Nynke (ook wel Nienke) is van oorsprong een Friese meisjesnaam. Vandaar ook dat het oorspronkelijk met een 'Y' geschreven wordt (de ie heeft in het Fries niet dezelfde korte ie-klank als in het Nederlands, maar is een tweeklank, ongeveer zoals in "België").
De naam is een verkleiningsvorm van de Friese meisjesnaam Nine, die waarschijnlijk is afgeleid van Catharina. Catharina komt van het Griekse woord katharos dat "rein, schoon, zuiver" betekent.