Mécanismes généraux
Dans Nintendo Wars, le joueur doit exclusivement mener des batailles. Pour cela, il dispose d'unités et/ou de bases pour en déployer et doit remplir les objectifs fixés dans chaque bataille.
Champ de bataille
Celui-est constitué d'une grille servant de référentiel pour les déplacements et les portées de chaque unité. Chaque case de la grille est occupé par un terrain unique et ne peut être occupée que par une seule unité. Les terrains sont souvent placés de manière à former un environnement réaliste qui évoque un vrai champ de bataille. Ainsi, les cases occupés par un terrain rivière sont habituellement juxtaposées les unes aux autres de manière à relier une zone où sont concentrés des terrains montagne à une autre zone où se trouvent exclusivement des cases mer. Cependant, il est possible de créer et il existe des cartes où les terrains sont uniquement disposés à des fins stratégiques. En effet, la nature du terrain d'une case influence directement l'unité qui se trouve dessus par le biais de la couverture défensive. Ainsi, une unité se trouvant sur une route se verra infliger beaucoup plus de blessures que si elle était dans une forêt. Une unité se trouvant sur une ville qui lui appartient sera automatiquement réparée de deux PV au début de son tour. Et enfin, les déplacements sont directement influencés par le terrain: un véhicule sur roues par exemple ira quatre fois moins vite en forêt que sur la route.
Combats
Le système de combats a été plusieurs fois modifié selon les opus de la série. Néanmoins il s'agit pour la plupart du système classique de déplacement par case au tour par tour, initié par la série Fire Emblem, elle aussi développée par Intelligent Systems.
Les épisodes en 3D, se rapprochent plus des jeux de stratégie en temps réel mais sans la gestion des ressources.
