Les Sarcomastigota sont un sous-règne de protistes du règne des Protozoa.
Le systématicien britannique Thomas Cavalier-Smith définit en 1983 ce sous-règne comme regroupant les protozoaires ayant des mitochondries avec des cristae tubulaires ou vésiculaires. Il comprend les Amibozoaires, les Apusozoaires, les Choanozoaires et les Sulcozoaires.
Le nom valide de ce taxon est Sarcomastigota Cavalier-Smith, 1983.
Selon l'IRMNG () :
Selon le World Register of Marine Species () :
L'IRMNG () considère les Apusozoa comme un sous-embranchement des Sulcozoa.