Alors que Charlie attend la réponse d'Amita à sa demande en mariage, le FBI essaie de mettre la main sur un sniper qui essaie de tuer un ancien activiste devenu militant légaliste.
Don et son équipe enquêtent sur la mort de plusieurs agents du FBI lors de l'explosion d'une banque. Larry prend une décision qui inquiète Charlie et Amita.
L'équipe de F.B.I. enquête sur un tournoi illégal de roulette russe. Le temps est d'autant plus compté que ce tournoi utilise de véritables munitions et que les morts s'accumulent.
Alors que Larry s'embarque dans une nouvelle aventure, le FBI enquête sur plusieurs meurtres. L'affaire prend une intéressante tournure quand ils découvrent que les meurtriers copient des scènes de films qui ne sont pas encore sortis.
L'équipe essaie de secourir une fille qui a été enlevée ce qui pose des problèmes personnels et moraux à Liz, Amita et Charlie lorsqu'ils découvrent que cette fille pourrait être le premier clone humain.
Le FBI est informé d'une mystérieuse activité détectée sur le site d'une base aérienne désaffectée. Un agent du Pentagone est désigné pour suivre l'enquête.
Ian Edgerton, agent du FBI et ami de l'équipe de Don, est accusé de meurtre. Il prend Colby en otage et exige que Charlie l'aide à prouver son innocence.
Don et son équipe parviennent à contrecarrer les plans de braqueurs de banque. Mais parmi les billets récupérés, les agents font une découverte reliant l'affaire au célèbre détournement d'avion non-résolu de D.B. Cooper.
Une cargaison d'armes à feu de gros calibre vendue sur le marché noir s'avère défectueuse. Don et son équipe enquêtent avec un armateur pour les retrouver avant qu'elles ne soit vendues et se retrouvent dans les rues.
Le FBI enquête sur plusieurs meurtres. Le point commun entre les victimes, c'est qu'elles s'étaient payé les services d'une prostituée. L'enquête prend une autre tournure lorsqu'il s'avère qu'il y a plusieurs tueurs.
La date du mariage de Charlie et Amita est avancée et Dom a posé sa candidature pour le poste de Chef des opérations du FBI. Mais lors d'une arrestation, une altercation se produit au cours de laquelle Don perd son arme de service.