28S 리보솜 RNA

28S 리보솜 RNA(영어: 28S ribosomal RNA, 28S rRNA)는 진핵생물에서 세포질 리보솜의 큰 소단위체(LSU)를 구성하는 리보솜 RNA(rRNA)로, 모든 진핵세포의 기본 구성 요소 중 하나이다. 식물에서는 크기가 25S이고 포유류에서는 크기가 28S이므로 25S–28S rRNA라는 별칭이 붙어 있다.

5' 쪽에 5.8S rRNA가 결합되어 있으며, 원핵생물의 23S rRNA 및 미토콘드리아의 16S rRNA와 유사한 진핵생물의 핵 상동체이다.

계통학에서의 사용

28S rRNA를 암호화하고 있는 유전자를 28S rDNA라고 한다. 이들 유전자의 서열을 비교하는 것은 때때로 분자 분석에 사용되며, 예를 들어 원생생물, 균류, 곤충류, 거미류, 완보동물, 척추동물의 계통수를 구축하는데 사용된다.

구조

28S rRNA는 일반적으로 4000–5000 nt 길이이다.

일부 진핵생물은 28S rRNA를 두 부분으로 절단한 후 리보솜에 조립하는데, 이 현상을 "숨겨진 절단(hidden break)"이라고 한다.

데이터베이스

다음의 몇몇 데이터베이스는 비교 목적으로 LSU rRNA 서열의 정렬과 주석을 제공한다.

RDP: (리보솜 데이터베이스 프로젝트, Ribosomal Database Project)
SILVA: 리보솜 RNA 유전자 데이터베이스 프로젝트이다.

같이 보기

18S 리보솜 RNA (18S rRNA)
23S 리보솜 RNA (23S rRNA)

각주

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