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Fundado no ano de 1983, o Serrano passou 23 anos de sua história disputando competições amadoras, até se profissionalizar no ano de 1996. Em 1997 foi a vez do time conterrâneo da cidade, o Ferroviário se profissionalizar, formando-se uma disputada rivalidade. No mesmo ano, o Serrano ganha renome nacional por "exibir a sua valentia pelo sertão".
O Serrano só conquistaria o acesso à elite pernambucana em 2003. Naquele ano, o clube fez uma grande campanha na segunda divisão. Na primeira fase, o clube se classificou invicto, com quatro vitórias e dois empates. Na segunda etapa, o Aurinegro venceu duas partidas e perdeu duas partidas, conquistando o direito disputar o quadrangular final. Na última fase, a equipe venceu duas partidas, empatou em três partidas e perdeu apenas uma partida, conquistando assim o vice-campeonato da segunda divisão, a qual foi vencida pelo Porto-PE.
O primeiro ano na elite foi uma temporada modesta para o Serrano, mas o time conseguiu se manter na primeira divisão pernambucana. No primeiro turno, o clube finalizou na sexta colocação. No segundo turno, a equipe repetiu a campanha, finalizando novamente na sexta colocação, a junção das duas fases garantiu a quinta colocação ao clube serra-talhadense. O Serrano foi a única equipe que derrotou o Sport nos dois jogos entre as equipes.
Em 2005, a equipe fez uma campanha muito regular e no primeiro turno acabou na frente de potências como Náutico e Sport, ficando atrás somente do Santa Cruz, com três pontos a menos. No segundo turno, o time fez uma campanha inferior, finalizando em quinto lugar com 11 pontos. Apesar disso, a colocação final garantiu ao Serrano a sua melhor campanha no campeonato pernambucano, finalizando com uma honrosa quarta colocação. Além da conquista do Campeonato Pernambucano do Interior. A equipe ainda disputou o Campeonato Brasileiro da Série C de 2005, onde fora eliminado na primeira fase.
Em 2006, o investimento foi grande. A diretoria trouxe 24 novos jogadores para a disputa e o Serrano chegou novamente perto de conquistar uma vaga para a final do Campeonato Pernambucano. O clube terminou o primeiro turno na quarta colocação, com cinco pontos a menos que o líder. No returno porém, a campanha foi inferior e o clube não passou de uma oitava colocação.
No ano de 2007, o Serrano fez uma péssima campanha no primeiro turno, terminando na oitava colocação de dez clubes. No segundo turno, o clube novamente repete uma campanha péssima, finalizando na oitava colocação.
Em 2008, o Serrano finalizou a primeira fase na quarta colocação, garantindo a participação do clube no hexagonal do título. O clube não repetiu a campanha da primeira fase, finalizando o hexagonal na última colocação.
Em 2009, o Serrano foi rebaixado após péssimas campanhas nos dois turnos do campeonato pernambucano, chegando a ser goleado por 9–0 pelo Ypiranga-PE. O rebaixamento gerou uma crise política e financeira no Serrano, que foi obrigado a desativar seu futebol.[carecede fontes]?
O Serrano retornou as atividades em 2013, na segunda divisão pernambucana, o clube foi eliminado logo na primeira fase, com apenas uma vitória conquistada e quatro empates. A perda do protagonismo na cidade para o Serra Talhada fez com que o Serrano paralisasse suas atividades novamente.
Em 2015, o clube novamente retornou às competições profissionais, disputando o Campeonato Pernambucano da Série A2 de 2015. Com nova campanha ruim, a equipe foi excluída da competição por não pagar a taxa de arbitragem por dois jogos seguidos. A equipe não marcou nenhum gol e a sua última partida em campo foi uma derrota de 5 a 0 para o Afogados.
A equipe retornou ao futebol profissional novamente em 2018, junto ao vereador André Maio, que venceu as eleições do clube e se tornou presidente do clube. Robério Souza seria o treinador do clube, mas alegou problemas pessoais e pediu para sair.. Naquela temporada, a equipe curiosamente chegou até as semifinais em uma campanha onde venceu duas partidas por Walkover.
Em 2019, anunciou a contratação de 3 jogadores conhecidos no futebol pernambucano: o volante Vagner Rosa, o lateral Renatinho e o atacante Flávio Caça-Rato. No entanto, eles não chegaram a entrar em campo em partidas oficiais, depois que a FPF excluiu o Serrano e outras oito equipes da segunda divisão por falta de laudos nos estádios.
Em 2021, o Serrano novamente retorna para a disputa do Campeonato Pernambucano da Série A2. Como o estádio Pereirão não possuía condições para sediar partidas, a equipe utilizou o estádio Vianão, em Afogados da Ingazeira, para mandar as suas partidas. O Serrano teve a pior campanha entre os participantes: um empate e cinco derrotas, com um ponto conquistado.
Em 2022, o Serrano mandou seus partidas no estádio Gaudenção, em Itacuruba. A campanha do clube foi novamente péssima e o Serrano foi eliminado logo na primeira fase sem nenhum ponto conquistado.
Em 2026, o Serrano retornou às atividades após três anos de paralização. Graças à unificação das divisões estaduais feita pela FPF, o Serrano retorna à elite pernambucana após 17 anos da sua última participação em 2009.
