Há alguma disputa sobre as espécies neste gênero. Esta lista deriva principalmente do trabalho de Kottelat, 2012, com a adição de espécies descritas posteriormente. Existem atualmente 21 espécies reconhecidas neste gênero:
12Yang, J. & Guo, Y.-S. (2013): A new species of the genus Sinogastromyzon Fang from Sichuan Province, China (Cypriniformes, Balitoridae). Acta Zootaxonomica Sinica, 38 (4): 895-900.