Wikipedia:Wie erstelle ich Strukturformeln?/Tutorial Strukturformeln

Maße

Um innerhalb der Wikipedia ein einheitliches Aussehen der Strukturformeln zu erreichen, sollen folgende Werte als Leitlinie dienen, sie sind jedoch nicht zwingend. Die Parameter lassen sich in den Zeichenprogrammen an angegebener Stelle festlegen. Das nebenstehende Bild wurde mit diesen Einstellungen in ChemDraw erstellt.

Schriftart

Als Schriftart sollte Arial oder eine vergleichbare serifenlose Schriftart gewählt werden. Es empfiehlt sich ein Rand von etwa 5 px oder etwa 2,5 % der Breite/Höhe.

Vorteile

• BKChem ist Open Source und damit kostenlos
• Funktionsumfang reicht fast an das kommerzielle ChemDraw heran
• Intuitive Bedienung
• Deutschsprachige Menuführung möglich

Nachteile

• läuft bei manchen Formeln und völlig unreproduzierbar nicht stabil
• die von BKChem direkt erzeugbaren SVG-Files sind für die Wikipedia unbrauchbar (Bug in der Wikimedia-Software) - daher müssen die Formeln jedes Mal nachbearbeitet werden (siehe Abschnitt Konvertieren) oder über ein Plugin exportiert werden.
• Als ein Hobbyprojekt des Programmautors nur sehr selten Updates

Installation und Einstellungen

• Installiere Python in der Version 2. (z.B. Version 2.7)
• Download, Freeware, keine Registrierung nötig
• Installation
• Einstellungen
  • Unter "Options" - "Language" kann "Deutsch" ausgewählt werden
  • Unter "Einstellungen" - "Standardwerte" müssen nun in jedem Reiter die Werte angepasst werden, damit das Ergebnis Wikipedia:WEIS-konform ist.

• 
  Registerkarte Allgemein
• 
  Registerkarte Bindung
• 
  Registerkarte Schriftart
• 
  Registerkarte Blatt

Bei Windows XP und Windows 7 wird eventuell eine MSVCR71.DLL vermisst. Diese kann man hier herunterladen und mit Administratorrechten in folgenden Ordner kopieren:

• Windows XP: C:\Windows\System32\
• Windows 7 (64 bit Variante): C:\Windows\SysWOW64\

<?xml version="1.0" ?>
<cdml version="0.15" xmlns="http://www.freesoftware.fsf.org/bkchem/cdml">
  <info>
    <author_program version="0.12.2">BKchem</author_program>
  </info>
  <standard area_color="" font_family="helvetica" font_size="24" line_color="#000" line_width="0.06cm" paper_crop_margin="5" paper_crop_svg="1" paper_orientation="portrait" paper_type="Legal">
    <bond double-ratio="0.85" length="1.4cm" wedge-width="0.18cm" width="0.21cm"/>
    <arrow length="1.6cm"/>
  </standard>
</cdml>

<?xml version="1.0" ?>
<bkchem-prefs>
  <lang type="StringType">de</lang>
  <geometry type="StringType">1016x522+4+27</geometry>
  <recent-file1 type="StringType"></recent-file1>
  <recent-file2 type="StringType"></recent-file2>
  <use_real_minus type="IntType">0</use_real_minus>
  <default-dir type="StringType">~</default-dir>
</bkchem-prefs>

Zeichnen und speichern

• Struktur zeichnen
• Speichern als .svg (Dieses File ist ohne weitere Bearbeitung für Wikipedia unbrauchbar!)

Konvertieren

Inkscape

• Mit Inkscape (Download, Freie Software) öffnen
  • alles markieren (Ctrl + A)
  • Pfad/Objekt in Pfad umwandeln
  • unter neuem Namen abspeichern (so bleibt die erste Datei noch für BKChem verfügbar, denn BKChem kann mit Inkscape bearbeitete SVGs nicht mehr lesen!)
• weitere Hinweise zum Konvertieren und Nachbearbeiten mit Inkscape

Hilfe

• Fragen zu dieser Software-Lösung kann Codc beantworten.

Installation und Einstellungen

• Download, frei für nicht-kommerzielle Zwecke, Registrierung erforderlich
• Installation
• Wikipedia:WEIS-konforme Einstellungen vornehmen
• Seitenformat muss auf A3, A2 oder größer eingestellt werden, weil sich recht großformatige Formeln ergeben (hier hilft ein pdf-Druckertreiber wie z. B. PDFCreator).

Zeichnen und speichern

• Zeichnen
• Als PDF speichern, bzw. mit PDF Creator drucken

Konvertieren

• Mit Inkscape

Hilfe

• Fragen zu dieser Software-Lösung kann Steffen 962 beantworten.

Installation und Einstellungen

• Software unter diesem Link downloaden (kostenpflichtig, für Institutionen und Bildungseinrichtungen mit Lizenz ggf. kostenlos)
• Installation durch den Assistenten folgen
• Maße und Schriftart wie im Abschnitt Allgemeines einstellen. (spezifische .cds-Datei bei untenstehenden Benutzern erhältlich, notfalls ACS Document 1996 verwenden)

Zur SVG-Konvertierung benötigt:

• Scribus herunterladen und installieren (aktuell stabilste Version ist Scribus 1.6.1 → Download)
• Ghostscript ebenfalls herunterladen und installieren (benötigt für Konvertierung von .eps-Dateien zu .svg-Dateien mit Scribus) (→ Download)

Zeichnen und speichern

• Zeichnen der Strukturformel bzw. des Reaktionsschemas gemäß Wikipedia:WEIS (ggf. auch mit Rechtsklick auf freie Fläche → Convert Name to Structure möglich)
• Optional: Speichern des Dokuments als .cdx-Datei für spätere Bearbeitungen (File → Save As → unter Dateityp ChemDraw (*.cdx) auswählen → Speichern)
• Speichern des Dokuments als .eps-Datei (Encapsulated PostScript) (File → Save As → unter Dateityp Encapsulated PostScript (*.eps) auswählen → Speichern)

Konvertieren

• Öffnen der .eps-Datei in Scribus (Datei → Öffnen → .eps-Datei auswählen → OK)

Anmerkung: Nun sollte die Seitengröße genau auf die Größe der Strukturformel zugeschnitten sein.

• Exportieren des Dokuments als .svg-Datei (Datei → Exportieren → Als SVG speichern... → OK)

Anmerkung: Dateiname nochmals anpassen und den automatisch generierten Anhang „-Seite001“ entfernen!)

• Schließlich kann die Datei noch optional mit Inkscape nachbearbeitet und ggf. die Ränder etwas breiter gemacht werden.

Hochladen

Die Vektorgrafik (.svg-Datei) kann nun auf Wikimedia Commons hochgeladen werden. Dabei ist darauf zu achten, dass keine Quelltextfehler vorhanden sind. Die SVG-Datei kann mit diversen Online-Tools auf Fehler überprüft werden (→ W3C Markup Validation Service) und mit Hilfe des Commons SVG Checker als Vorschau angezeigt werden, um etwaige Darstellungsfehler noch vor dem Upload zu erkennen.

Hilfe

• Fragen zu dieser Software-Lösung können Jü, ChemSim (eigene Vorlage auf Anfrage erhältlich) und Leyo beantworten.

Installation und Einstellungen

GChemPaint ist ein Teil der GNOME Chemistry Utils jedoch selbst kein offizieller Bestandteil des GNOME-Desktops. Es verwendet als Maßeinheit generell Pixel und rechnet individuell Bindungslängen von Pikometer in Pixel um. Der Skalierungsfaktor ist so geeicht, dass er bei 154 pm Bindungslänge den oben in der Tabelle angegeben Werten in Pixel entspricht. Auch hier kann wieder folgende fertige Konfiguration als Text im Home-Ordner abgespeichert werden:

<?xml version="1.0"?>
<chemistry>
  <theme name="WP:WEIS" bond-length="154" bond-angle="120" bond-dist="7.94" bond-width="2.27" arrow-length="200" arrow-head-a="6" arrow-head-b="8" arrow-head-c="4" arrow-dist="5" arrow-width="1" arrow-padding="16" hash-width="1.2" hash-dist="5.73" stereo-bond-width="6.8" zoom-factor="2.96" padding="0" stoichiometry-padding="1" object-padding="16" sign-padding="8" charge-sign-size="24" font-family="Arial" font-style="normal" font-weight="normal" font-variant="normal" font-stretch="normal" font-size="24576" text-font-family="Arial" text-font-style="normal" text-font-weight="normal" text-font-variant="normal" text-font-stretch="normal" text-font-size="24576" />
</chemistry>

Ab Version 0.12 ist dies nicht mehr nötig, da die Formatierungshilfe Bestandteil der offiziellen Distribution ist. Unter Datei - Eigenschaften - Thema kann Wikipedia ausgewählt werden.

Zeichnen und speichern

Das Programm bietet ab Version 0.10 einen Knopf mit dem markierte Moleküle als PNG abgespeichert werden und zusätzlich noch Metadaten in Form des InChI angehängt werden. Zu deren Verwendung besteht zumindest in der deutschen Wikipedia kein Konsens. Ab Version 0.12 werden durch Cairo gerenderte SVG-Dateien unterstützt. Diese sind ohne Umwege mit librsvg kompatibel. GChemPaint speichert seine Daten intern im XML-Format ab. Damit die Dateien von anderen Benutzern mit GChemPaint weiterbearbeitet werden können, bietet es sich diese auf die Bildschreibungsseite zu kopieren (siehe Datei:Bakelit Struktur.svg). Mit {{Created with GChemPaint}} lässt sich bei Wikimedia Commons ein Hinweis setzen, dass die Datei mit GChemPaint gezeichnet wurde.

Hilfe

• Fragen zu dieser Software-Lösung kann Matthias beantworten.

Installation

• Download Freeware, seit 2011 nicht mehr aktualisiert
• Installation

Zeichnen und speichern

• Zeichnen
• Speichern, als sk2-Datei für spätere Änderungen und für die Weiterverarbeitung zu svg als PDF-Datei
• andere Datenformate sind u.a. tif, gif, jpg, png, molfiles (v2000 und v3000), bmp, aber kein svg.

Konvertieren

• Mit Inkscape

Hilfe

• Fragen zu dieser Software-Lösung kann Elrond beantworten.
• Ein kurzes Tutorial (in Englisch)

Hilfe

• Fragen zu dieser Software-Lösung kann NadirSH beantworten.