Gli Alligatorinae comprendono una delle due sottofamiglie della famigliaAlligatoridae. Questa sottofamiglia comprende dieci generi, di cui nove sono generi estinti, ma solo un genere è ancora esistente, le cui specie sono note come alligatori.
Alligatorinae è definito cladisticamente come Alligator mississippiensis, l'alligatore americano, e tutte le specie più vicine ad esso che a Caiman crocodylus, il caimano dagli occhiali. Questa è una definizione basata sul ceppo per Alligatorinae e significa che include antenati estinti di alligatori più basali che sono più strettamente imparentati con gli alligatori viventi che con i caimani.
Il cladogramma sottostante mostra la filogenesi degli Alligatorinae.
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