É considerado um grande especialista em missiologia, tendo contribuído para melhor compreensão da inculturação da fé, para a evangelização libertadora e no diálogo interreligioso. Sua reflexão teológica foi marcada pela estreita relação com os povos nativos do Brasil indígena por mais de quarenta anos.
Defendia a necessidade de uma evangelização inculturada de acordo com a perspectiva dos excluídos, que transmitisse a esperança baseada em relatos dos pequenos e não na atitude dos conquistadores.
Obras
Volkskatholizismus in Brasilien. Typologie und Strategie gelebter Religiosität. Dissertação 1976, Münster. Kaiser, München 1978, ISBN 3459011394. Traduzido para o português em 1978.
"Em defesa dos povos indígenas. Documentos e legislação" (org.) (São Paulo, 1980);
"Do grito a canção. Poemas de resistência" (São Paulo, 1983);
Vom Schrei zum Gesang. Brasilianische Meditationen. Peter Hammer Verlag, Wuppertal 1985, ISBN 3779573938
"Cálice e cuia. Crônicas de pastoral e política indigenista" (Petrópolis, 1985);
"Utopia cativa: catequese indigenista e libertação indígena" (Petrópolis, 1986);
"A causa indígena na caminhada e a proposta do Cimi 1972-1989" (São Paulo, 1989);
"Culturas e evangelização";
"A unidade de razão evangélica na multiplicidade de suas vozes: pressupostos, desafios e compromissos" (São Paulo, 1991)
"A conquista espiritual da América Espanhola. 200 documentos - Século XVI" (org.) (Petrópolis, 1992);
"Evangelizar a partir dos projetos dos outros. Ensaios de missiologia" (São Paulo, 1995);
"Os confins do mundo no meio do nós. Simpósio missiológico internacional" (org.) (São Paulo, 2000);
Weltweit artikuliert – kontextuell verwurzelt. Theologie und Kirche Lateinamerikas vor den Herausforderungen des „dritten Subjekts“. Zeugnisse – Analysen – Perspektiven. IKO – Verlag für Interkulturelle Kommunikation, Frankfurt am Main/Londres 2001, ISBN 3889396232.
"Travessia com esperança. Memórias, diagnósticos, horizontes" (Petrópolis, 2001);
"Introducâo à Teologia da Missão" (Ed. Vozes, Petrópolis, 2007);
"Dicionário de Aparecida" (Ed. Paulus, São Paulo, 2007); (com outros);
Thomas Schreijäck (Ed.): Theologie als Gift und Gabe. Günter Paulo Suess zu Ehren, Edition Exodus, Luzern 2005.
Beiträge u.a.: Kuno Füssel: Erinnerung und Widerstand. Von der beharrlichen Anstrengung als Europäer für Lateinamerika zu leben. Laudatio anlässlich der Verleihung der Ehrendoktorwürde für Prof. Dr. Günter Paulo Suess.
Nikolaus Klein: Paulo Suess. Anwalt kontextueller Theologie. In: Orientierung 66/2002, ISSN0030-5502, S. 46–47.
Ottmar Fuchs: Ehre gebührt dem, der Ehre gibt... Laudatio für Paulo Suess. In: Orientierung 57/1993/20, ISSN0030-5502, S. 221–226.
Gedicht Im Januar von Paulo Suess. Das Gedicht ist von dem Komponisten Friedemann Schmidt-Mechau 1987 für ein gleichnamiges Stück für vierstimmigen Chor verwendet worden. Abgerufen am 23. Januar 2011.