Microcystine is een voor de mens zeer giftige stof die voornamelijk voorkomt in blauwalgen en kan vrijkomen bij het afsterven van deze bacteriën. De stof is genoemd naar zulke bacterie: de Microcystis aeruginosa. Maar niet alleen M. aeruginosa produceert microcystines, onder andere ook Anabaena, Planktothrix agardhii, Nostoc en nog vele anderen. Microcystines zijn een groep van cyclische heptapeptides, bestaande uit twee aminozuren die voorkomen in proteïnen en vijf andere aminozuren, totaal dus zeven (=hepta) peptiden. Voorbeelden van ingebouwde aminozuren zijn arginine (R) en leucine (L) in microcystine LR. Microcystines zijn zeer stabiel in water alsook bij hoge en lage temperaturen dankzij hun ringstructuur.
Microcystines kunnen de groei van kankers (in de lever) en andere kwalen bevorderen.