Nitryfikacja – proces utleniania amoniaku i soli amonowych do azotynów i azotanów prowadzony przez bakterie nitryfikacyjne.
Azotany powstałe w tym procesie mogą zostać przyswojone przez rośliny lub ulegać akumulacji, czego efektem może być powstanie złóż saletry. Proces ten zachodzi w warunkach tlenowych i jest dwufazowy. W fazie pierwszej bakterie z rodzaju np. Nitrosomonas i Nitrosospira utleniają jony amonowe do azotynów:
Reakcja ta przebiega dwuetapowo, z pośrednim wytworzeniem hydroksyloaminy. Jony azotynowe następnie są utleniane przez bakterie z rodzaju np. Nitrobacter do azotanów:
Warunki nitryfikacji autotroficznej:
Nitryfikacja nie jest procesem odwrotnym do denitryfikacji.