CRY1

CRY1
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Diaphoretickes
Csoport: Cam
Csoport: Pancryptista
Csoport: Cryptista
Csoport: Cryptophyta
Csoport: CRY1 N. N.

A CRY1 a Cryptophyta egy 2024-ig tenyésztetlen plasztisz nélküli környezeti taxonja ideiglenes neve.

Történet

Mivel a legtöbb Cryptophyta-faj foto- vagy mixotróf, a CRY1 kládot és más heterotróf, potenciálisan bakterivor kládokat nagyrészt figyelmen kívül hagyták, azonban más, nem a CRY1-hez tartozó, de a CryptB általános Cryptophyta-teszt által célzott sejtek száma igen magas, 70%-os relatív gyakoriságuk és magas sejtspecifikus felvételi sebességük alapján további bakterivor kládjai lehetnek.

Első környezeti fajait 2008-ban fedezték fel Shalchian-Tabrizi et al.

Első ténylegesen, vagyis nem csak környezeti DNS-ből felfedezett faja a Hemiarma marina, melyet Shiratori et al. fedeztek fel 2016-ban.

Élőhely

Előfordul az epi-, a meta- és a hipolimnionban. Leggyakoribb (1600 sejt/ml) az epi-, ritkább (1100 sejt/ml) a meta-, legritkább (<600 sejt/ml) a hipolimnionban. Édesvíziek.

Az egyik leggyakoribb bakterivor ostorosok.

Életmód

A Cryptophyta sok tagjával ellentétben plasztisz nélküli fagotróf bakterivor fajok tartoznak ide. Növekedését jelentősen stimulálja egy Limnohabitans-faj Rim11 törzse.

Morfológia

A Cryptophyceae taxonhoz hasonló jellemzői például a lapos mitokondriális cristák, a sejtfedő periplaszt és a két egymásra tekert szalagból álló ejektoszómák.

Mozgás

A Hemiarma marina helyváltoztató mozgása ugró mozgás, ezenkívül nagyon gyorsan foroghat.:S1, S2

Filogenetika

Tagjai bazális helyzetűek a Cryptophyceae csoporthoz képest, de a bakterivor Cryptista-fajoknak koronacsoportját alkotják. Feltehetően a plasztisszal rendelkező csoport testvércsoportja.

Monofiletikus csoport, mely az amplikonszekvenálási adatokban kevésbé van jelen, mint azonos minták FISH-adataiban.

Genomika

Cry1-652 teszttel szinte csak a CRY1-be tartozó élőlények mutathatók ki, de azok nagy része kimutatható.

CARD-FISH és környezetiszekvencia-elemzések alapján a plasztisz nélküli bakterivor Cryptophyta-fajok, például a CRY1-fajok is, számos trofikus állapotú tóban megélnek.

Jelentőség

A bakterivor Cryptophyta-fajok fontosak a szerves anyagok magasabb trofikus szintekbe való juttatásához.

Jegyzetek

  1. ↑ Kavagutti VS, Bulzu PA, Chiriac CM, Salcher MM, Mukherjee I, Shabarova T, Grujčić V, Mehrshad M, Kasalický V, Andrei AS, Jezberová J, Seďa J, Rychtecký P, Znachor P, Šimek K, Ghai R (2023. január 26.). "High-resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom". Microbiome. 11: 15. doi:10.1186/s40168-022-01451-4. PMC 9878933. PMID 36698172.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  2. ↑ Grujcic V, Nuy JK, Salcher MM, Shabarova T, Kasalicky V, Boenigk J, Jensen M, Simek K (2018. február 20.). "Cryptophyta as major bacterivores in freshwater summer plankton". ISME J. 12 (7): 1668–1681. doi:10.1038/s41396-018-0057-5. PMC 6018765. PMID 29463895.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  3. 1 2 3 Grujčić V, Nuy J, Salcher M, Shabarova T, Kasalický V, Boenigk J, Jensen M, Šimek K (2018. február 20.). "Cryptophyta as major bacterivores in freshwater summer plankton". ISME J. Oxford: Oxford University Press; Springer: 89. Hozzáférés: 2024. július 31.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link) „open access” publikáció – ingyenesen elolvasható
  4. 1 2 3 4 Shiratori T, Ishida K. "A new heterotrophic cryptomonad: Hemiarma marina n. g., n. sp" (PDF). J Eukaryot Microbiol. Hozzáférés: 2024. július 30.
  5. 1 2 Mukherjee I, Grujčić V, Salcher MM, Znachor P, Seďa J, Devetter M, Rychtecký P, Šimek K, Shabarova T (2024. május 8.). "Integrating depth-dependent protist dynamics and microbial interactions in spring succession of a freshwater reservoir". Environ Microbiome. 19: 31. doi:10.1186/s40793-024-00574-5. PMC 11080224. PMID 38720385.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  6. 1 2 3 4 5 Šimek K, Grujčić V, Mukherjee I, Kasalický V, Nedoma J, Posch T, Mehrshad M, Salcher MM (2020. október 6.). "Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes". FEMS Microbiol Ecol. 96 (10): fiaa121. doi:10.1093/femsec/fiaa121. PMC 7538307. PMID 32556274.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  7. ↑ Piwosz K, Całkiewicz J, Gołębiewski M, Creer S. "Diversity and community composition of pico- and nanoplanktonic protists in the Vistula River estuary (Gulf of Gdańsk, Baltic Sea)" (PDF). Hozzáférés: 2024. július 31. {{cite journal}}: Cite journal requires |journal= (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  8. ↑ Rammel TD. Spatial and Temporal Diversity and Abundance of Cryptophytes in San Diego Coastal Waters (PDF) (Thesis). [[Kaliforniai Egyetem (San Diego)|]]. 2. o. Hozzáférés: 2024. július 31.
  9. ↑ Šimek K, Mukherjee I, Szöke-Nagy T, Haber M, Salcher MM, Ghai R (2022. október 7.). "Cryptic and ubiquitous aplastidic cryptophytes are key freshwater flagellated bacterivores". ISME J. 17 (1): 84–94. doi:10.1038/s41396-022-01326-4. PMC 9751141. PMID 36207492.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)