Klubcsapatokban
Varju Benedek labdarúgó pályafutását az Abda SC csapatában kezdte, majd onnan került a Győri ETO akadémiájára. 2017-ben leigazolta az MTK Budapest akadémiája, a Sándor Károly Labdarúgó Akadémia. Abban az évben nem csak az utánpótlás csapatokban játszott, hanem az NBIII-ban szereplő MTK Budapest II-ben, és bemutatkozott az akkor másodosztályú első csapatban is, a Kazincbarcika elleni hazai találkozón Schäfer cseréjeként állt be. A 2018–2019-es szezonban az U19-es együttes alapembere volt és bekerült a felnőtt keretbe is. Az NBI 19. fordulójában kezdőként lépett pályára Pakson, majd további 10 mérkőzésen a kispadra nevezte az akkori vezetőedző, Feczkó Tamás. A következő szezont az NBII-ben kezdte meg az MTK, ott már fontos játékos volt. A csapat feljutott a koronavírus-járvány miatt félbeszakított másodosztályból, Varju pedig maradt a keret tagja. A Dorogi FC-vel kötött kooperációs szerződésnek köszönhetően több fiatal játékostársával együtt szerepelhet a másodosztályú Dorogban és az első osztályú MTK-ban. A 2020–2021-es szezont az NBII-es csapatnál kezdte, és az ott lejátszott két mérkőzés után újra a fővárosi együttes keretében számítanak rá.
