Zabel begann seine Karriere beim TSG Calbe und wechselte dann zum SC Magdeburg. In seiner Laufbahn wurde er im Vierer-Kajak einmal Olympiasieger, sechsmal Weltmeister und zweimal Silbermedaillengewinner bei Olympischen Spielen. Außerdem gewann Mark Zabel 2005 das 20km lange Surf Ski Rennen bei der Ostsee-Challenge in Rerik.
2005 beendete er seine Laufbahn als aktiver Sportler. Danach war bis Ende 2014 als Landestrainer im Landes-Kanu-Verband Sachsen-Anhalt tätig. Seit 2015 arbeitet er als Kanutrainer im Landesleistungszentrum Sachsen-Anhalt in Magdeburg.