Physaraceae

Physaraceae
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Törzs: Amoebozoa
Osztály: Myxogastria
Rend: Physarales
Család: Physaraceae
Chevall. 1826
Szinonimák

Physaridae (ICZN)

Hivatkozások
A Wikimédia Commons tartalmaz Physaraceae témájú kategóriát.

A Physaraceae (ICN, az ICZN szerint Physaridae) Myxogastria Physarales rendjének családja.

Gyakoribbak vizes élőhelyeken és akváriumokban.

Történet

F. F. Chevallier 1826-ban írta le a családot.

2012-ben 18S rDNS alapján igazolták, hogy monofiletikus csoport.

Erastova et al. 2013-ban a Kelleromyxa nemzetség bazális helyzete miatt létrehozták a Kelleromyxaceae kládot, azonban e döntés nem szükségszerű, mivel a Physaraceaevel alkotott csoportja monofiletikus.

2019-ben Leontyev et al. filogenetikai alapon újradefiniálták, és több nemzetség, például a Willkommlangea ide sorolását feltételezték.

García-Martín et al. 2023-ban néhány nemzetséget újradefiniáltak, például a Diachea nemzetséget néhány korábban a Physaraceae csoportba sorolt fajjal bővítették ki, a Physarum globuliferumot és más erősen meszesedő spóratartójú fajokat a Nannengaella nemzetségbe soroltak, a Fuligo muscorum számára a Lignydium, a Physarum pezizoideumot tartalmazó kládnak a Trichamphora nevet javasolták. Összesen 22 új kombinációt javasoltak különböző nemzetségekben.

Morfológia

Perídiumában, kapillítiuma csöveiben és – ha van – tönkjében mészlerakódások vannak. A tönk szubhipotallikus, a kapillítium üreges és 3 dimenziós hálózatot alkot, benne a mészlerakódások a csomópontokban koncentrálódhatnak vagy egyenlően eloszolhatnak a csövekben. Kolumellájuk nincs, azonban egyes fajaiban a sporotékába futó hasonló kiemelkedés lehet a tönk végén, vagy pszeudokolumella jöhet létre mészkőből. Szubhipotallikus tönkje a Didymiaceae kládtól függetlenül fejlődött ki. A Badhamia perídiuma papírszerű állagú, de fényes, egyes fajai spórái sötétek és szögletesek. A kapillítiumban lévő mész a Physaralesben csak a Physaraceae csoportra jellemző. A spóratartókban a mész mennyisége változhat, ha kevés van, a perídium törékeny és fényes. Szemben a Didymiaceae csoporttal, diverzitása filogenetikai és taxonómiai diverzitása jelentős.

Tubuláris kapillítiuma mészszemcséket tartalmazhat, vagyis primer kapillítiumát szekunder válthatta fel.

A Wilkommlangea kettős kapillítiummal rendelkezik.

Életciklus

A Physarella oblonga kalciumot bocsát ki sporogeneziskor és a mozgó plazmódiumból a szesszilis termőtestbe való átmenetkor. Sporogeneziskor több tíz nanométeres kalcium- és elektrongazdag membránkötött sejtbeli szemcsék alakulnak ki és állnak össze, kibocsátásukkor 500–1500 nm-es gömbölyű perídiumot alkot. Ezt megfigyelték a Fuligo septica sejtjeiben keletkező szemcsékben is, azonban ezek amorfak, és nem rendeződnek kristályba.

Kölcsönhatások

Az atkák a Physaraceae és a Didymiaceae életciklusának minden szakaszát eszik, de elsősorban a halott és bomló plazmódiumot, majd a spórákat, majd az élő plazmódiumot, végül a szkleróciumot.

Genomika

A szincitiumos Physarum polycephalum expresszáltszekvencia-jelölőinek adatai 2008-ban jelentek meg.

Glikokonjugátum-bontó enzimekkel rendelkezik, a Fomes fomentarius-sejtfal bontásában feltehetően a legfontosabb csoport. Ezenkívül egyes fajai mikofágok is lehetnek.

I-es csoportbeli intronjai csak szülőtől utódra szállnak, nem horizontális géntranszferrel, 28S rRNS-ük L1949 és L2449 intronjai maguktól nem válnak le in vitro csupasz RNS-ként, így gazdájuk splicingfaktoraitól függnek

Taxonómia

Tagjai többek közt a Craterium, a Leocarpus, a Fuligo, a Physarum, a Physarella, a Physarina és a Kelleromyxa nemzetségek. A Physarella a Physarumon belül ágazik el, mélyen üreges sporotékája nemcsak egyetlen leírt fajában, hanem a Physarum pezizoideumban és a Physarum javanicumban is megtalálható, e nemzetség így bővülhet. A Physarina részleges 18S rDNS-szekvenciák alappján a Physarum közeli rokona.

Jelentős mértékű homopláziái miatt legtöbb nemzetsége feltehetően a makromorfológiára hagyatkozás miatt polifiletikus, például a Fuligo nemzetséget meghatározó etáliumos termőtest legalább 6-szor jelent meg egymástól függetlenül, a tönk sokszor szűnt meg és jelent meg a csoportban – egy csoporton belül egyaránt előfordulhatnak tönkös és szesszilis fajok is.

Jegyzetek

  1. ↑ Tamayama M, Keller HW (2013). "Aquatic myxomycetes" (PDF). Fungi. Vol. 6, no. 3. Hozzáférés: 2024. augusztus 25.
  2. ↑ Chevallier FF. "Flore générale des environs de Paris, selon la méthode naturelle. Description de toutes les plantes agames, cryptogames et phanérogames qui y croissent spontanément; leurs propriétés, leurs usage dans la médecine, les arts, et l'économie domestique; avec une classification naturelle des agames et des cryptogames, basée sur l'organisation de ces végétaux et accompagnée de dix-huit tableaux iconographiques formant un genera propre à en rendre l'étude plus facile". 1. Paris: Ferra Jeune. {{cite journal}}: Cite journal requires |journal= (súgó)
  3. ↑ Fiore-Donno AM, Kamono A, Meyer M, Schnittler M, Fukui M, Cavalier-Smith T (2012. április 18.). "18S rDNA phylogeny of Lamproderma and allied genera (Stemonitales, Myxomycetes, Amoebozoa)". PLoS One. 7 (4): e35359. doi:10.1371/journal.pone.0035359. PMC 3329430. PMID 22530009.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  4. 1 2 3 4 5 6 Leontyev DV, Schnittler M, Stephenson SL, Novozhilov YK, Shchepin ON (2019). "Towards a phylogenetic classification of the Myxomycetes". Phytotaxa. 399 (3): 209–238. doi:10.11646/phytotaxa.399.3.5. ISSN 1179-3163.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  5. 1 2 3 4 García-Martín JM, Zamora JC, Lado C (2023. augusztus 23.). "Multigene phylogeny of the order Physarales (Myxomycetes, Amoebozoa): shedding light on the dark-spored clade". Persoonia. 51: 89–124. doi:10.3767/persoonia.2023.51.02. PMC 11041899. PMID 38665983.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  6. ↑ Lee JH, Han KS, Bae DW, Kim DK, Kim HK (2008. szeptember 30.). "Identification of Diachea leucopodia on Strawberry from Greenhouse in Korea". Mycobiology. 36 (3): 143–147. doi:10.4489/MYCO.2008.36.3.143. PMC 3755183. PMID 23997614.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  7. ↑ Parente MPM, Bezerra MFA, Cavalcanti LH (2009). "Myxomycetes, Physarales, Physaraceae, Physarum rigidum (G. Lister) G. Lister: Distribution extension and new records". Check List. 5 (4): 759–762. ISSN 1809-127X. 2024. augusztus 25. dátummal az eredeti címről archiválva. Hozzáférés: 2024. augusztus 25. {{cite journal}}: Unknown parameter |month= ignored (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  8. ↑ Nandipati SC, Haugli K, Coucheron DH, Haskins EF, Johansen SD (2012. augusztus 31.). "Polyphyletic origin of the genus Physarum (Physarales, Myxomycetes) revealed by nuclear rDNA mini-chromosome analysis and group I intron synapomorphy". BMC Evol Biol. 12 (166). doi:10.1186/1471-2148-12-166. PMC 3511172. PMID 22938158.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  9. ↑ Garvie LAJ, Németh P, Trif L (2022. március 7.). "An exceptionally stable and widespread hydrated amorphous calcium carbonate precipitated by the dog vomit slime mold Fuligo septica (Myxogastria)". Sci Rep. 12 (3642). doi:10.1038/s41598-022-07648-9. PMC 8901774. PMID 35256681.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  10. ↑ Michalczyk-Wetula D, Jakubowska M, Felska M, Skarżyński D, Mąkol J, Płonka PM (2021. május 10.). "Tyrophagus putrescentiae (Sarcoptiformes: Acaridae) in the in vitro cultures of slime molds (Mycetozoa): accident, contamination, or interaction?". Exp Appl Acarol. 84 (2): 445–458. doi:10.1007/s10493-021-00608-4. PMC 8190028. PMID 33970406.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  11. ↑ Glöckner G, Golderer G, Werner-Felmayer G, Meyer S, Marwan W (2008. január 7.). "A first glimpse at the transcriptome of Physarum polycephalum". BMC Genomics. 9 (6). doi:10.1186/1471-2164-9-6. PMC 2258281. PMID 18179708.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  12. ↑ Bosch J, Dobbler PT, Větrovský T, Tláskal V, Baldrian P, Brabcová V (2024. április 10.). "Decomposition of Fomes fomentatius fruiting bodies - transition of healthy living fungus into a decayed bacteria-rich habitat is primarily driven by Arthropoda". FEMS Microbiol Ecol. 100 (5): fiae044. doi:10.1093/femsec/fiae044. PMC 11030162. PMID 38640440.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  13. ↑ Hedberg A, Johansen SD (2013. június 5.). "Nuclear group I introns in self-splicing and beyond". Mob DNA. 4 (17). doi:10.1186/1759-8753-4-17. PMC 3679873. PMID 23738941.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link)