Storia
Sam Porter Bridges, il corriere protagonista del primo gioco, si è ritirato vicino all'ex confine tra Messico e Stati Uniti d'America, disertando le UCA per vivere una vita appartata con la figlia adottiva Lou. Fragile interrompe la loro tranquilla routine per informare Sam di aver fondato una nuova società, la Drawbridge, incaricata dalle UCA di estendere la rete chirale fino al Messico. Fragile chiede a Sam di attraversare l'ex confine tra Stati Uniti e Messico e di attivare i terminali della rete chirale predisposti dalla Bridges, alla stregua di quanto fatto negli Stati Uniti, con la promessa che Sam sarebbe stato graziato dalle UCA per essersi appropriato di Lou, considerata proprietà della Bridges in quanto ex Bridge Baby (BB).
Sam accetta l'incarico e si mette in viaggio, affidando Lou alle cure di Fragile. Dopo aver collegato tutto il Messico, Sam arriva in un laboratorio del suo vecchio amico Deadman, dove riceve una registrazione in cui quest'ultimo spiega di aver scoperto nelle vicinanze un'anomalia dello spaziotempo, chiamata "geo-varco", che funge da portale per l'Australia. Inoltre, Deadman aveva scoperto che, per ragioni sconosciute, a Lou era stato assegnato un numero identificativo appartenente a un BB dismesso in precedenza, e che di conseguenza non risulta registrata nei sistemi delle UCA. Deadman rivela infine che, giunto ormai al termine della sua vita, ha deciso di recarsi sulla sua Spiaggia dopo aver scoperto di possederne anch'egli una. Sam torna quindi al suo rifugio, ma scopre che questo è stato attaccato da un misterioso gruppo armato: durante lo scontro, Fragile sopravvive riportando ferite gravi, mentre Lou è stata apparentemente uccisa.
Un mese dopo, Sam continua a tormentarsi per la morte di Lou. Fragile, nel tentativo di alleviare il suo dolore, lo invita a salire a bordo della sua nave, la DHV Magellan, per attraversare il geo-varco e collegare l'Australia alla rete chirale. Sam accetta la proposta, e Lou ricompare sotto forma di CA all'interno della sua capsula BB. A bordo della nave, Sam conosce l'equipaggio di Fragile: Tarman, il pilota della nave, Dollman, un medium la cui anima è rimasta intrappolata all'interno di un pupazzo, Charlie, il misterioso finanziatore della Drawbridge e il Presidente, la guida dell'APAC, ovvero la compagnia che controlla l'APAS, il quale spiega che collegando tutta l'Australia alla rete chirale dovrebbero manifestarsi ulteriori geo-varchi, rendendo possibile il collegamento ad ulteriori continenti. Durante l'avventura altri membri si uniscono all'equipaggio della DHV Magellan: Rainy, una donna incinta in grado di scatenare tempeste di "cronopioggia" quando esce all'aperto, e Heartman, un ex ricercatore della Bridges nonché vecchio alleato di Sam e Fragile.
La missione viene più volte ostacolata dal ritorno di Higgs, nemesi del primo gioco, il quale è al comando di un esercito di entità meccaniche con poteri soprannaturali denominate "mecha spettro"; Higgs rivela che lui e i suoi robot sono i responsabili dell'attacco al rifugio di Sam, costato la vita a Lou, e Sam viene in più occasioni risucchiato all'interno di anomalie chiamate "flussiscuri", dove si ritrova a combattere un misterioso soldato spettrale di nome Neil Vana che sembra avere legami con Lou. Dopo il primo incontro con Neil, Sam recupera una bara-crisalide contenente una ragazza priva di ricordi, che Fragile decide di chiamare Tomorrow. Dopo diversi scontri, Sam riesce a sconfiggere Neil definitivamente, il quale gli consegna un dispositivo di memoria lasciatogli dalla defunta compagna di Sam, Lucy: i dati al suo interno rivelano che Lou era in realtà la figlia biologica di Sam, creduta morta con Lucy in una voragine ma rapita dalla Bridges e designata primo BB, col numero di serie BB-00.
Lucy aveva fatto credere a Sam di essere rimasta incinta da un altro uomo al fine di impedire che la figlia, in quanto prole di un "riemerso", fosse utilizzata dalla Bridges come cavia. Neil era un contrabbandiere, legato a Lucy da un evento traumatico subito da entrambi durante l'infanzia, che aveva introdotto clandestinamente dal Messico numerose donne incinte in morte cerebrale per conto della Bridges, che le impiegava come cavie per la creazione dei BB. Neil decise di aiutare la donna, ancora incinta, a fuggire dalla Bridges, fallendo e uccidendo entrambi nel tentativo: il feto di Lucy fu estratto dal corpo esanime della donna ma, per ragioni sconosciute, fu riposto segretamente in un deposito finché non venne ritrovato da Sam. In seguito a queste rivelazioni, Fragile decide di confessare a Sam che la sua capsula BB è rimasta vuota per tutta la durata della spedizione e che Lou non è mai stata al suo interno, nemmeno sotto forma di CA: i membri dell'equipaggio hanno assecondato le allucinazioni di Sam per permettergli di elaborare il dolore della perdita e riprendersi gradualmente.
Arrivati quasi al termine del viaggio, l'ultimo necessario centro per il completamento della rete chirale australiana viene preso d'assalto da Higgs. Sam, con il supporto della DHV Magellan, si fa strada attraverso le armate robotiche di Higgs, riuscendo a collegare il nodo e completando la rete chirale australiana: dopo il completamento della rete, il Presidente tradisce la Drawbridge, rivelando di essere un'entità formata dall'amalgama di quattromila anime di umani deceduti a causa di una voragine, rimaste fuse ai sistemi dell'APAC. Il Presidente spiega che intende utilizzare la rete chirale per segregare gli umani nelle loro Spiagge, così da annullare completamente il rischio del contatto con le CA e, di conseguenza, di ulteriori voragini, salvando l'umanità dall'estinzione. L'entità aggiunge di aver salvato Higgs dal suo confino e di avergli fornito i mecha spettro, in modo da generare una minaccia che avrebbe costretto l'Australia ad adottare la rete chirale per proteggersi. Proprio quando tutti gli sforzi sembrano vani, Charlie rivela di essere Die-Hardman e spiega di essere da tempo a conoscenza dei piani del Presidente, avendo segretamente riprogrammato la rete chirale tramite il Q-Pid di Sam in modo che l'APAS potesse all'evenienza essere disconnesso dalla rete.
Nonostante la sconfitta del Presidente, Higgs ricompare e cattura Tomorrow, rivelando che la ragazza e Sam condividono gli stessi geni e implicando quindi che sia sua figlia. Higgs dichiara inoltre che la ragazza è una nuova "Entità Estintiva", che egli vuole usare per cancellare l'intera umanità. Sam e l'equipaggio della DHV Magellan inseguono Higgs, rifugiatosi sulla spiaggia contenente l'APAS; dopo un intenso scontro, Sam riesce a sconfiggere Higgs, che viene infine mangiato da una versione gigante di Lou, e a salvare Tomorrow. Tornato sulla nave, Sam scopre che durante la battaglia Fragile è morta: la donna era in realtà già morta da tempo, per la precisione da quando aveva tentato di salvare Lou durante l'attacco di Higgs al rifugio di Sam. Nel tentativo di portare in salvo Lou teletrasportandosi verso una Spiaggia, Fragile era stata colpita mortalmente mentre si trovava nello spazio tra il mondo dei vivi e quello dei morti; poiché sulla Spiaggia il tempo scorre più velocemente che sulla Terra, è potuta rimanere nel mondo dei vivi nonostante la sua anima appartenesse già all'aldilà. Durante il viaggio di ritorno dalla Spiaggia dell'APAS, Sam visualizza alcuni ricordi appartenenti a Neil e scopre che Fragile era effettivamente riuscita a portare in salvo Lou, lasciandola sulla spiaggia di Neil, dove la bambina è cresciuta a ritmi accelerati rispetto a quelli del mondo dei vivi: dopo aver recuperato tutti i suoi ricordi, Louise, ovvero Tomorrow, e Sam possono finalmente ricongiungersi come padre e figlia.
Una scena dopo i titoli di coda mostra Lou dopo qualche anno, diventata anch'ella un corriere come suo padre, mentre si prepara a varcare un geo-varco verso territori sconosciuti.
26 giugno 2025
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