SIBInstituto Wellcome Sanger Instituto Whitehead Organizações Encontros Formatos de arquivos Temas relacionados