Mutasjon E484K

E484K er en missense-mutasjon av SARS-CoV-2 som forekommer i en rekke av de varianter av viruset som har komplisert kampen mot covid-19 særlig i 2021.

Navnet på mutasjonen, E484K, viser til en utskiftning der glutaminsyre (E) erstattes av lysin (K) i posisjon 484. Den har fått økenavnet «Eeek».

E484K er blitt beskrevet som en escape-mutasjon (det vil si en mutasjon som forbedrer virutsets evne til å unnslippe vertens immunsystem) fra i det minste én form av de monoklonale antistoffer mot SARS-CoV-2, noe som indikere at det kan dreie seg om en «mulig forandring i dens antigenisitet». Lineage P.1 beskrevet i Japan, og i Manaus i Brasil, Lineage P.2 også kjent som Lineage B.1.1.248 og 501.V2 (Sør-Afrika) har alle denne mutasjonen. Et avgrenset antall av Lineage B.1.1.7-genomer med E484K-mutasjon er også blitt detektert. Monoklonale og serum-deriverte antistoffer er blitt rapportert å være fra 10 til 60 ganger mindre effektive til å nøytralisere virus med E484K-mutasjon. Den 2. februar 2021 rapporterte forskere i Storbritannia E484K i 11 funn (av 214.000 granskede funn), en mutasjon som kanskje kan kompromittere effektiviteten av de til da benyttede vaksiner.

Referanser

  1. ↑ Greenwood, Michael (15. januar 2021). «"What Mutations of SARS-CoV-2 are Causing Concern?"]». News Medical Lifesciences. Besøkt 16. januar 2021.
  2. ↑ Mandavilli, Apoorva; Mueller, Benjamin (2. mars 2021). «Why Virus Variants Have Such Weird Names». The New York Times. ISSN 0362-4331. Besøkt 2. mars 2021.
  3. ↑ «escape mutation». HIV i-Base. 11. oktober 2012. Besøkt 19. februar 2021.
  4. ↑ Wise, Jacqui (5. februar 2021). «Covid-19: The E484K mutation and the risks it poses». The BMJ. 372: n359. PMID 33547053. doi:10.1136/bmj.n359.
  5. 1 2 «Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil» (PDF) (pressemelding). Japan: NIID (National Institute of Infectious Diseases). 12. januar 2021. Arkivert fra originalen (PDF) 15. januar 2021. Besøkt 18. mars 2021.
  6. ↑ «Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings». Virological (på engelsk). 12. januar 2021. Besøkt 23. januar 2021.
  7. ↑ Voloch, Carolina M.; F, Ronaldo da Silva; Almeida, Luiz G. P. de; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana; Costa, Raissa Mirella da; Ferreira, Orlando C.; Workgroup, Covid19-UFRJ (26. desember 2020). «Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil». Le Phare de l'Esperanto. doi:10.1101/2020.12.23.20248598 – via MedRxiv.
  8. ↑ «Technical briefing 5» (PDF). Gov.uk. Public Health England. s. 17. Besøkt 2. februar 2021.
  9. ↑ Greaney, Allison (4. januar 2021). «Comprehensive mapping of mutations to the SARS-CoV-2 receptor-binding domain that affect recognition by polyclonal human serum antibodies». doi:10.1101/2020.12.31.425021 – via bioRxiv.
  10. ↑ Kupferschmidt, Kai (22. januar 2021). «New mutations raise specter of 'immune escape'». Science. 371 (6527): 329–330. PMID 33479129. doi:10.1126/science.371.6527.329.
  11. ↑ Rettner, Rachael (2. februar 2021). «UK coronavirus variant develops vaccine-evading mutation - In a handful of instances, the U.K. coronavirus variant has developed a mutation called E484K, which may impact vaccine effectiveness.». Live Science.
  12. ↑ Achenbach, Joel; Booth, William (2. februar 2021). «Worrisome coronavirus mutation seen in U.K. variant and in some U.S. samples». The Washington Post.