Biogeeninen amiini on biologisesta aineesta peräisin oleva amiini. Biogeeniset amiinit ovat pienimolekyylisiä aineenvaihduntatuotteita, joita esiintyy pieninä pitoisuuksina eläimissä ja kasveissa ja elintarvikkeissa.
Monissa kasviperäisissä elintarvikkeissa kuten tomaatissa, banaanissa, sitrushedelmissä, luumussa, avokadossa, vadelmassa ja pavuissa esiintyy luontaisesti pieniä määriä amiineja. Amiineja saattaa muodostua pilaantumisen seurauksena myös eläinperäisiin elintarvikkeisiin. Pilaantuminen synnyttää amiineja helposti etenkin tonnikalaan, makrilliin, silliin ja pitkään kypsytettyihin juustoihin.

Suuret amiinipitoisuudet saattavat aiheuttaa amiinimyrkytyksen, josta ilmenee allergian kaltaisina äkillisinä oireina. Histamiini on tyypillisin amiinimyrkytyksen aiheuttaja. Histamiini saattaa aiheuttaa kahden tunnin kuluessa elintarvikkeen nauttimisesta ihon punoitusta, nokkosrokkoa, päänsärkyä, ripulia, kuumia aaltoja ja hikoilua. Muita mahdollisia oireita ovat oksentelu ja sydämentykytys.
Biogeeniset amiinit saattavat myös kiihdyttää syöpäkasvaimen kasvua.