Hodarchaeum mangrovi

Classification
Domaine	Archaea
Règne	Proteoarchaeati
Phylum	Promethearchaeota
Classe	Heimdallarchaeia
Ordre	Hodarchaeales

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Candidatus Hodarchaeum mangrovi est une espèce d’archées du phylum des Promethearchaeota. C'est la seule espèce de la famille monotypique des Hodarchaeaceae dans la classe des Heimdallarchaeia^,^,.

Eucaryogénèse

Les Eukaryota ont émergé parmi les archées d'Asgård. Alors que leur dernier ancêtre commun était vraisemblablement un organisme chimiotrophe thermophile, la lignée dans laquelle l'eucaryogenèse s'est produite, se serait adaptée à des conditions mésophiles et à un mode de vie hétérotrophe (par syntrophie). Une étude de 2023 présente les Hodarchaeales comme le groupe frère du domaine des Eukaryota^,. Mais une autre étude de 2025 situe l'eucaryogénèse plus tôt, en amont des Heimdallarchaeia. Selon cette dernière étude, « le dernier ancêtre commun des archées d'Asgård et des eucaryotes est apparu avant le Grand Évènement d'oxydation et était probablement un acétogène anaérobie dépendant de l'hydrogène (H₂) ». Les eucaryotes seraient en effet issus de la fusion d'une archée hôte consommatrice d'H₂ et d'une protomitochondrie productrice d'H₂.

Étymologie

Le taxon Hodarchaeum est basé sur le nom de divinité nordique Höd (Höðr), fils d'Odin, suivi du terme archaeum 'archée' (nom neutre).

L'épithète spécifique mangrovi signifie 'de la mangrove', milieu dans lequel l'espèce a été identifiée.

Position phylogénétique

Proteoarchaeati

Korarchaeota

Thermoproteota

	Bathyarchaeia

	Nitrososphaeria

Sulfolobia

	Methanosuratincolia

	Thermoproteia

Promethearchaeota

Promethearchaeia

	Sigynarchaeaceae

	Promethearchaeaceae

Baldrarchaeia

Sifarchaeia

	Odinarchaeia

	Jordarchaeia

Heimdallarchaeia

	Hodarchaeales

	Wenzhongarchaeales

Wukongarchaeales

Gerdarchaeales

	Heimdallarchaeaceae

	Kariarchaeaceae

(+α─Proteobacteria)

Eukaryota

Asgård

Références

↑ (en) Yang Liu, Kira S. Makarova, Wen-Cong Huang et Yuri I. Wolf, « Expanded diversity of Asgard archaea and their relationships with eukaryotes », Nature, vol. 593, n^o 7860,‎ mai 2021, p. 553–557 (ISSN 1476-4687, DOI 10.1038/s41586-021-03494-3, lire en ligne, consulté le 31 mai 2026)
↑ (en) Jiawei Zhang, Xiaoyuan Feng, Meng Li, Yang Liu, Min Liu, Li-Jun Hou et Hong-Po Dong, « Deep origin of eukaryotes outside Heimdallarchaeia within Asgardarchaeota », Nature, vol. 642, n^o 8069,‎ 7 mai 2025, p. 990–998 (ISSN 1476-4687, PMID 40335687, PMCID 12222021, DOI 10.1038/s41586-025-08955-7 , lire en ligne)
↑ Hiroyuki Imachi, Masaru K. Nobu, Shingo Kato, Yoshihiro Takaki, Masayuki Miyazaki, Makoto Miyata, Miyuki Ogawara, Yumi Saito, Sanae Sakai, Yuhei O. Tahara, Yoshinori Takano, Eiji Tasumi, Katsuyuki Uematsu, Toshihiro Yoshimura et Takashi Itoh, « Promethearchaeum syntrophicum gen. nov., sp. nov., an anaerobic, obligately syntrophic archaeon, the first isolate of the lineage ‘Asgard’ archaea, and proposal of the new archaeal phylum Promethearchaeota phyl. nov. and kingdom Promethearchaeati regn. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 74, n^o 7,‎ 2024, p. 006435 (ISSN 1466-5034, PMID 38967634, PMCID 11316595, DOI 10.1099/ijsem.0.006435 , lire en ligne)
↑ Parte, A.C., Sardà Carbasse, J., Meier-Kolthoff, J.P., Reimer, L.C. and Göker, M. (2020). List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 70, 5607-5612; DOI: 10.1099/ijsem.0.004332
1 2 Cécile Breton, « Une lignée mystérieuse de 2 milliards d'années change tout sur l'origine des animaux et des plantes », sur Futura, 28 mai 2026 (consulté le 31 mai 2026)
↑ (en) Laura Eme, Daniel Tamarit, Eva F. Caceres et Courtney W. Stairs, « Inference and reconstruction of the heimdallarchaeial ancestry of eukaryotes », Nature, vol. 618, n^o 7967,‎ juin 2023, p. 992–999 (ISSN 1476-4687, DOI 10.1038/s41586-023-06186-2, lire en ligne, consulté le 31 mai 2026)
↑ (en) Jiawei Zhang, Xiaoyuan Feng, Meng Li et Yang Liu, « Deep origin of eukaryotes outside Heimdallarchaeia within Asgardarchaeota », Nature, vol. 642, n^o 8069,‎ juin 2025, p. 990–998 (ISSN 1476-4687, DOI 10.1038/s41586-025-08955-7, lire en ligne, consulté le 5 juin 2026)
↑ (en) « Species: Hodarchaeum mangrovi », sur lpsn.dsmz.de (consulté le 3 juillet 2026)

Portail de la microbiologie

[1] (en) Yang Liu, Kira S. Makarova, Wen-Cong Huang et Yuri I. Wolf, « Expanded diversity of Asgard archaea and their relationships with eukaryotes », Nature, vol. 593, n^o 7860,‎ mai 2021, p. 553–557 (ISSN 1476-4687, DOI 10.1038/s41586-021-03494-3, lire en ligne, consulté le 31 mai 2026)

[:0-2] (en) Jiawei Zhang, Xiaoyuan Feng, Meng Li, Yang Liu, Min Liu, Li-Jun Hou et Hong-Po Dong, « Deep origin of eukaryotes outside Heimdallarchaeia within Asgardarchaeota », Nature, vol. 642, n^o 8069,‎ 7 mai 2025, p. 990–998 (ISSN 1476-4687, PMID 40335687, PMCID 12222021, DOI 10.1038/s41586-025-08955-7 , lire en ligne)

[3] Hiroyuki Imachi, Masaru K. Nobu, Shingo Kato, Yoshihiro Takaki, Masayuki Miyazaki, Makoto Miyata, Miyuki Ogawara, Yumi Saito, Sanae Sakai, Yuhei O. Tahara, Yoshinori Takano, Eiji Tasumi, Katsuyuki Uematsu, Toshihiro Yoshimura et Takashi Itoh, « Promethearchaeum syntrophicum gen. nov., sp. nov., an anaerobic, obligately syntrophic archaeon, the first isolate of the lineage ‘Asgard’ archaea, and proposal of the new archaeal phylum Promethearchaeota phyl. nov. and kingdom Promethearchaeati regn. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 74, n^o 7,‎ 2024, p. 006435 (ISSN 1466-5034, PMID 38967634, PMCID 11316595, DOI 10.1099/ijsem.0.006435 , lire en ligne)

[4] Parte, A.C., Sardà Carbasse, J., Meier-Kolthoff, J.P., Reimer, L.C. and Göker, M. (2020). List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 70, 5607-5612; DOI: 10.1099/ijsem.0.004332

[:1-5] 1 2 Cécile Breton, « Une lignée mystérieuse de 2 milliards d'années change tout sur l'origine des animaux et des plantes », sur Futura, 28 mai 2026 (consulté le 31 mai 2026)

[6] (en) Laura Eme, Daniel Tamarit, Eva F. Caceres et Courtney W. Stairs, « Inference and reconstruction of the heimdallarchaeial ancestry of eukaryotes », Nature, vol. 618, n^o 7967,‎ juin 2023, p. 992–999 (ISSN 1476-4687, DOI 10.1038/s41586-023-06186-2, lire en ligne, consulté le 31 mai 2026)

[7] (en) Jiawei Zhang, Xiaoyuan Feng, Meng Li et Yang Liu, « Deep origin of eukaryotes outside Heimdallarchaeia within Asgardarchaeota », Nature, vol. 642, n^o 8069,‎ juin 2025, p. 990–998 (ISSN 1476-4687, DOI 10.1038/s41586-025-08955-7, lire en ligne, consulté le 5 juin 2026)

[8] (en) « Species: Hodarchaeum mangrovi », sur lpsn.dsmz.de (consulté le 3 juillet 2026)