Bomokandi Nehri, Kongo Demokratik Cumhuriyeti'ndeki Kongo Havzası'nda bulunan bir nehirdir.
Nehir, Gombari yakınlarındaki Haut-Uélé ilinin güneydoğusundan doğar ve Haut-Uélé ve Bas-Uélé'den üzerinden ilerler, Rungu ve Poko'yu geçerek Bambili'de Uele Nehri'ne katılmak üzere doğu-kuzey-doğu yönünde akar.