Kulüp Kariyeri
- Atlético Paranaense
São Paulo'nun Itararé şehrinde doğan Marcos Guilherme, 2008 yılında 13 yaşındayken Atlético Paranaense'nin altyapısına katıldı. 2013 Campeonato Paranaense'de kulübün rezerv takımıyla ilk maçına çıktı ve 14 Mart'ta Nacional-PR'ye karşı evinde alınan 2-0'lık galibiyette ilk golünü attı.
Marcos Guilherme, 2014 yılında A takıma yükseltildi ve 20 Nisan 2014'te Grêmio FBPA'ya karşı evinde alınan 1-0'lık galibiyette ilk 11'de yer alarak Série A'daki ilk maçına çıktı. İlk golünü ise 10 Mayıs'ta SC Internacional'e karşı deplasmanda alınan 1-2'lik mağlubiyette ilk golü atarak kaydetti.
5 Eylül 2014'te Marcos Guilherme, Furacão ile olan sözleşmesini 2018'e kadar uzattı. İlk sezonunu kulübün en golcü oyuncusu ve en çok forma giyen oyuncusu olarak tamamladı; 54 maçta 11 gol kaydetti.
- Dinamo Zagreb (kiralık)
Ocak 2017'de Hırvat kulübü Dinamo Zagreb, Marcos Guillherme'nin sezon sonuna kadar kiralık olarak kulübe katıldığını duyurdu. Ligde 11 maçta forma giyen Guillherme, takımın HNK Rijeka'ya yenildiği Hırvat Futbol Kupası finaline ulaşmasına yardımcı oldu.
- São Paulo (kiralık)
20 Temmuz 2017'de Marcos Guilherme, 2018'in sonuna kadar kiralık olarak São Paulo FC'ye katıldı. Kulüp için ilk maçına dokuz gün sonra çıktı; ikinci yarıda Petros'un yerine oyuna girdi ve Botafogo'ya karşı deplasmanda 4-3'lük galibiyette iki gol attı.
Marcos Guilherme, kulübe geldikten sonra 2017 sezonunun her maçında düzenli olarak ilk 11'de yer aldı[9], ancak São Paulo, Atlético ile kalıcı transfer konusunda anlaşmaya varamayınca 3 Haziran 2018'de kulüpten ayrıldı.
- Al-Wehda
9 Haziran 2018'de Marcos Guilherme, Devrî'l-Muhterifin es-Suudî kulübü Al-Wehda ile sözleşme imzaladı. İlk sezonunda düzenli olarak ilk 11'de yer alan Guilherme, ikinci sezonunda ise az süre aldıktan sonra takımdan ayrıldı.
- Internacional
12 Ocak 2020'de Marcos Guilherme, SC Internacional ile iki yıllık bir anlaşma imzaladı
- Santos (kiralık)
27 Mayıs 2021'de Marcos Guilherme, Haziran 2022'ye kadar geçerli bir kiralık anlaşmayla Santos FC'ye transfer oldu. Teknik direktörler Fernando Diniz ve Fábio Carille yönetiminde düzenli olarak ilk 11'de yer alan Guilherme, yeni teknik direktör Fabián Bustos'un gelişiyle ilk 11'deki yerini kaybetmeden önce genellikle asıl pozisyonunun dışında oynadı.
- São Paulo'ya geri gönüş
Marcos Guilherme, 21 Haziran 2022'de SC Internacional ile olan sözleşmesini feshettikten sonra São Paulo FC'ye dönmeyi kabul etti.
- Khimki
9 Şubat 2023'te Guilherme, Rossiyskaya Premyer-Liga kulübü FK Himki ile bir buçuk yıllık bir sözleşme imzaladı. Khimki'nin küme düşmesinin ardından Haziran 2023'te kulüpten ayrıldı.
Brezilya U-20