Historia filmowa bohatera
W serii filmów okazuje się, że Jason Bourne urodził się jako David Webb 13 września 1970 roku (lub 4 czerwca 1978 roku w Jason Bourne; ale mogła to być data urodzenia samego Bourne'a) w Nixa w stanie Missouri (chociaż w Ultimatum podano mu fałszywą datę 15 kwietnia 1971 roku, jako zaszyfrowane odniesienie do konkretnego miejsca). W retrospekcjach dołącza do Delty Sił Armii Stanów Zjednoczonych i ostatecznie zostaje wybrany do programu CIA Treadstone w 1997 roku. Jego ojciec, Richard Webb, starszy analityk CIA, jest odpowiedzialny za stworzenie Treadstone, tajnego programu mającego na celu szkolenie i rozmieszczanie elitarnych zabójców. CIA zabija jego ojca, podkładając bombę pod samochód pod fałszywą flagą w Bejrucie, próbując zwerbować Webba.
Podstęp zadziałał; Webb zgłasza się do CIA i zostaje wciągnięty do programu przez Neala Danielsa, kierownika programu Treadstone, pod nadzorem dr. Alberta Hirscha, który nadzoruje ocenę medyczną agentów Treadstone. Trafia do tajnego centrum rekrutacyjnego w Nowym Jorku, gdzie Hirsch każe go torturować przez wiele dni – metodą waterboardingu i pozbawiania snu – aby złamać jego ducha i umożliwić mu przekształcenie się w zabójcę. Oficjalnie zostaje przyjęty, gdy bez pytania zabija niezidentyfikowanego mężczyznę (domniemanego jako prawdziwy Jason Bourne). Następnie otrzymuje nową tożsamość jako Jason Bourne, a jego prawdziwa tożsamość zostaje objęta klauzulą tajności.
Po intensywnym treningu, podczas którego uczy się kilku języków i opanowuje szeroki wachlarz umiejętności sztuk walki, Bourne trafia do programu Treadstone, którego misjami kieruje Conklin. Jego pierwsze, nieoficjalne zadanie, jak się okazuje, miało miejsce w Berlinie: zabójstwo Władimira Neskiego, rosyjskiego polityka, który zamierzał ujawnić kradzież 20 milionów dolarów z tajnych funduszy CIA przez dyrektora Treadstone, Warda Abbotta, i rosyjskiego oligarchę, Jurija Gretkowa. Na rozkaz Conklina, Bourne morduje Neskiego i jego żonę, upozorowując morderstwo z samobójstwem.
Bourne pracuje w programie jako główny agent przez trzy lata, stacjonując w Paryżu, gdzie prowadzi odosobnione życie, dokonując jednocześnie zamachów, głównie w Europie. Jego oficjalnym opiekunem jest agentka logistyczna Nicky Parsons, również stacjonująca w Paryżu, która rzekomo żywi do Bourne'a uczucia, które ukrywa przed pracodawcami z Treadstone.
Przełom w jego życiu następuje po otrzymaniu rozkazu zamordowania Nykwany Wombosiego, wygnanego afrykańskiego watażki, który szantażował CIA, by przywróciła go na stanowisko głowy państwa, w obawie przed ujawnieniem kilku sekretów CIA. Używając pseudonimu John Michael Kane, Bourne zbiera informacje o Wombosim. Włamuje się na jacht watażki i ukrywa się na nim przez pięć dni, wynurzając się w zimną noc na środku Morza Śródziemnego, zamierzając zaaranżować morderstwo tak, aby wyglądało na to, że Wombosi został zabity przez członka załogi. Jednak Wombosi jest otoczony przez swoje dzieci, a Bourne nie jest w stanie go zabić. Próbuje porzucić misję, opuszczając łódź, ale nieznana osoba strzela mu dwa razy w plecy, wyrzucając go z jachtu do morza i wywołując amnezję, przez co Webb/Bourne zapomina swojej tożsamości.
