W 1999 roku Lincoln przedstawił nowy pojazd klasy wyższej będący pierwszym takiej wielkości modelem w ofercie od czasu modelu Versailles z lat 70. XX wieku.
Lincoln LS został oparty na modułowej platformie koncernu Ford o nazwie Ford DEW98, na której oparto także modele Ford Thunderbird i Jaguar S-Type. LS dostępny był jako 4-drzwiowy sedan. Do napędu używano silników V6 o pojemności trzech litrów oraz V8 3,9 l. Moc przenoszona była na oś tylną poprzez 5-biegową manualną lub automatyczną skrzynię biegów.
Lifting
W 2003 roku Lincoln LS przeszedł obszerną restylizację, w ramach której pojawiły się nowe wkłady reflektorów, zmodyfikowane zderzaki, a także odświeżony projekt atrapy chłodnicy. Pod tą postacią produkcja trwała do 2005 roku, po czym zastąpił go mniejszy model Zephyr.
