Negli anni ottanta è diventato noto grazie alla partecipazione alla serie Happy Days (1977-1984). Negli anni novanta è tornato alla ribalta partecipando alla serie TV Un detective in corsia (1993-1995), con Dick Van Dyke. Ha anche recitato in numerosi film, lavorando più volte con Jodie Foster.
Dopo aver lavorato principalmente in serie televisive, come Baby Sitter e Un detective in corsia, nel 2005 Baio è stato protagonista del reality trasmesso da VH1, Scott Baio is 45... and single, che ha ottenuto un buon successo, tale da indurre la rete a produrre la seconda stagione, Scott Baio is 46... and pregnant.
Baio ha avuto come prima fidanzata proprio la collega che aveva conosciuto sul set di Happy Days, e da fidanzati poi hanno lavorato anche nello spinoff Jenny e Chachi. Alla morte di Erin Moran, Baio rilasciò una dichiarazione che fece molto discutere, e che portò l'attore a doversi scusare.
Nel 2007, poco prima della nascita della loro figlia, Baio ha sposato Renée Sloan, sua compagna già dagli anni novanta: la donna aspettava due gemelli di sesso differente, ma ha perso il maschio all'undicesima settimana di gravidanza. A Bailey, questo il nome della figlia, è stata diagnosticata una rara malattia metabolica.
Simpatizza da sempre per il Partito Repubblicano: ha partecipato ai funerali di Ronald Reagan e nel 2020 si è avvicinato alle posizioni di Donald Trump. Crede in numerose teorie del complotto e si è professato anticomunista.