Rhizamoeba

Rhizamoeba
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Amoebozoa
Csoport: Tubulinea
Csoport: Leptomyxida
Nemzetség: Rhizamoeba
Page 1972 emend. Smirnov et al. 2016
Típusfaj
Rhizamoeba polyura
Page 1972
Csoportok
  • Rhizamoeba polyura
  • Rhizamoeba saxonica
  • Rhizamoeba matisi
Hivatkozások
A Wikifajok tartalmaz Rhizamoeba témájú rendszertani információt.

A Rhizamoeba a monotipikus Rhizamoebidae szabadon élő tengeri lebenyes amőbáinak egyetlen nemzetsége a Leptomyxida kládban. Legközelebbi rokonai a Leptomyxa és a Flabellula, egyes korábban ide sorolt fajok molekuláris adatok alapján a Leptomyxába kerültek.

Történet

Típusfaját, a Rhizamoeba polyurát 1972-ben, második faját, a R. saxonicát 1974-ben írta le Page. 1985-ben a Ripidomyxa australiensist – ezzel érvénytelenítve az addig monotipikus Ripidomyxa nemzetséget –, 1988-ban a Leptomyxa flabellatát helyezte át ide. Ennek eredményeként a rögzítő farokszerkezetű általában monopodiális és nem perforált plazmódiumú fajok e nemzetségbe kerültek. Később Smirnov et al. 2009-ben, Mrva 2017-ben írták le további fajait. Page eredeti leírása szerint a Leptomyxida szinte bármely ideiglenesen monopodiális mozgó állapotú faja a nemzetségbe sorolható, mert a leíráshoz használt többi morfológiai jellemző, például a farokfonalak és az alkalmankénti sejtplazma-kiemelkedések, a Leptomyxida nagy részében jelen van.

2007-ben Smirnov et al. kimutatták, hogy a R. saxonica CCAP 1570/2 – a legkorábban leírt R. saxonica-törzs – a legkorábban kialakult Leptomyxida-klád, így filogenetikailag távol van a korábban ugyanide sorolt ATCC 50742 törzstől, mely a Paraflabellula tagjának bizonyult – testvérfaja a Paraflabellula hoguae, a két faj csoportjáé pedig a Paraflabellula reniformis – de nem írták le új fajként, mivel nem volt róla morfológiai adat. Emellett a Rhizamoebában szereplő többi ATCC-törzset is vizsgálandóként és megfelelően meghatározandóként írták le Dyková et al. változatos helyzeteik miatt. Emellett a R. saxonicáról leírták, hogy kolloszómái, mozgó alakja változásai, magasabb hossz/szélesség aránya és sokkal kevésbé buzogányszerű alakja miatt önálló nemzetségbe sorolható lehet.

2016-ban Thomas Cavalier-Smith et al. a Leptomyxida kládba sorolták.

Mivel molekuláris adatok alapján a korábbi Leptomyxa- és Rhizamoeba-szekvenciák keveredtek, Smirnov et al. 2017-ben a legtöbb Rhizamoeba-fajt a Leptomyxába helyezték át, így a nemzetség 3 fajból állt: ezek a R. saxonica Page 1974, a R. polyura Page 1972 és a R. matisi Mrva 2017 in Smirnov 2017, és kimutatták, hogy a mozgó állapot morfológiája nem különbözteti meg egyértelműen a két nemzetséget, így a molekuláris filogenetika az elsődleges a két nemzetség közti döntéskor.

Rendszertantörténet

Page eredetileg a Hartmannellidaebe helyezte a nemzetséget, de Pussard és Pons 1976-ban a Leptomyxida tagjaival mutattak ki nagyobb hasonlóságot lapokká való terjedésre való képessége és rögzítő fonalak alkotására való hajlama miatt, így a Rhizamoebát a Leptomyxidae tagjaként sorolták be. Page 1976-ban hasonló eredménye alapján sorolta be a Leptomyxa flabellatát és a „Ripidomyxa australiensis”t.

Morfológia

Általában mozgása során megjelenő morfológiájukkal jellemzik, mely általában monopodiális (egy állábú), csigaszerű és legyezőszerű alak közt váltakozó. Általában 1 magja van, amikor több van, 50-nél kevesebb van. Farokszerkezete mindig van, a R. saxonica membránja alatt több kolloszóma van.

Életmód

Algivor: Thalassiosira- és Odontella-fajokat eszik.

Életciklus

Axiális sejtplazma-áramlású csőszerű és szabálytalan sejtplazma-áramlású lapos sejt közt váltakozhat.

Általában egymagvú, de például egy R. polyura-kultúrában megfigyeltek 2, 3, 4 és 16 magvú sejtet is.

Rendszertan

A nemzetség korábban parafiletikus volt, így 2 faját áthelyezték a Leptomyxába, ezek a Leptomyxa australiensis (korábban R. australiensis) és a Leptomyxa neglecta (korábban R. neglecta). Így 3 igazolt Rhizamoeba-faj van:

Más lehetséges fajai a közölt adatok hiánya vagy rossz dokumentáció miatt nomen dubiumként vannak besorolva, például ilyen a Rhizamoeba schnepfii Kühn 1996/1997 (nomen dubium, mert nem szerepel kultúragyűjteményben), a Trichamoeba caerulea Schaeffer 1926 és a Trichamoeba clava Schaeffer 1926 (mindkettő a Rhizamoebába került át 1980-ban, de rosszul dokumentált), az Amoeba clavarioides Penard 1902 (fénymikroszkóppal R. clavarioidesként azonosítva)), a Polychaos timidum Bovee 1972 (fénymikroszkóppal R. timidumként azonosítva) stb.

A Polychaos timidum Bovee 1972 feltehetően a Rhizamoeba faja lehet.

Genetika

A R. saxonica 3 integrin-β-paralóggal rendelkezik, genomja az integrinmediált adhéziós komplex majdnem egészét kódolja.

Evolúció

Proterozoikumi fosszíliák alapján az Arcellinida és a Rhizamoeba mintegy 1 milliárd, míg a megbízhatóbb fanerozoikumiakra korlátozott kutatások szerint 600 millió évvel ezelőtt váltak el. Molekuláris óra alapján több mint 1,1 milliárd évvel ezelőtt válhattak a csoportok el.

Jegyzetek

  1. 1 2 3 4 5 Smirnov A, Nassonova E, Geisen S, Bonkowski M, Kudryavtsev A, Berney C, Glotova A, Bondarenko N, Dyková I, Mrva M, Fabrni J, Pawlowski J (2017). "Phylogeny and systematics of leptomyxid amoebae (Amoebozoa, Tubulinea, Leptomyxida)". Protist. 168 (2): 220–252. doi:10.1016/j.protis.2016.10.006. ISSN 1434-4610. PMID 28343121.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  2. ↑ Tekle YI, Grant J, Anderson OR; et al. (2008. április). "Phylogenetic placement of diverse amoebae inferred from multigene analyses and assessment of clade stability within 'Amoebozoa' upon removal of varying rate classes of SSU-rDNA". Mol Phylogenet Evol. 47 (1): 339–352. doi:10.1016/j.ympev.2007.11.015. PMID 18180171. {{cite journal}}: Explicit use of et al. in: |author= (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  3. 1 2 3 4 Smirnov AV, Nassonova ES, Cavalier-Smith T (2007. október 1.). "Correct identification of species makes the amoebozoan rRNA tree congruent with morphology for the order Leptomyxida Page 1987; with description of Acramoeba dendroida n. g., n. sp., originally misidentified as 'Gephyramoeba sp.'". Eur J Protistol. 44 (1): 35–44. doi:10.1016/j.ejop.2007.08.001. PMID 17905574.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  4. 1 2 3 Kulishkin NS, Surkova AA, Mesentsev YS, Smirnov AV, Mazei YA (2022. március 11.). "Morphology and phylogeny of Leptomyxa regia n. sp., isolated from an artificial pond in Izmailovo Park (Moscow, Russia)" (PDF). Protistology. 16 (1): 42–51. doi:10.21685/1680-0826-2022-16-1-5.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  5. 1 2 Kulishkin NS, Smirnov AV (2024. március 23.). "New data on Leptomyxa neglecta (Amoebozoa, Tubulinea, Leptomyxida)" (PDF). Protistology. 18 (1): 40–51. doi:10.21685/1680-0826-2024-18-1-4.
  6. ↑ Dyková I, Fiala I, Pecková H, Dvořáková H (2008. december 1.). "Phylogeny of Flabellulidae (Amoebozoa: Leptomyxida) inferred from SSU rDNA sequences of the type strain of Flabellula citata Schaeffer, 1926 and newly isolated strains of marine amoebae" (PDF). Folia Parasitol. 55: 256–264. doi:10.14411/fp.2008.033. Hozzáférés: 2024. november 9.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  7. ↑ Cavalier-Smith T, Chao EE, Lewis R (2016. március 18.). "187-gene phylogeny of protozoan phylum Amoebozoa reveals a new class (Cutosea) of deep-branching, ultrastructurally unique, enveloped marine Lobosa and clarifies amoeba evolution". Mol Phylogenet Evol. 99: 275–296. PMID 27001604.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  8. ↑ Adl SM, Simpson AG, Lane CE, Lukeš J, Bass D, Bowser SS, Brown MW, Burki F, Dunthorn M, Hampl V, Heiss A, Hoppenrath M, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, McManus H, Mitchell EA, Mozley-Stanridge SE, Parfrey LW, Pawlowski J, Rueckert S, Shadwick L, Shadwick L, Schoch CL, Smirnov A, Spiegel FW (2012. szeptember). "The revised classification of eukaryotes". J Eukaryot Microbiol. 59 (5): 429–493. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872. PMID 23020233.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  9. ↑ Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, Del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019. január 19.). "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". J Eukaryot Microbiol. 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006. PMID 30257078.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  10. ↑ Yu F, Luo W, Xie W, Li Y, Meng S, Kan J, Ye X, Peng T, Wang H, Huang T, Hu Z (2022. augusztus 15.). "Community reassemblies of eukaryotes, prokaryotes, and viruses in the hexabromocyclododecanes-contaminated microcosms". J Hazard Mater. 436 (129159). doi:10.1016/j.jhazmat.2022.129159. PMID 35643009.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  11. ↑ Kang S, Tice AK, Spiegel FW, Silberman JD, Pánek T, Čepička I, Kostka M, Kosakyan A, Alcăntara DMC, Roger AJ, Shadwick LL, Smirnov A, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Brown MW (2017. szeptember). "Between a pod and a hard test: The deep evolution of amoebae". Mol Biol Evol. 34 (9): 2258–2270. doi:10.1093/molbev/msx162. PMC 5850466. PMID 28505375.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  12. ↑ Demin S, Berdieva M, Goodkov A (2021. március 10.). "Cell-cell fusions and cell-in-cell phenomena in healthy cells and cancer: Lessons from protists and invertebrates". Semin Cancer Biol. 81: 96–105. doi:10.1016/j.semcancer.2021.03.005. PMID 33713795.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  13. ↑ Siemensma FJ (1980). "Amoeben". Natura. 77: 62–72.
  14. ↑ Siemensma, Ferry J. (2021. január 31.). "Rhizamoeba clavarioides". Microworld, world of amoeboid organisms. Hozzáférés: 2022. július 31.
  15. ↑ Siemensma, Ferry J. (2021. január 31.). "Rhizamoeba timidum". Microworld, world of amoeboid organisms. Hozzáférés: 2022. július 31.
  16. ↑ Kamyshatskaya O, Bondarenko N, Nassonova E, Smirnov A (2020. november 19.). "Polychaos centronucleolus n. sp. – a new terrestrial species of the genus Polychaos (Amoebozoa, Tubulinea) with nontypical nuclear structure". Eur J Protistol. 77 (125759). doi:10.1016/j.ejop.2020.125759. PMID 33348278.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  17. ↑ Kang S, Tice AK, Stairs CW, Jones RE, Lahr DJG, Brown MW (2021. július 26.). "The integrin-mediated adhesive complex in the ancestor of animals, fungi, and amoebae". Curr Biol. 31 (14): 3073–3085.e3. doi:10.1016/j.cub.2021.04.076. PMID 34077702. Hozzáférés: 2024. november 9.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  18. ↑ Fiz-Palacios O, Leander BS, Heger TJ (2014. április 24.). "Old lineages in a new ecosystem: diversification of arcellinid amoebae (Amoebozoa) and peatland mosses". PLoS One. 9 (4). doi:10.1371/journal.pone.0095238. PMC 3999201. PMID 24762929. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a Rhizamoeba című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

További információk