23S 리보솜 RNA

리보솜의 3차원 구조. 이는 극저온 전자현미경 재구성을 기반으로 대장균의 50S 리보솜 소단위체에 있는 23S rRNA와 5S rRNA의 3차원 배열을 나타낸 것이다.

23S 리보솜 RNA(영어: 23S ribosomal RNA, 23S rRNA)는 세균 및 고세균의 리보솜의 큰 소단위체(50S 소단위체)의 2,904개의 뉴클레오타이드 길이(대장균에서)의 구성요소이며, 펩티딜기전이효소 중심(PTC)을 구성한다. 23S rRNA는 I~VI라는 6개의 2차 구조 도메인으로 나뉘며, 이에 해당하는 5S rRNA는 도메인 VII로 간주된다. 리보솜 펩티딜기전이효소의 활성은 이 rRNA의 도메인 V에 존재하는 데, 이는 번역을 저해하는 항생제의 가장 흔한 결합 부위이기도 하므로 리보솜 엔지니어링의 표적이 된다. 이 항생제 부류의 잘 알려진 구성원인 클로람페니콜은 펩타이드 결합 형성을 저해하는 방식으로 작용하며, 최근의 3차원 구조 연구에서는 리보솜의 종류에 따라 두 가지 다른 결합 부위가 있다는 것이 밝혀졌다. 펩티딜기전이효소의 활성을 갖는 23S rRNA 도메인에서의 수많은 돌연변이는 항생제 내성을 초래한다. 23S rRNA 유전자는 일반적으로 다른 rRNA에 비해 삽입 또는 결실을 포함한 서열 변이가 더 많다.

23S rRNA의 진핵생물에서의 상동체는 28S rRNA이며, 큰 소단위체에는 5.8S rRNA로 채워진 영역이 있다.

같이 보기

각주

  1. ↑ Mueller F, Sommer I, Baranov P, Matadeen R, Stoldt M, Wöhnert J, Görlach M, van Heel M, Brimacombe R (2000). “The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo-electron microscopic reconstruction at 7.5 Å resolution.”. 《J Mol Biol》 298 (1): 35–59. doi:10.1006/jmbi.2000.3635. PMID 10756104.
  2. 1 2 Walker, Allison S.; Russ, William P.; Ranganathan, Rama; Schepartz, Alanna (2020년 8월 18일). “RNA sectors and allosteric function within the ribosome” (영어). 《Proceedings of the National Academy of Sciences》 117 (33): 19879–19887. Bibcode:2020PNAS..11719879W. doi:10.1073/pnas.1909634117. ISSN 0027-8424. PMC 7443888. PMID 32747536.
  3. ↑ Zerges, William; Hauser, Charles (2009년 1월 1일), Harris, Elizabeth H.; Stern, David B.; Witman, George B. (편집), “Chapter 28 - Protein Synthesis in the Chloroplast” (영어), 《The Chlamydomonas Sourcebook (Second Edition)》 (London: Academic Press), 967–1025쪽, ISBN 978-0-12-370873-1, 2021년 10월 7일에 확인함
  4. ↑ Vester, Birte; Long, Katherine S. (2013). 《Antibiotic Resistance in Bacteria Caused by Modified Nucleosides in 23S Ribosomal RNA》 (영어). Landes Bioscience.
  5. ↑ Pei A, Nossa CW, Chokshi P, Blaser MJ, Yang L, Rosmarin DM, Pei Z (2009년 5월 5일). “Diversity of 23S rRNA Genes within Individual Prokaryotic Genomes”. 《PLOS ONE》 4 (5). Bibcode:2009PLoSO...4.5437P. doi:10.1371/journal.pone.0005437. PMC 2672173. PMID 19415112.
  6. ↑ Doris, Stephen M.; Smith, Deborah R.; Beamesderfer, Julia N.; Raphael, Benjamin J.; Nathanson, Judith A.; Gerbi, Susan A. (October 2015). “Universal and domain-specific sequences in 23S–28S ribosomal RNA identified by computational phylogenetics”. 《RNA》 21 (10): 1719–1730. doi:10.1261/rna.051144.115. PMC 4574749. PMID 26283689.

외부 링크