BioJava

BioJava
DesenvolvedorAndreas Prlić
Lançamento inicialSetembro 1999
Lançamento estável
3.0.5
Repositório
Escrito emJava
Sistema
operacional		Macintosh, Windows, Unix-like
TipoBioinformática
LicençaLGPL 2.1.
Websitebiojava.org

O projeto BioJava é um projeto de código aberto dedicado a fornecer ferramentas Java para o processamento de dados biológicos. Isto inclui objetos para a manipulação de seqüências, estruturas de proteínas, analisadores sintáticos de arquivo, CORBA interoperabilidade, DAS, acesso ao ACeDB, programação dinâmica, e rotinas de estatística.

A biblioteca BioJava é útil para automatizar muitos tarefas diárias e mundanas na área de bioinformática. A medida que a biblioteca amadurece, as bibliotecas BioJava tem fornecido uma base sobre a qual tanto o software livre quanto pacotes comerciais podem ser desenvolvidos. O projeto fornece kits de ferramentas com múltiplas funções que tornam mais fácil a criação de análises ou pipelines customizados.

É um projeto de software ativo de código aberto apoiado pela Open Bioinformatics Foundation.

Ver também

Referências

  1. 1 2 Mangalam, Harry (2002). «The Bio* toolkits--a brief overview». Brief Bioinform. 3 (3). p. 296-302. ISSN 1467-5463. PMID 12230038. doi:10.1093/bib/3.3.296
  2. ↑ Holland1, R. C. G.; Down2, T. A.; Pocock, M.; Prlić4, A.; Huen, D.; James, K.; Foisy, S.; Dräger, A.; Yates, A.; Heuer, M.; Schreiber, M. J. (2008). «BioJava: an open-source framework for bioinformatics». Bioinformatics. 24 (18). p. 2096-2097. doi:10.1093/bioinformatics/btn397

Ligações externas