Il processo di Sebastopoli fu tenuto in uno dei tribunali pubblici sovietici del dopoguerra, contro alcuni militari stranieri accusati di aver commesso dei crimini di guerra durante la seconda guerra mondiale. Furono processati 12 prigionieri di guerra tedeschi tra cui il generale Erwin Jaenecke, che in precedenza prestarono servizio nell'11a e nel 17ª armata tedesca.
Tutti i 12 imputati furono accusati di aver commesso crimini di guerra nel territorio della Crimea, in più per 4 imputati scattò la stessa accusa per il territorio di Krasnodar, per 2 imputati in Ucraina, per 2 imputati nella regione di Rostov, per 2 imputati nel Caucaso settentrionale e per 1 imputato in Moldavia. Per tutti i 12 imputati, l'accusa comprendeva: l'omicidio di civili, la distruzione dei villaggi e degli insediamenti durante la ritirata con il pretesto di combattere la resistenza, la deportazione della popolazione nei campi per i lavori forzati in Germania, l'omicidio dei prigionieri di guerra sovietici, il prelievo di sangue dai bambini sovietici per le trasfusioni sugli ufficiali tedeschi.
Tutti i prigionieri furono giudicati colpevoli: 8 persone furono condannate a 25 anni di lavori forzati e 4 persone furono condannate a 20 anni di lavori forzati. Nel 1955 furono ristabilite le relazioni diplomatiche tra l'URSS e l'allora Germania Ovest, e nel 1956, i detenuti sopravvissuti furono rimpatriati e quindi, di fatto, furono rilasciati.
Sui giornali sovietici del 1947, il processo fu chiamato:"Il processo nel caso delle atrocità degli invasori nazisti in Crimea e nel Kuban". Nel verdetto, il processo è chiamato in modo diverso: "Sulle atrocità degli invasori fascisti tedeschi sul territorio della regione di Crimea e nel Kuban'". In un articolo dei professori E. V. Volkov e I. V. Sibirjakov, venne utilizzato il nome "processo di Sebastopoli".

Tra l'ottobre ed il novembre 1941, l'intera Crimea ad eccezione di Sebastopoli fu occupata dalle truppe naziste tedesco-rumene; nel 1942, una parte della Crimea fu liberata dalle truppe sovietiche; nel maggio 1942, le truppe naziste occuparono nuovamente la penisola di Kerč' e nel luglio 1942 presero Sebastopoli. Alla fine del 1943 una parte della penisola di Crimea fu liberata nuovamente, nel maggio 1944 la regione fu completamente liberata.
L'occupazione del territorio di Krasnodar iniziò tra l'agosto e settembre 1942. All'inizio di ottobre 1943, con la liberazione della penisola di Taman', il territorio di Krasnodar fu completamente liberato.
Durante l'occupazione, la Crimea fu gravemente danneggiata, durante il processo l'accusa riferì:
Dopo la guerra, molte persone coinvolte in questi crimini furono catturate dall'Unione Sovietica. In particolare, il generale Erwin Jaenecke "cercò di fuggire nella zona di occupazione americana in Germania con documenti falsi", sotto il falso nome del tesoriere Anton Gerdes, ma fu trattenuto dalle autorità sovietiche a Freiberg l'11 giugno 1945.

Tra il 1945 ed il 1946, si tennero alcuni processi pubblici contro i prigionieri di guerra accusati di crimini di guerra in varie città dell'URSS. In uno di questi processi, a Mykolaïv, furono presi in esame alcuni dei crimini commessi in Crimea: ad esempio il caso di Robert Berg, sergente maggiore della gendarmeria da campo, che partecipò a torture ed esecuzioni a Sinferopoli (esecuzione di 11 prigionieri di guerra), a Bachčisaraj e Sebastopoli (esecuzione di 18 persone, compresi i bambini).
Il 18 maggio 1947, il ministro degli Interni Kruglov presentò al vicepresidente del Consiglio dei ministri dell'URSS Molotov una bozza di decreto governativo sullo svolgimento dei processi pubblici in nove città: Sebastopoli, Chișinău, Černihiv, Vicebsk, Babrujsk, Stalino (l'attuale Donec'k), Poltava, Homel' e Velikij Novgorod, prevedendo tra l'altro di giudicare anche coloro che si fossero dichiarati non colpevoli.
Nel settembre 1947, Kruglov e il viceministro degli Esteri Vyšinskij, in una lettera a Stalin, indicarono che i dipendenti del Ministero degli Interni avevano raccolto il materiale necessario per il processo contro 136 criminali di guerra, tra cui 19 generali, 68 ufficiali e 49 soldati. A questo proposito, Kruglov e Vyšinskij proposero una commissione interdipartimentale per l'organizzazione dei processi con la seguente composizione:
Il 10 settembre 1947, il Consiglio dei Ministri dell'URSS adottò la risoluzione sull'organizzazione dei processi aperti nelle nove città indicate.

La raccolta delle informazioni sui crimini di guerra in Crimea iniziò immediatamente dopo la liberazione: furono istituite delle commissioni, come anche in altri territori liberati dell'URSS, con il compito di raccogliere il materiale ed intervistare i testimoni oculari. In particolare, la commissione di Sebastopoli comprese il primo e il terzo segretario del comitato del partito, Pavel Lesik e Antonina Sarina, il presidente del comitato esecutivo della città Vasilij Efremov, e il professor Georgij Slavskij. La commissione ordinò di scavare nei siti noti delle esecuzioni dei prigionieri di guerra a nord di Sebastopoli, nell'area dell'autostrada Balaklava e nel burrone di Jucharina, complessivamente nei 190 siti investigati furono trovati 2.020 cadaveri.
Le investigazioni nei confronti dei prigionieri di guerra furono condotte per più di un anno, come risulta dalla sequenza degli arresti e dei successivi verdetti del processo:
L'indagine fu condotta in diverse regioni dell'URSS. Nel documento del 16 maggio 1947, firmato da T. Filippov e dal suo vice A. Z. Kobulov "sul caso dei carnefici fascisti trovati ad aver commesso delle atrocità contro cittadini sovietici, durante il periodo di occupazione della Crimea e del Kuban'”, fu annotato che furono "processati" 18 prigionieri di guerra e che il caso sarebbe stato esaminato in un tribunale aperto al pubblico.
Lo stesso documento afferma che le indagini a carico di 14 imputati furono già completate:
Il documento affermava che 17 accusati su 18, ad eccezione di Willert, ammisero la propria colpevolezza. Willert ammise parzialmente la sua colpa:
Secondo i suoi ordini, i beni materiali delle imprese industriali e delle istituzioni mediche nella città di Jevpatorija furono saccheggiati ed in parte distrutti.
Willert si è dichiarato colpevole solo per il fatto di essere stato coinvolto nella distruzione dei beni e di aver partecipato alla deportazione della popolazione sovietica nei campi di lavoro in Germania, tuttavia, è pienamente esposto dalla testimonianza dei prigionieri di guerra von Lesten e Kisling, nonché dall'atto della Commissione repubblicana di Crimea del 5 febbraio 1945, che Willert era responsabile delle atrocità commesse dagli invasori tedeschi in Evpatoria.»
Nello stesso documento, fu riportato anche che Jaenecke ammise pienamente la colpevolezza dei crimini a lui imputati. Tutti gli accusati commisero dei crimini in Crimea, solo nei confronti di Kinne il documento non chiarisce la colpevolezza dei suoi crimini.
Alcuni degli accusati furono anche accusati dei crimini commessi in altri territori dell'URSS:
Il 19 ottobre 1947, il giornale "Gloria di Sebastopoli" pubblicò un messaggio dell'Ufficio del procuratore dell'URSS sull'imminente processo nel quale fu annunciato il procedimento contro l'ex comandante della 17ª armata tedesca Erwin Jaenecke, e contro diversi ufficiali, in qualità di "organizzatori delle atrocità dirette contro la popolazione civile". Dopo 10 giorni, i 20 volumi dell'indagine furono consegnati a Sebastopoli, dove gli imputati furono rinchiusi nel carcere cittadino.
Tra la fine di ottobre e l'inizio di novembre 1947, le investigazioni continuarono in Crimea. Altri collaborazionisti sovietici testimoniarono sulle attività degli accusati, come ad esempio M. Kljuev, un lavoratore ausiliario dell'Ortskomandatur di Jevpatorija, il 20 ottobre 1947, e M. Kamenskaja, un'altra lavoratrice, il 13 ottobre 1947. Il 17 ottobre 1947 testimoniò N. F. Sulima, l'ex sindaco di Eupatoria, condannato a 10 anni di carcere. Allo stesso tempo, Sulima citò con precisione le azioni specifiche degli occupanti, preferendo però di riferire un quadro generale delle loro attività. L'11 gennaio 1942, il quotidiano "Vedomosti" di Eupatoria pubblicò che circa 2000 persone furono fucilate con l'arrivo in città dei nazisti. Durante l'interrogatorio, Sulima dichiarò di aver appreso dell'esecuzione, per la prima volta, dal comandante di Eupatoria solo nella primavera o nell'estate del 1942 e che furono uccise 1500 persone. Il 20 ottobre 1947 fu interrogata V. Skripka, impiegata contabile dal giugno 1942, che raccontò dell'invio dei treni di cittadini sovietici da Eupatoria nel periodo 1942-1943.
Il 24 ottobre 1947, P. Keibel durante l'interrogatorio cercò di nascondere l'entità dei crimini negando l'uso della tortura contro i prigionieri, inoltre affermò che per quasi due anni la polizia e le SS a Eupatoria arrestarono circa 500 cittadini sovietici, la maggior parte dei quali fu sottoposta a non più di 14 giorni di fermo. Durante un confronto tra Willert e Keibel, il 1º novembre 1947, i dettagli del piano per distruggere l'economia di Eupatoria divennero chiari: in una riunione alla fine del 1943, "Il maggiore Willert lesse l'ordine segreto dell'ufficio del comandante No. 751", emesso sulla base dell'ordine del comandante in capo delle truppe in Crimea. Secondo tale ordine, "in caso di evacuazione di Eupatoria", l'Ortskomandant fu responsabile "di portare a termine la distruzione dei punti strategici militari, come caserme, fortificazioni militari, centrali elettriche, depositi di grano, ferrovie e altri ponti e impianti industriali". In questo incontro, oltre Willert partecipò anche Paul Keibel: tale ordine fu eseguito dall'11 al 12 aprile 1944.
Il 4 novembre 1947, il sergente maggiore Willy Schweigofer, testimoniò sulle esecuzioni del gennaio 1942, sugli incessanti arresti e sui rastrellamenti regolari avvenuti a Jevpatorija con una frequenza di 1-2 volte a settimana. Come risultato di questi raid, alcuni dei detenuti furono fucilati immediatamente mentre i restanti furono deportati in Germania. Il primo treno (con circa 1500 persone) partì verso Klagenfurt nel giugno 1942, il secondo treno (con circa 1500 persone) partì nell'agosto, il terzo (con circa 1000 persone) partì nel settembre 1942. Schweigofer dichiarò:
L'8 novembre 1947, il procuratore militare della flotta del Mar Nero Kamynin, firmò l'atto d'accusa contro i 12 imputati, approvato nello stesso giorno dal procuratore militare e capo delle forze armate dell'URSS Nikolai Afanasyev. L'accusa non includeva 7 delle 11 persone dell'indagine, indicate nel documento della Direzione generale per i prigionieri di guerra e gli internati del 16 maggio 1947 e cioè Pedal, Gaker, Eckhoff, Otseker, Gazeneder e Dikgaf. Tra i 12 imputati sono stati inclusi 4 imputati (Flesner, Brown, Gusemann e Lineberg) dell'indagine. Nell'atto d'accusa furono accusati solo della decimazione della popolazione sovietica nascosta nelle cave di Adžimuškaj, mentre l'episodio delle esecuzioni nelle vicinanze di Kerč' non fu loro imputato. Inoltre, l'accusa includeva Schreve, assente nel documento datato 16 maggio 1947.
Il caso fu esaminato dal tribunale militare della flotta del Mar Nero, ed era composto da:
L'accusa fu sostenuta dal procuratore militare della flotta del Mar Nero, il maggiore generale D. G. Kamynin e dal tenente colonnello Markelov. Tutti gli imputati furono processati ai sensi dell'articolo 1 del decreto del Presidium del Soviet Supremo dell'URSS del 19 aprile 1943.

Le accuse specifiche erano le seguenti:
Secondo il verdetto i 12 imputati furono di nazionalità tedesca. 10 imputati su 12 nacquero in Germania, Willert nacque in territorio cecoslovacco, che al momento della sua nascita fu parte dell'Impero austro-ungarico. La città natale di Willert, Nový Jičín, indicata come "Neititstein" nel verdetto, secondo l'accordo di Monaco del 1938 passò alla Germania. Radatus nacque a Riga, che a quel tempo era parte dell'Impero russo.
Il verdetto indicò anche l'appartenenza alle organizzazioni naziste: 6 imputati furono membri del NSDAP (Willert, Alberti, Keibel, Hahn, Schreve e Radatus) mentre 2 imputati furono membri della gioventù hitleriana (Brown e Guseman).
Dei 12 imputati, alcuni furono accusati di aver commesso altri crimini al di fuori della Crimea: 4 imputati (Jaenecke, Willert, Alberti, Kinne) commisero crimini nel Kuban'; 2 imputati (Kinne e Hahn) commisero crimini nel Caucaso settentrionale; 2 imputati (Kinne e Hahn) commisero crimini sul territorio ucraino; 2 imputati (Kinne e Alberti) commisero crimini nella regione di Rostov; 1 imputato (Kinne) commise un reato nel territorio della Moldova.
Tre imputati furono inoltre accusati dell'Olocausto: Alberti ordinò lo sterminio di massa degli ebrei di Taganrog e Novorossijsk; Schreve fu coinvolto nello sterminio di massa degli ebrei di Sebastopoli dopo la presa della città nell'estate del 1942; Hahn diresse gli arresti e le esecuzioni degli ebrei a Nal'čik e Huljajpole, trattandoli alla pari degli attivisti sovietici.
Come prove delle accuse contro gli imputati furono utilizzate:
In totale, al processo parteciparono 42 testimoni, incluso il sacerdote della chiesa di Alušta P. A. Kljagin.
Gli imputati seguirono diverse linee di difesa: per Erwin Jaenecke la non ammissione di colpa in riferimento alle condizioni di guerra; per Adam Hahn ed Ernst Schreve, l'ammissione parziale di colpa.
Erwin Jaenecke affermò che tra i 300000 suoi subordinati potessero esserci dei singoli criminali, ma questa affermazione "è ridicola quanto accusare il consiglio comunale di Sebastopoli dei crimini commessi dai residenti che vivono sul suo territorio". Jaenecke giustificò le sue azioni con le azioni di guerra e affermò che le testimonianze e le accuse contro di lui erano state inventate. Otto Willert negò le accuse di saccheggio delle proprietà dei residenti di Novorossijsk inviati in Germania: "Non abbiamo derubato, abbiamo confiscato". Paul Keibel cercò di scaricare la colpa sul suo comandante Jaenecke, affermò che il piano per la distruzione di Eupatoria fu sviluppato su ordine personale di Jaenecke.
Gli imputati furono difesi dagli avvocati sovietici Ljubimov, Tatarincev, Vvedenskij, Grinev, Erofanov, Micheev. L'avvocato N. A. Micheev nel dicembre 1947 parteciperà come difensore anche nel processo di Novgorod.
Il processo di Sebastopoli si svolse nella Camera degli ufficiali della flotta del Mar Nero. Nel foyer fu organizzata una mostra fotografica con tre pannelli di documenti fotografici e diagrammi: le foto mostrarono le rovine di Sebastopoli, Kerč', Novorossijsk, i cadaveri dei cittadini sovietici fucilati, torturati, bruciati e sepolti.
Il 21 novembre 1947, all'udienza del tribunale parlò il procuratore militare D. G. Kamynin, che chiese la pena di morte per tutti gli imputati o 25 anni di reclusione nei campi di lavoro forzato.
Il 23 novembre 1947 la corte emise la sentenza:
Per la sentenza fu previsto il diritto di appello:
Il verdetto fu impugnato, il 20 marzo 1948 il Collegio Militare della Corte Suprema dell'URSS confermò il verdetto. Il 13 luglio 1947, su una copia del verdetto, attualmente conservata negli archivi della città di Sebastopoli, fu annotato:
Nel settembre 1955 l'URSS riconobbe la RFT, e il cancelliere Adenauer a Mosca accettò l'instaurazione di relazioni diplomatiche insieme al rilascio di 10000 prigionieri di guerra tedeschi (sebbene Nikita Chruščëv avesse affermato in precedenza che non ci fosse un solo prigioniero di guerra in URSS). Nel 1955-1956, i detenuti sopravvissuti al processo di Sebastopoli furono rimpatriati in Germania.

Il processo di Sebastopoli fu seguito dai giornali sovietici: per il Soviet centrale furono le testate Izvestija e Krasnaja Zvezda; in Crimea le testate "Bandiera della Patria", "Gloria di Sebastopoli". Due rapporti di Izvestija, pubblicati il 16 e 21 novembre 1947, furono trasmessi da Sebastopoli per telefono dal corrispondente Leonid Kudrevatych.
I giornali pubblicarono le lettere dei cittadini sovietici dove furono chieste severe punizioni per gli imputati. Come in altri casi di questo tipo, i giornalisti sovietici usarono degli epiteti dispregiativi nei confronti degli imputati. Così, il corrispondente di Izvestija Leonid Kudrevatych usò i seguenti epiteti: "Dodici belve a due zampe", "gangster tedeschi", "sadici", "capi banditi", "barbari".
In uno dei suoi rapporti, Kudrevatych sottolineò che gli imputati commisero dei crimini non solo in URSS, ma anche in Europa:
- Perché hai fatto uccidere undici polacchi a Cracovia? - ha chiesto Keibel al processo.
- Fisicamente, non erano perfetti. - risponde l'aguzzino fascista.»
Dopo il processo di Sebastopoli, l'identificazione e la condanna delle persone accusate dei crimini di guerra in Crimea proseguirono sia in URSS che all'estero.

Il caso di Erich von Manstein fu esaminato dal tribunale militare britannico di Amburgo. Nel corso di questo processo, furono rivelati i dettagli delle esecuzioni di massa dei residenti a Eupatoria nel gennaio 1942. Per questi eventi, Erich von Manstein fu condannato a 18 anni di carcere nel dicembre 1949, rilasciato poi nel 1953 per motivi di salute, morì nel 1973.
Dopo il processo di Sebastopoli, i processi ai criminali di guerra continuarono tra i collaborazionisti sovietici. Negli anni successivi, in Crimea furono trovate delle altre fosse comuni precedentemente sconosciute di altre vittime: tali scoperte portarono all'avvio di nuove azioni investigative. Nel 1970, durante i lavori di scavo dell'autostrada Sinferopoli-Mykolaïvka, furono ritrovati altri luoghi precedentemente sconosciuti di esecuzioni di massa di cittadini sovietici durante l'occupazione della Crimea: in totale 28 pozzi da cui furono recuperati i resti di 1480 vittime. Fu condotta un'indagine che portò ad identificare tre gruppi di persone coinvolte nei reati. Proprio a Sinferopoli si tennero altri tre processi, nel 1972, 1974 e 1977: tutti gli imputati furono dichiarati colpevoli, la maggior parte degli imputati fu condannata a morte ed il resto a lunghe pene detentive. In particolare, Šichaj Asanov, Narsulu Menzatov e Enver Menametov furono processati nel 1974, nel processo presieduto dall'eroe dell'Unione Sovietica, il colonnello Efim Fradkov.
Nel gennaio 1942, dei fotoreporter sovietici fotografarono i corpi delle persone uccise nel fosso Bagerovskij, in quel luogo i tedeschi uccisero diverse migliaia di ebrei e diverse centinaia di altri cittadini sovietici. Secondo il documento del GUPVI del 16 maggio 1947, a Sebastopoli doveva tenersi un altro processo contro 7 prigionieri coinvolti nelle esecuzioni del dicembre 1941 a Bagerovskij. Invece, nell'atto d'accusa del processo, le esecuzioni avvenute a Bagerovskij non furono prese in considerazione e quindi i 7 prigionieri non furono a loro volta inclusi nell'elenco degli imputati del processo di Sebastopoli. Nonostante questa decisione, gli scatti del fotoreporter Dmitrij Bal'termanc presso il fossato Bagerovskij, realizzati durante la liberazione di Kerč' all'inizio del 1942, ebbero comunque risonanza mondiale.
Nel 2019, la compagnia televisiva e radiofonica statale di Sebastopoli girò un film documentario "Sevastopol Norimberga" sul processo di Sebastopoli. Regista e sceneggiatore Konstantin Kovrigin.
A partire dal 2021, sul sito web del progetto archivistico federale "Crimini dei nazisti e dei loro complici contro la popolazione civile dell'URSS durante la Grande Guerra Patriottica del 1941-1945", sono disponibili le scansioni dei documenti del processo di Sebastopoli.