Il suo libro Pasolini contro Calvino (1998) suscitò un acceso dibattito sulle pagine culturali.
Con Il tradimento dei critici (2002) ha denunciato le "ideologie terminali" che, secondo l'autrice, hanno paralizzato la critica e il pensiero critico contemporaneo, ritraendo diverse tipologie di critici "mediatori". Anche dalla pubblicazione di questo saggio sono sorte polemiche, sfociate anche in una querela per diffamazione da parte di Walter Pedullà, ex presidente della Rai, chiamato in causa in un capitolo del libro che racconta e analizza le dichiarazioni pubbliche di molti intellettuali italiani nei confronti delle dimissioni di Mario Martone dalla direzione del Teatro di Roma. Il Tribunale di Torino respinse la richiesta di Pedullà avendo la Benedetti esercitato "il diritto di critica".
Il suo libro, Disumane lettere (2011), lancia una sfida alla cultura umanistica, in quegli anni ancora cieca alla crisi ambientale e all'emergenza più grande che l'umanità abbia mai conosciuto in tutta la sua storia: «I saperi umanistici, che per secoli hanno avuto come idea guida 'l’uomo come fine', si trovano ora per la prima volta a dover considerare anche l’eventualità di una fine dell’uomo . E già questo provoca un cambiamento vertiginoso della prospettiva con cui siamo soliti guardare alla cosiddetta cultura. È come se lo sfondo si aprisse di colpo ... trasportando ogni cosa in una dimensione di rischio e di azzardo sconosciuta alla Modernità». Nel suo libro successivo, La letteratura ci salverà dall'estinzione (2021), approfondisce l'argomento, proponendo una visione della letteratura come mezzo potente per provocare una metamorfosi dei modi di pensare che hanno provocato il danno.
È stata tra i fondatori di "Nazione Indiana" e della rivista on line e su carta "Il primo amore". Ha tenuto la rubrica "Il romanzo" sul settimanale l'Espresso. Collabora al quotidiano "Domani".
La soggettività nel racconto. Proust e Svevo, Napoli, Liguori, 1984, ISBN 88-207-1370-5.
Rino Genovese, Carla Benedetti, Paolo Garbolino, Modi di attribuzione. Filosofia e teoria dei sistemi, a cura di Rino Genovese, Napoli, Liguori, 1989, ISBN 88-207-1822-7.
Come comunichiamo sul mondo, in Figure del paradosso. Filosofia e teoria dei sistemi, vol. 2, a cura di Rino Genovese, Napoli, Liguori, 1992.
A partire da Petrolio. Pasolini interroga la letteratura, a cura di Carla Benedetti e Maria Antonietta Grignani, Ravenna, Longo, 1995, ISBN 88-8063-029-6.
L'ombra lunga dell'autore. Indagine su una figura cancellata, Milano, Feltrinelli, 1999, ISBN 88-07-10275-7. (trad. inglese, The Empty Gage: Inquiry Into The Mysterious Disappearance Of The Author, Cornell University Press, 2005, ISBN 0801441455).
Il tradimento dei critici, Torino, Bollati Boringhieri, 2002, ISBN 88-339-1399-6.
Il revival della modernità, in Fredric Jameson, Una modernità singolare. Saggio sull'ontologia del presente, introduzione di Carla Benedetti, Firenze, Sansoni, 2003, ISBN 88-383-4804-9.
Gadda e il pensiero della complessità, in Gadda. Meditazione e racconto, a cura di Carla Benedetti, Cristina Savettieri, Lucio Lugnani, Pisa, ETS, 2004, ISBN 88-467-1061-4.
Giuseppe Bartolini. Bestiario. Dipinti 1999-2006, testi di Carla Benedetti, Guido Mazzoni, Bergamo, Lubrina, 2006, ISBN 978-88-7766-324-5.
Dopo la fine del mondo. Pier Paolo Pasolini e Alce Nero, in Apocalisse. Modernità e fine del mondo, a cura di Neil Novello, Napoli, Liguori, 2008.
La visione. Conversazione con Carla Benedetti, di Antonio Moresco, Libri Scheiwiller, 2009 ISBN 978-88-7644-600-9.
Disumane lettere. Indagini sulla cultura della nostra epoca, Roma-Bari, Laterza, 2011. ISBN 978-88-420-9542-2.
Carla Benedetti e Giovanni Giovannetti, Frocio e basta. Pasolini, Cefis, Petrolio, Milano, Effigie, 2016 (1ª ed. 2012), ISBN978-88-97648-64-2.
Carla Benedetti e Maurizio Bettini, Oracoli che sbagliano. Un dialogo sugli antichi e sui moderni, Milano, Effigie, 2016, ISBN978-88-97648-49-9.
La letteratura ci salverà dall'estinzione, Torino, Einaudi, 2021, ISBN 978-88-06-24827-7.
Pasolini contro Calvino. Per una letteratura impura, Torino, Bollati Boringhieri, 2022 (1ª ed. 1998), ISBN 978-88-339-4126-4.
Carla Benedetti, Alessandro Fiorillo, Pasolini. Un pensiero incarnato, Milano, Solferino 2025, ISBN 978-88-282-1802-9
↑Il regista Mario Martone si dimise da direttore del Teatro di Roma il 3 novembre 2000 con una lettera pubblica di denuncia, che uscì su "la Repubblica". Walter Pedullà, che era allora presidente del Consiglio di Amministrazione del teatro, dichiarò in un'intervista al "Corriere" che Martone aveva causato al teatro grosse perdite economiche. Poco dopo però i giornali riportarono la notizia che il bilancio del teatro era in pareggio. La Benedetti in un passo del libro si chiede come mai il Presidente del teatro avesse fatto quella dichiarazione non veritiera, "lasciando intendere il falso all'opinione pubblica".