La Kavuruga prend naissance à environ 1 427 m d'altitude, à la confluence des rivières Nyabihongo et Mugatama, de part et d'autre de la colline de Rugazi, à l'ouest de Muramba, dans la province de Karuzi,.
Elle s'écoule ensuite selon un cours sinueux vers le nord-nord-est à travers la province de Muyinga, jusqu'au barrage de Kavuruga, puis parcourt une courte distance avant de rejoindre la Ruvubu.
La Kavuruga reçoit plusieurs affluents: le Kwagatabo et le Kibwirwa sur sa rive gauche, le Rusabagi, le Gasarara et le Ntawuntunze sur sa rive droite, puis le Gahomoka, le Nyarumasni, le Kinyamaganda et le Kagare dans son cours inférieur. Sa confluence avec la Ruvubu se situe à environ 1 343 m d'altitude.
Dans son cours inférieur, la rivière traverse un marais non aménagé. La Stratégie nationale de développement de la filière riz au Burundi, publiée en 2014, mentionne le marais de Kavuruga aval, dans la province de Muyinga, avec une superficie de 40ha.
Environnement
Les environs de la Kavuruga forment une mosaïque de terres agricoles et de végétation naturelle. La région est assez densément peuplée, avec environ 214 habitants par kilomètre carré selon les données disponibles pour 2016.
La température annuelle moyenne est d'environ 20°C, avec une moyenne mensuelle plus élevée en septembre et plus basse en mars. Les précipitations annuelles moyennes atteignent environ 1 170 mm, avec un maximum moyen en mars et un minimum en juillet.
La centrale de Kayenzi est mise en service en 1984. Energypedia indique une puissance installée de 0,850 MW, composée de deux groupes de 0,425 MW, et précise qu'elle est raccordée au réseau nord-est de 30 kV. Le World Small Hydropower Development Report 2016 mentionne également la centrale de Kayenzi parmi les petites centrales hydroélectriques du Burundi, avec une puissance de 1,3 MW et une production annuelle estimée à 1,3 GWh.
Le barrage hydroélectrique de Kavuruga est conçu pour alimenter les centres urbains de Muyinga et de Cankuzo en électricité. Le lac de retenue, dominé par les collines de Nkoyoyo et de Kayenzi, est alimenté par les eaux provenant notamment des secteurs de Gasenyi, Muhongo, Rusabagi et Gitaramuka.
En 2013, Iwacu rapporte que le niveau de la retenue, qui atteignait auparavant environ 8 m en saison des pluies, ne dépassait plus 5 m, en raison de la dégradation de l'environnement autour du lac. L'Église anglicane, avec l'appui de l'ONG Christian Aid, entreprend alors des actions de reboisement et de protection des sols autour de la retenue, notamment par la plantation d'arbres agroforestiers sur les collines de Nkoyoyo et de Kayenzi.
En 2009, la REGIDESO lance un programme de réhabilitation de plusieurs centrales hydroélectriques burundaises. Les installations concernées comprennent notamment Rwegura, Nyemanga, Kayenzi sur la Kavuruga, Marangara et Sanzu.
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