La Rugusye prend sa source à l'est de Kabuyenge, à l'extrémité orientale de la province de Ruyigi, au Burundi. Elle coule vers l'ouest-sud-ouest en suivant la frontière entre le Burundi et la Tanzanie jusqu'à sa confluence avec la Rumpungwe, qui poursuit ensuite un tracé frontalier.
Le rôle frontalier du cours d'eau est ancien. Le tracé de la limite entre le Tanganyika et le territoire sous mandat belge du Ruanda-Urundi, défini en 1926, mentionne dans ce secteur le thalweg de la rivière Lugusi, depuis sa confluence avec le Kumbizi, ou Katungura, jusqu'à la confluence de la Kabuyenge.
Environnement
Les environs de la Rugusye sont principalement constitués de savane boisée. La région est faiblement peuplée, avec environ 32 habitants/km2 en 2016.
La température annuelle moyenne du secteur est d'environ 22°C. Le mois le plus chaud est septembre, avec une moyenne de 25°C, tandis que le mois le plus froid est décembre, avec une moyenne de 20°C. Les précipitations annuelles moyennes atteignent 1 376 mm. Le mois le plus pluvieux est mars, avec environ 293 mm de précipitations, et le mois le plus sec est juillet, avec environ 1 mm.
Bassin versant et marais
Le bassin versant de la Rugusye couvre 1 522ha, dont 241ha, soit 15,85 %, sont cultivés au début des années 2000.
Certaines parties des marais de la Rugusye, de la Rumpungwe et de la Malagarasi sont décrites comme les seuls marais minéraux du Burundi inondés en permanence. Le même rapport définit les marais minéraux comme des marais dont la proportion de matière organique est inférieure à 20%,.
En 2000, deux projets d'aménagement de marais sont signalés dans ce secteur. Ils sont conduits par la Société sucrière du Moso et par la Direction provinciale de l'agriculture et de l'élevage de Ruyigi. Ces projets portent sur la création de réseaux séparés d'irrigation et de drainage, isolés par des digues ou des pistes.
Burundi, 
Tanzanie
