Carreira
Botstein lecionou no Instituto de Tecnologia de Massachusetts, onde se tornou professor de genética. Botstein ingressou na Genentech, Inc. em 1987 como vice-presidente de ciência. Em 1990, tornou-se presidente do Departamento de Genética da Universidade de Stanford. Botstein foi eleito para a Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos em 1981 e para o Instituto de Medicina em 1993.
Foi diretor do Programa de Ciências Integradas da Universidade de Princeton.
Em 1980, Botstein e seus colegas Ray White, Mark Skolnick e Ronald W. Davis propuseram um método para construir um mapa de ligação genética usando polimorfismos de comprimento de fragmentos de restrição que foi usado nos anos seguintes para identificar vários genes de doenças humanas, incluindo a doença de Huntington e o BRCA1. Variações desse método foram usadas nos esforços de mapeamento que antecederam e permitiram a fase de sequenciamento do Projeto Genoma Humano.
Em 1998, Botstein e seu pós-doutorando Michael Eisen, juntamente com o estudante de pós-graduação Paul Spellman e o colega Patrick Brown, desenvolveram um método estatístico e uma interface gráfica amplamente utilizados para interpretar dados genômicos, incluindo dados de microarranjo. Essa abordagem foi refinada e aplicada para diversas aplicações, incluindo uma classificação molecular de tumores heterogêneos usando expressão gênica. Esses esforços incluíram trabalhos na descoberta de subtipos tumorais com Lou Staudt, Ash Alizadeh e Ronald Levy, resultando em uma classificação refinada de linfomas difusos de grandes células B e na elaboração de retratos moleculares para classificação refinada de cânceres de mama com Anne-Lise Børresen-Dale e Charles Perou. Posteriormente, trabalhou na criação da influente Gene Ontology com Michael Ashburner e Suzanna Lewis. Foi um dos editores fundadores do periódico Molecular Biology of the Cell, juntamente com Erkki Ruoslahti e Keith Yamamoto.
Em 2013, Botstein foi nomeado diretor científico da startup de saúde antienvelhecimento do Google, Calico.
Prêmios
Botstein ganhou o Prêmio Eli Lilly and Company em Microbiologia (1978), a Medalha da Genetics Society of America (1988, com Ira Herskowitz), o Prêmio Allan da American Society of Human Genetics (1989, com Ray White), o Prêmio Gruber de Genética (2003), o Prêmio do Albany Medical Center (2010, com Eric Lander e Francis Collins) e o Prêmio Dan David em 2012. Em 2013, foi agraciado com o Prêmio Breakthrough em Ciências da Vida de US$ 3 milhões por seu trabalho e, em 2020, com a Medalha Thomas Hunt Morgan da Genetics Society of America. Em 2016, o programa de IA do Semantic Scholar incluiu Botstein em sua lista dos dez pesquisadores biomédicos mais influentes.
