Taxonomia e evolução
O gênero Macrotus era tradicionalmente classifcado na subfamília Phyllostominae, sendo classificado por alguns autores na tribo Micronycterini junto com gêneros como Micronycetris, Trinycteris e Glyphonycteris. Estudos moleculares, entretanto, demonstraram que Phyllostominae é um grupo polifilético e que muitas características morfológicas que uniam as espécies do grupo, como orelhas compridas e molares dilambdodontes são características primitivas em Phyllostomidae. Na maioria das filogenias moleculares Macrotus é recuperado como grupo-irmão dos demais filostomídeos, e por esse motivo é classificado em uma subfamília à parte.
Apenas uma espécie, Macrotus waterhousii, com até sete subespécies, era tradicionalmente reconhecida para o gênero. Entretanto, com base principalmente em características cariotípicas, duas espécies foram reconhecidas para Macrotus, M. californicus e M. waterhousii.
