Pyrenomonadales

Pyrenomonadales
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Cryptophyta
Csoport: Cryptophyceae
Csoport: Pyrenomonadales
Csoportok
Hivatkozások
A Wikifajok tartalmaz Pyrenomonadales témájú rendszertani információt.
A Wikimédia Commons tartalmaz Pyrenomonadales témájú kategóriát.

A Pyrenomonadales a Cryptophyceae egyik rendje 5 csoporttal (Baffinellaceae, Falcomonadaceae, Chroomonadaceae, Geminigeraceae, Pyrenomonadaceae).

Történet

A Pyrenomonadalest Novarino és Lucas írták le 1993-ban nukleomorf-18S rDNS alapján, miután azok alapján kládnak mutatták ki. Előtte több évig vitatott volt, hogy a Pyrenomonas a Rhodomonas szinonimája-e, és 1989-ben Hill és Wetherbee a pirenoidban lévő nukleomorf alapján a Pyrenomonast egyesítették a Rhodomonasszal, de ez nem mindenhol volt elfogadott.:678

1996-ban Cavalier-Smith et al. kimutatták, hogy az akkori meghatározás szerinti Cryptomonadales parafiletikus lehet, mert a pirenoidba ágyazott nukleomorf levezetett lehet.

2018-ban fedezték fel és írták le Daugbjerg, Norlin és Lovejoy 18S rDNS, pigmentek és morfológia alapján a Baffinella frigidust, ennek az önálló nemzetség mellett önálló családszintű kládot is létrehoztak, emellett leírták a Falcomonadaceae kládot a Falcomonas daucoidesnek. Ezt bár először Clay és Kugrens nevezték meg 1999-ben, az Algák, Gombák és Növények Nevezéktanának Nemzetközi Kódexe (ICN) 39.1 cikke értelmében nem volt érvényes, mert nem adtak meg diagnózist vagy leírást.

Genetika

A B-sejt-receptor-asszociált fehérje génje ismert a Guillardia theta fajban. Ez 8 intront tartalmaz, hosszuk 45–158 bp. A ptDNS szelekciós együtthatója magas, vagyis erős nukleotidszelekció jellemzi a csoport génjeit.

Legalább 1 rendezetlen fehérje van benne a Pfam szerint – a G. theta 112 egyedi doménjéből 1 ilyen.

A Chroomonas mesostigmata rendelkezik a xantorodopszinokkal nem rokon, feltehetően Cryptophyta-specifikus rodopszinokkal.

Több fikobiliproteinnel is rendelkezik, melyek lehetséges közös őse a fikoeritrin 545 (PE 545) vagy 566. Az Urgorri complanatus például PE 545-öt használ, míg a Baffinella frigidus alacsony fényintenzitás esetén PE 566-ot.

Filogenetika

Magi és nukleomorfgénjei hasonló filogenetikai fát mutattak ki az 1996-ig keletkezett tanulmányokban, azonban Cavalier-Smith et al. 1996-os tanulmánya szerint a nukleomorfgének fái megbízhatóbbak lehetnek.

Biokémia

Pigmentként a fikoeritrineken kívül klorofill a-t, c2-t és karotinoidokat használhat.

Morfológia

Kloroplasztisza lehet megvilágítástól függően zöld vagy vörös, 1 nukleomorfa van a pirenoidban a Chlorarachnion reptanshoz hasonlóan, ez konvergens evolúcióval alakult ki. Szemfoltja lapos, és a maghoz közeli. Periplasztisza pikkelyes – a pikkelyek lehetnek például hat- vagy négyszögletűek –, ejektoszómái különböző méretűek lehetnek. Egyes fajai vestibuluma vesztibuláris lemezzel rendelkeznek.

A sejt lehet vessző alakú (például Komma caudata, Baffinella) vagy lekerekített (például Falcomonas), hátulsó vége alkalmanként igen rugalmas.

Nem minden faja rendelkezik rhizostylusszal, amelyik rednelkezik, lehet egyenes vagy görbe.

Feltételezett rendszertani jelentőségű jellemzők

Bár a száj-garat rendszert gyakran használják Cryptophyta-fajok morfológiai megkülönböztetésére, a Pyrenomonadales több kládja (például a Geminigeraceae és a Pyrenomonadaceae) különböző komplextípusokkal rendelkező fajokat tartalmaz, így e szerkezet nem alkalmas ezek megkülönböztetésére. Ehelyett a száj-garat rendszer evolúciója kevéssé korlátozott, és számos visszaállás jellemzi. A Falcomonas például a legtöbb Cryptophyta-fajhoz hasonlóan csak szájjal rendelkezik.

A sejt belső periplasztiszrészei alakját és megjelenését is használták korábban Cryptophyta-nemzetségek megkülönböztetésére. A Baffinella periplasztiszlemezei hatszögletűek, de ez megtalálható más tengeri és édesvízi fajokban (például Falcomonas, Proteomonas, Rhinomonas). Ezek a morfológiák feltehetően egymástól függetlenül jelentek meg.

Élőhely

Édes-, brakk- és tengervízben, közvetlenül a felszín alatt és a mély klorofillmaximumban egyaránt előfordul.

Az Adriai-tenger északi fitoplanktonjában nem ismert.

A Cuyahoga vizében gyakori a Chroomonas egy meg nem nevezett faja.

Életmód

Fotoszintetikus.

Ökológia

Angolnalárvák testfelszínén ritkán előfordulhatnak Pyrenomonadales-rDNS-ek, béltartalmukban nem ismertek. Megtalálható a Phaseolus lunatus rizoszférájában is.

Kloroplasztisz-16S rRNS és 18S rRNS alapján egyaránt észlelhető.

A zooplankton egyik jelentős erőforrása.

Életciklus

A Proteomonas heteromorf haplodiploid életciklusú, a Proteomonas sulcata vesztibuláris lemeze Hill és Wetherbee 1986-os megfigyelései szerint a zöldmoszativarsejtekhez hasonló párosodási terület lehet. Ez alapján a faj ivaros szaporodásra képes lehet.:674

Jegyzetek

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Daugbjerg N, Norlin A, Lovejoy C (2018. július 25.). "Baffinella frigidus gen. et sp. nov. (Baffinellaceae fam. nov., Cryptophyceae) from Baffin Bay: Morphology, pigment profile, phylogeny, and growth rate response to three abiotic factors" (PDF). J Phycol (angol nyelven). 54 (5): 665–680. Bibcode:2018JPcgy..54..665D. doi:10.1111/jpy.12766. ISSN 1529-8817. PMID 30043990. 2018. október 12. dátummal az eredeti (PDF) címről archiválva. Hozzáférés: 2025. január 24.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  2. 1 2 3 4 Cavalier-Smith T, Couch JA, Thorsteinsen KE, Gilson P, Deane JA, Hill DRA, Mcfadden GI (1996. június 15.). "Cryptomonad nuclear and nucleomorph 18S rRNA phylogeny". Eur J Phycol. 31 (4): 315–328. doi:10.1080/09670269600651541. Hozzáférés: 2025. január 24.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  3. ↑ Morozov SY, Pankratenko AV, Atabekova AK, Solovyev AG (2017. május 6.). "Data on the exon-intron organization of genes coding for B-cell receptor-like proteins". Data Brief. 12: 616–623. doi:10.1016/j.dib.2017.05.011. PMC 5430146. PMID 28540354.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  4. ↑ Suzuki H, Morton BR (2016. május 19.). "Codon adaptation of plastid genes". PLoS One. 11 (5). doi:10.1371/journal.pone.0154306. PMC 4873144. PMID 27196606. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link)
  5. ↑ Williams RW, Xue B, Uversky VN, Dunker AK (2013. április 1.). "Distribution and cluster analysis of predicted intrinsically disordered protein Pfam domains". Intrinsically Disord Proteins. 1 (1). doi:10.4161/idp.25724. PMC 5424788. PMID 28516017. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  6. ↑ Hovde BT, Deodato CR, Hunsperger HM, Ryken SA, Yost W, Jha RK, Patterson J, Monnat RJ Jr, Barlow SB, Starkenburg SR, Cattolico RA (2015. szeptember 23.). "Genome sequence and transcriptome analyses of Chrysochromulina tobin: metabolic tools for enhanced algal fitness in the prominent order Prymnesiales (Haptophyceae)". PLoS Genet. 11 (9). doi:10.1371/journal.pgen.1005469. PMC 4580454. PMID 26397803. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  7. 1 2 Laza-Martínez A (2012. március 15.). "Urgorri complanatus gen. et sp. nov. (Cryptophyceae), a red-tide-forming species in brackish waters". J Phycol. 48 (2): 423–435. doi:10.1111/j.1529-8817.2012.01130.x. PMID 27009732.
  8. 1 2 Cannon MV, Craine J, Hester J, Shalkhauser A, Chan ER, Logue K, Small S, Serre D (2017. október 19.). "Dynamic microbial populations along the Cuyahoga River". PLoS One. 12 (10). doi:10.1371/journal.pone.0186290. PMC 5648161. PMID 29049324. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  9. 1 2 Grižančić L, Baričević A, Smodlaka Tanković M, Vlašiček I, Knjaz M, Podolšak I, Kogovšek T, Pfannkuchen MA, Marić Pfannkuchen D (2023. szeptember 25.). "A metabarcode based (species) inventory of the northern Adriatic phytoplankton". Biodivers Data J. 11 (e106947). doi:10.3897/BDJ.11.e106947. PMC 10840511. PMID 38318520.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  10. ↑ Gran-Stadniczenko S, Egge E, Hostyeva V, Logares R, Eikrem W, Edvardsen B (2018. november 29.). "Protist diversity and seasonal dynamics in Skagerrak plankton communities as revealed by metabarcoding and microscopy". J Eukaryot Microbiol. 66 (3): 494–513. doi:10.1111/jeu.12700. PMC 6587730. PMID 30414334.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  11. ↑ Schoenle A, Scepanski D, Floß A, Büchel P, Koblitz AK, Scherwaß A, Arndt H, Waldvogel AM (2024. május 27.). "The dilemma of underestimating freshwater biodiversity: morphological and molecular approaches". BMC Ecol Evol. 24 (69). doi:10.1186/s12862-024-02261-y. PMC 11131255. PMID 38802764.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  12. ↑ Chow S, Inaba N, Nagai S, Kurogi H, Nakamura Y, Yanagimoto T, Tanaka H, Hasegawa D, Asakura T, Kikuchi J, Tomoda T, Kodama T (2019. november 27.). "Molecular diet analysis of Anguilliformes leptocephalus larvae collected in the western North Pacific". PLoS One. 14 (11). doi:10.1371/journal.pone.0225610. PMC 6881025. PMID 31774866. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: jelöletlen szabad DOI (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  13. ↑ Wisser RJ, Oppenheim SJ, Ernest EG, Mhora TT, Dumas MD, Gregory NF, Evans TA, Donofrio NM (2021. október 19.). "Genome assembly of a Mesoamerican derived variety of lima bean: a foundational cultivar in the Mid-Atlantic USA". G3 (Bethesda). 11 (11). doi:10.1093/g3journal/jkab207. PMC 8527486. PMID 34542584. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  14. ↑ Xu S, Li G, He C, Huang Y, Yu D, Deng H, Tong Z, Wang Y, Dupuy C, Huang B, Shen Z, Xu J, Gong J (2023. július 29.). "Diversity, community structure, and quantity of eukaryotic phytoplankton revealed using 18S rRNA and plastid 16S rRNA genes and pigment markers: a case study of the Pearl River Estuary". Mar Life Sci Technol. 5 (3): 415–430. doi:10.1007/s42995-023-00186-x. PMC 10449762. PMID 37637251.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  15. ↑ Novotny A, Serandour B, Kortsch S, Gauzens B, Jan KMG, Winder M (2023. április 28.). "DNA metabarcoding highlights cyanobacteria as the main source of primary production in a pelagic food web model". Sci Adv. 9 (17). doi:10.1126/sciadv.adg1096. PMC 10132751. PMID 37126549. {{cite journal}}: More than one of |number= és |issue= specified (súgó)CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

További információk