Stramenopile

Stramenopile
Ochromonas sp. (Chrysophyceae).
Biyolojik sınıflandırma Bu sınıflandırmayı düzenle
Klad: SAR
İnfra alem: Stramenopiles
Patterson 1989
Phyla ve subphyla
Sinonimler
  • Straminopiles Vørs, 1993
  • Heterokonta Cavalier-Smith, 1986
  • Heterokontophyta van den Hoek et al., 1995
  • Stramenopila Alexopoulos et al., 1996
  • Straminipila Dick, 2001
  • Stramenipila Dick, 2001, orth. var.
Stramenopile
Ochromonas sp. (Chrysophyceae), with two unequal (heterokont) flagella. Mastigonemes not represented.
Ochromonas sp. (Chrysophyceae)
Taksonomi Edit this classification
Domain: Eukaryota
Clade: Diaphoretickes
Clade: SAR
Clade: Stramenopiles

Patterson 1989
Phyla ve subphyla
sinonim
  • Straminopiles Vørs, 1993
  • Heterokonta Cavalier-Smith, 1986
  • Heterokontophyta van den Hoek et al., 1995
  • Stramenopila Alexopoulos et al., 1996
  • Straminipila Dick, 2001
  • Stramenipila Dick, 2001, orth. var.

Heterokontlar olarak da adlandırılan Stramenopile, sert üçlü dış tüylerin varlığıyla ayırt edilen bir organizma kladıdır. Çoğu türde tüyler kamçıya bağlıdır, bazılarında hücre yüzeyinin diğer bölgelerine bağlıdır ve bazılarında ise kaybolmuştur. Stramenopile, Alveolata ve Rhizaria ile birlikte SAR süper grubundaki üç ana soydan birini temsil eder.

Stramenopiller ökaryotlardır; ne mantar, ne hayvan ne de bitki olmadıkları için eskiden protist olarak adlandırılmışlardır. Stramenopillerin çoğu tek hücrelidir ancak bazı büyük deniz yosunları, kahverengi algler gibi bazıları çok hücreli alglerdir. Grup, çeşitli alg protistlerini, heterotrofik kamçılıları, opalinleri ve yakından ilişkili proteromonad kamçılıları (diğer organizmalardaki tüm endobiyontlar) içerir. Bazı stramenopillerde üçlü tüyler kaybolmuştur - örneğin çoğu diyatomda bu şekildedir (bu organizmalar hala mastigonemik proteinler ifade etse de).

Tarih

'Stramenopile' terimi, belirsiz bir şekilde tanımlanmış heterokontlarla örtüşen bir grubu tanımlayan DJ Patterson tarafından 1989'da önerildi. "Stramenopile" adı JC David tarafından tartışılmıştır.

Soyoluş

Harici

 
 

Rhizaria

 
Halvaria
 

Stramenopiles

 
 

Alveolata

 
 
 

Dahili

Soy ağacı, Ruggiero ve diğerleri 2015 & Silar 2016'ya dayanmaktadır. Gyrista dışındaki bazı grupların yine de parafiletik olabilen Bigyra'ya ait olduğu tanımlanmıştır.

 
 
 

Platysulcidae Shiratori, Nkayama & Ishida 2015

 
 
 
Sagenista s.s.
 

Eogyrea

 
 

Labyrinthulea

 
 
 
 
 

Bikosea Cavalier-Smith 2013

 
 
Placidozoa
 

Placididea Moriya, Nakayama & Inouye 2002

 
 
 

Nanomonadea Cavalier-Smith 2013

 
 
 

Opalomonadea Cavalier-Smith 2013

 
Opalinata
 

Blastocystea Zierdt et al. 1967

 
 

Opalinea Wenyon 1926 emend. Cavalier-Smith 1993

 
 
 
 
 
Gyrista
 

Bigyromonadea Cavalier-Smith 1998

 
 
 

Oomycota Arx 1967

 
 
 

Hyphochytriomycota Whittaker 1969

 
 
 

Pirsoniales Cavalier-Smith 1998

 
Ochrophyta
Khakista
 

Bolidophyceae Guillou & Chretiennot-Dinet 1999

 
 

Bacillariophyceae Haeckel 1878

 
 
Phaeista
Hypogyristea s.s.

Dictyochophyceae Silva 1980 s.l.

 
Chrysista
 
Eustigmista
 

Pinguiophyceae Kawachi et al. 2002

 
 

Eustigmatophyceae Hibberd & Leedale 1971

 
 
 
 
Phagochrysia
 

Picophagea Cavalier-Smith 2006

 
 
 

Leukarachnion Geitler 1942

 
 

Chrysophyceae Pascher 1914

 
 
 
Xanthophytina
Raphidoistia

Raphidophyceae s.l.

 
Fucistia
 

Phaeophyceae Hansgirg 1886

 
 
 

Chrysomerophyceae Cavalier-Smith 1995

 
 
 

Phaeothamniophyceae Andersen & Bailey 1998 s.l.

 
 

Xanthophyceae (sarı-yeşil alg) Allorge 1930 emend. Fritsch 1935

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Sınıflandırma

Protist Paraphysomonas butcheri'nin elektron mikrografı. Sert tüylere sahip olmanın stramenopile özelliğini gösterir. Kıllar bir uzun kamçıya bağlanır, diğeri tüysüzdür ("eşitsiz" anlamına gelen "heterokont" olarak da adlandırılan bir düzenleme). Kamçılının gövdesi hassas pullarla kaplıdır. Paraphysomonas, ikisi kıllı flagellum yakınında bulunan bakterilerle beslenir.

Stramenopiles'in Adl et al. (2019)'e göre sınıflandırılması, yeni araştırmalardan yapılan eklemelerle birlikte:

Kaynakça

  1. ↑ Patterson, D.J. (1989). "Stramenopiles: Chromophytes from a protistan perspective". Green, J.C.; Leadbeater, B.S.C.; Diver, W.L. (Ed.). The chromophyte algae: Problems and perspectives. Clarendon Press. ISBN 978-0198577133.
  2. ↑ WoRMS Editorial Board. "Heterokonta". World Register of Marine Species (İngilizce). Flanders Marine Institute. doi:10.14284/170. Erişim tarihi: 3 Haziran 2019. Classification Biota Chromista (Kingdom) Harosa (Subkingdom) Heterokonta (Infrakingdom)
  3. 1 2 3 Cavalier-Smith, Thomas (2017). "Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences". Protoplasma. 255 (1): 297-357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. PMC 5756292 Özgürce erişilebilir. PMID 28875267.
  4. ↑ Vørs, N (1993). "Marine heterotrophic amoebae, flagellates and heliozoa from Belize (Central America) and Tenerife". Journal of Eukaryotic Microbiology. 40 (3): 272-287. doi:10.1111/j.1550-7408.1993.tb04917.x.
  5. 1 2 David, J.C. (2002). "A preliminary catalogue of the names of fungi above the rank of order". Constancea. 83: 1-30. 14 Şubat 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi13 Haziran 2023.
  6. ↑ Cavalier-Smith, T. (1999). "The kingdom Chromista, origin and systematics". Round, F.E.; Chapman, D.J. (Ed.). Progress in Phycological Research. 4. Elsevier. ss. 309-347. ISBN 978-0-948737-00-8.
  7. ↑ van den Hoek, C.; Mann, D.G.; Jahns, H.M. (1995). Algae An Introduction to Phycology. Cambridge University Press. ISBN 978-0-521-30419-1.
  8. ↑ Alexopoulos, C.J.; Mims, C.W.; Blackwell, M. (1996). Introductory Mycology (4. bas.). Wiley. ISBN 978-0471522294.
  9. 1 2 Dick, M.W. (2013). Straminipilous Fungi: Systematics of the Peronosporomycetes Including Accounts of the Marine Straminipilous Protists, the Plasmodiophorids and Similar Organisms. Springer. ISBN 978-94-015-9733-3.
  10. ↑ "Stramenipila M.W. Dick (2001)" 14 Şubat 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.. MycoBank. International Mycological Association.
  11. ↑ Patterson, D.J. (1989). "Stramenopiles: Chromophytes from a protistan perspective". In Green, J.C.; Leadbeater, B.S.C.; Diver, W.L. (eds.). The chromophyte algae: Problems and perspectives. Clarendon Press. ISBN 978-0198577133.
  12. ↑ Vørs, N (1993).
  13. ↑ Cavalier-Smith, T. (1999).
  14. ↑ van den Hoek, C.; Mann, D.G.; Jahns, H.M. (1995).
  15. ↑ Alexopoulos, C.J.; Mims, C.W.; Blackwell, M. (1996).
  16. ↑ "Stramenipila M.W. Dick (2001)" 14 Şubat 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi..
  17. ↑ D. J. (1989). "Stramenopiles: chromophytes from a protistological perspective". Leadbeater, B. S. C. (Ed.). The chromophyte algae: problems and perspectives. Oxford: Clarendon Press. ss. 357-379. Birden fazla |editör-ad= ve |editör-ilk= kullanıldı (yardım); |ad= ve |soyadı= eksik (yardım); |ad= eksik (yardım)
  18. ↑ David J. Patterson (1999). "The Diversity of Eukaryotes". The American Naturalist. 154 (S4): S96-S124. doi:10.1086/303287. PMID 10527921.
  19. ↑ J. C. David (2002). "A preliminary catalogue of the names of fungi above the rank of order". Constancea (83): 1-30. 16 Mart 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi13 Haziran 2023.
  20. ↑ Ruggiero ve diğerleri. (2015). "Higher Level Classification of All Living Organisms". PLOS ONE. 10 (4): e0119248. doi:10.1371/journal.pone.0119248. PMC 4418965 Özgürce erişilebilir. PMID 25923521.
  21. ↑ Silar, Philippe (2016). "Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes". HAL Archives-ouvertes: 1-462. 13 Mayıs 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi13 Haziran 2023.
  22. ↑ Cavalier-Smith (2013). "Phylogeny of Heterokonta: Incisomonas marina, a uniciliate gliding opalozoan related to Solenicola (Nanomonadea), and evidence that Actinophryida evolved from raphidophytes". European Journal of Protistology. 49 (3): 328-353. doi:10.1016/j.ejop.2012.09.002. PMID 23219323.
  23. ↑ Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019). "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 66 (1): 4-119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006 Özgürce erişilebilir. PMID 30257078.
  24. ↑ Thakur, Rabindra; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-ichiro (2019). "Taxon-rich Multigene Phylogenetic Analyses Resolve the Phylogenetic Relationship Among Deep-branching Stramenopiles". Protist. 170 (5): 125682. doi:10.1016/j.protis.2019.125682. ISSN 1434-4610. PMID 31568885.
  25. ↑ Shiratori, Takashi; Thakur, Rabindra; Ishida, Ken-ichiro (2017). "Pseudophyllomitus vesiculosus (Larsen and Patterson 1990) Lee, 2002, a Poorly Studied Phagotrophic Biflagellate is the First Characterized Member of Stramenopile Environmental Clade MAST-6". Protist. 168 (4): 439-451. doi:10.1016/j.protis.2017.06.004. ISSN 1434-4610. PMID 28822908.
  26. ↑ Wetherbee R, Jackson CJ, Repetti SI, Clementson LA, Costa JF, van de Meene A, Crawford S, Verbruggen H (April 2019). "The golden paradox - a new heterokont lineage with chloroplasts surrounded by two membranes". J Phycol. 55 (2): 257-278. doi:10.1111/jpy.12822. hdl:11343/233613. PMID 30536815.
  27. ↑ Medlin LK, Desdevises Y (2018). "Sequence analysis confirms a new algal class". Vie et Milieu/Life & Environment. 6 Ağustos 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi28 Eylül 2023.
  28. ↑ Graf, Louis; Yoon, Hwan Su (21 Temmuz 2021). "Olisthodiscophyceae, the 17th heterokont algal class". Journal of Phycology. 57 (4): 1091-1093. doi:10.1111/jpy.13184. PMID 34289104.
  29. ↑ Barcytė, Dovilė; Eikrem, Wenche; Engesmo, Anette; Seoane, Sergio; Wohlmann, Jens; Horák, Aleš; Yurchenko, Tatiana; Eliáš, Marek (2 Mart 2021). "Olisthodiscus represents a new class of Ochrophyta". Journal of Phycology. 57 (4): 1094-1118. doi:10.1111/jpy.13155. hdl:10852/86515. PMID 33655496.
  30. ↑ Graf L, Yang EC, Han KY, Küpper FC, Benes KM, Oyadomari JK, Herbert RJH, Verbruggen H, Wetherbee R, Andersen RA, Yoon HS (December 2020). "Multigene Phylogeny, Morphological Observation and Re-examination of the Literature Lead to the Description of the Phaeosacciophyceae Classis Nova and Four New Species of the Heterokontophyta SI Clade". Protist. 171 (6): 125781. doi:10.1016/j.protis.2020.125781. PMID 33278705.

Dış bağlantılar