Han er fagveileder ved Nasjonalt kompetansesenter for kultur, helse og omsorg, en satsing forankret i Stortingsmelding 29 (2012-2013) – Morgendagens omsorg og i Omsorgsplan 2020 .. Han er også fagveileder for Musikkbasert miljøbehandling, et kurs- og utdanningsløp utviklet på oppdrag fra Helsedirektoratet og inngår i Kompetanseløft 2020.
Myskja fullførte sin medisinutdannelse i Trondheim i 1981. Han har arbeidet som spesialist i allmennmedisin, overlege og førsteamanuensis. Senere har han tatt doktorgrad innen bruk av musikkterapi i behandling av demente, og har siden 2002 jobbet med pasienter som har Parkinsons sykdom. Han ble i 1998 tildelt Soria Moria-prisen for helseopplysningsprosjektet «Den musiske medisin». Han har også mottatt Den norske legeforenings kvalitetspris for sine prosjekter med musikkterapi innen eldreomsorgen.
Myskja har i mange år kjempet for aksept av alternative behandlingsformer, særlig gjelder dette østlig tradisjonell medisin. I januar 2010 mottok han Brobyggerprisen 2009 av foreningen Fritt Helsevalg for sin «kunnskap og erfaringer fra konvensjonell medisin og komplementær/alternativ behandling (KAM)».
Bibliografi
Blomstermedisin til vekst og helbredelse innbundet, Noras ark, 1983, ISBN 8274135466
Den musiske medisin - lyd og musikk som terapi, Cappelen, 2003, ISBN 8202231531
Med Vinnes, Bjarte: Kampen om håpet, Fagbokforlaget, 2003, ISBN 9788276747911
↑«300 på selgertreff i Ås». Ås Avis. 31. mars 2016. «Forever Living er en verdensomfattende organisasjon som i dag har bedrifter i 158 land. Det startet i USA i 1978 og kom til Skandinavia tyve år senere. I Norge var det Ås-legen Audun Myskja som først fattet interesse for helsemessige virkningen av Aloe vera, og begynte å anbefale produktene.»