William Allen Miller (17 Aralık 1817 - 30 Eylül 1870), İngiliz bilim insanı. Miller, aslında bir kimyager olmasına rağmen, bugün daha çok kendi döneminde yeni bilimsel çalışma alanları olan spektroskopi ve astrokimya alanlarındaki bilimsel katkılarıyla hatırlanmaktadır.
Miller, 1855 yılında Elements of Chemistry, Theoretical and Practical, Part I Chemical Physics adlı ders kitabını yazmıştır.
1867'de William Huggins ile birlikte yıldızların bileşimine ilişkin spektroskopik çalışmalarından dolayı Kraliyet Astronomi Derneği'nin Altın Madalyası'nı kazandı. 1845'te Kraliyet Derneği Üyesi seçildi.
Miller, 1870 yılında Introduction to the Study of Inorganic Chemistry kitabının el yazmasını tamamladığında hastalandı. Kitabı yayına hazırlaması için Charles Tomlinson'a verdi.