EU INTCEN perustettiin 18. maaliskuuta 2012. Aikaisemmassa muodossaan se tunnettiin nimellä SITCEN (EU Situation Centre).
Vuodesta 2011 alkaen keskus on toiminut Euroopan ulkosuhdehallinnon alaisuudessa. Lissabonin sopimuksella vuonna 2009 perustettu Euroopan ulkosuhdehallinto toimii EU:n ulkoministeriönä jolla on oma diplomaattikuntansa. Se toteuttaa EU:n yhteistä ulko- ja turvallisuuspolitiikkaa (YUTP) ja edustaa EU:ta suhteissa muuhun maailmaan. Euroopan ulkosuhdehallintoa johtaa unionin ulkoasioiden ja turvallisuuspolitiikan korkea edustaja eli EU:n ulkoministeri.
Toiminta
Tiedustelupalvelujen tavoin EU INTCENin tehtäviin kuuluu analysoida ja tuottaa vakoiluaineistoa. Keskuksen tehtäviin kuuluu muun muassa terrorismin, verkkoturvallisuuden ja konfliktialueiden tarkkailu.
Organisaatio
EU INTCENissä on kaksi osastoa:
Tiedusteluosasto: EU:n jäsenmaiden tiedustelupalveluiden vakoiluaineistojen analysoiminen ja raportoiminen