Varghese Chakkalakal nasceu em Malapallipuram, Distrito de Trichur, na Diocese de Kottapuram, em 7 de fevereiro de 1953, filho de Ouseph e Mariyam Chakkalakal. Estudou na Escola Primária de Santo Antônio, Malapallipuram, e na Escola Secundária de Santo Antônio, Mala. Concluiu seus estudos filosóficos e teológicos no Seminário Interdiocesano de São José, em Mangalore.
Foi ordenado sacerdote para a Diocese de Calicut em 2 de abril de 1981, pelo bispo Maxwell Valentine Noronha.
Após a ordenação, serviu como: padre assistente na Paróquia de Lourdu Matha, Pallikunnu (1981-1982); padre assistente na Paróquia de Santo Antônio, Pakkom (1982-1984); aluno do Instituto Pontifício de São José, Alwaye (1984-1986); padre assistente em três paróquias: Chalil, West Hill e Ezhimala (1986-1987). Obteve o título de mestre em Teologia pelo Seminário Pontifício de Alwaye e de mestre em História pela Universidade de Mysore.
Chakkalakal estudou na Pontifícia Universidade Urbaniana, em Roma, onde obteve o doutorado em Direito Canônico (1987-1991). De volta, ele serviu como pároco em Perinthalmanna e Chali (1991-1992). A partir de 1992, foi professor de Direito Canônico e Teologia Moral no Seminário de São José, em Mangalore.
Episcopado
Em 5 de novembro de 1998, foi nomeado o primeiro bispo de Kannur. Recebeu a ordenação episcopal em 7 de fevereiro de 1999, em cerimônia ao ar livre, perto da Catedral de Kannur, por Daniel Acharuparambil, OCD, Arcebispo de Verapoly; os principais co-consagradores foram Francis Kallarakal, Bispo de Kottapuram, e Maxwell Valentine Noronha, Bispo de Calicut.
Bento XVI o nomeou Bispo de Calicut em 15 de maio de 2012, permanecendo Administrador apostólico sede vacante et ad nutum Sanctae Sedis da diocese de Kannur. Monsenhor Chakkalakal foi empossado como sexto bispo de Calicut em 10 de junho do mesmo ano, pelo Núncio Apostólico na Índia, Arcebispo Salvatore Pennacchio. Ele continuou a administrar a Diocese de Kannur até a posse de seu sucessor, Alex Joseph Vadakumthala, em 23 de março de 2014.
Chakkalakal atuou como Secretário Geral do Conselho Episcopal Católico de Kerala (KCBC) e da Conferência Episcopal Católica da Índia (CCBI) e, no momento de sua elevação a arcebispo, liderava o Conselho Episcopal Católico Latino Regional de Kerala (KRLCBC) e a Comissão de Vocações, Seminários, Clero e Religiosos da CCBI.
Em 12 de abril de 2025, quando o papa Francisco elevou Calicut à arquidiocese metropolitana, Dom Chakkalakal se tornou o primeiro arcebispo metropolitano. Sua instalação como metropolita ocorreu em 25 de maio, na na Igreja de São José, em cerimônia conduzida pelo Núncio Leopoldo Girelli. Monsenhor Chakkalakal recebeu o pálio do Papa Leão XIV em 29 de junho de 2025.
