Labyrinthulomycetes

Labyrinthulomycetes
Rendszertani besorolás
Domén: Eukarióták (Eukaryota)
Csoport: Diaphoretickes
Csoport: Tsar
Csoport: Sar
Csoport: Sárgásmoszatok (Stramenopila)
Törzs: Bigyra
Altörzs: Sagenista
Osztály: Labyrinthulomycetes
Dick 2001
Szinonimák
  • Labyrinthulomycota Whittaker, 1969
  • Labyrinthomorpha Page in Levine et al., 1980
  • Labyrinthulea Olive, 1975 ex Cavalier-Smith, 1989
Kládok
Hivatkozások
A Wikifajok tartalmaz Labyrinthulomycetes témájú rendszertani információt.
A Wikimédia Commons tartalmaz Labyrinthulomycetes témájú kategóriát.

A Labyrinthulomycetes (ICN) vagy Labyrinthulea (ICZN) sejtjeik haladási és tápanyagfelvételi útjaiként szolgáló fonalak vagy csövek hálózatát alkotó sárgásmoszatok osztálya. Két fő csoportja a Labyrinthulida és a Thraustochytrida. Nagyrészt tengeriek, általában algák és tengerifüvek parazitái vagy elhalt növényi anyag lebontói. Vannak köztük tengeri gerinctelenek parazitái és Chlorella-szimbionta mixotróf fajok.

Jellemzők

Bár a sejteken kívül vannak, a Labyrinthulomycetes fonalait membrán veszi körül. Ezek szagenogénnel, más néven botroszómával alakulnak ki. A sejtek egymagvúak, általában ellipszoidok, és az amorf hálózaton 5–150 μm/perc sebességgel mozognak. A Labyrinthulidában a sejtek a csövekben vannak, a Thraustochytridában az oldalukon.

Evolúció

Evolúciós eredet

A Labyrinthulomycetes tagjai nem gombák, hanem a sárgásmoszatok közé tartozó eukarióták monofiletikus csoportja. A Bigyra törzs tagjai, mely más heterotróf élőlényeket is tartalmaz, például a Bicosoecida csoportot. Mivel a sárgásmoszatok plasztiszai utolsó közös ősükben történő endoszimbiózis eredményei lehetnek, e két csorport mixotróf közös algaősből eredhet, mely másodlagosan vesztette el plasztiszait.

A Labyrinthulomycetes egyes jellemzői az ősi plasztiszokból vezethető le. ω-3 zsírsavakat termelnek általában a kloroplasztiszokban lévőhöz hasonló deszaturázzal. A Labyrinthulia-zoospórák a fotoszintetikus sárgásmoszatokéhoz hasonló membránkötött granulákkal rendelkező szemfolttal rendelkeznek, melyek vagy a plasztiszban vannak, vagy abból vezethetők le.

A Bigyrában a Labyrinthulomycetes az Eogyrea testvércsoportja, mely a Pseudophyllomitus vesiculosus fajt és a MAST-4 környezeti kládot tartalmazza. Ezek együtt alkotják a Sagenista altörzset.

A Bigyra újabb rendszertanok szerint parafiletikus, vagyis a plasztiszhiány feltehetően ősi.

Stramenopila

Gyrista

Ochrophyta



Pseudofungi



Bigyra
Opalozoa

Placidozoa



Bicosoecida



Sagenista

Labyrinthulomycetes



Eogyrea

Platysulcea



Besorolás

A Labyrinthulomycetest egykor a Labyrinthulomycota gombatörzs részeként sorolták be. Eredetileg különös nyálkagombáknak tekintették, de nem hasonlítanak a többire. Zoospóra-szerkezetük és genetikai tanulmányok alapján egyszerű sárgásmoszatcsoport, de kérdéses, hogyan sorolják be és kezeljék.

Az osztály általában 2 rendet (Labyrinthulales és Thraustochytriales (ICBN) vagy Labyrinthulida és Thraustochytrida (ICZN)) tartalmazott, de 2012-ben újabb besorolást javasoltak.

Genetikai kód

A Thraustochytrium aureum mitokondriumai alternatív genetikai kódot használnak, ahol a TTA stop kodon, nem leucinkódoló. E kód a NCBI 23. transzlációs táblázata, a Thraustochytrium-mitokondriáliskód.

Genetikai kódTranszlációs táblázatDNS-kodonRNS-kodonTranszláció e kóddalStandard kód (1. transzlációs táblázat)
Thraustochytrium-mitokondriáliskód23TTAUUASTOP=Ter (*)Leu (L)

Jegyzetek

  1. 1 2 3 4 5 Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, ((Lahr DJG)), Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019). "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006. PMID 30257078.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  2. ↑ Cavalier-Smith, T. (1997). "Sagenista and bigyra, two phyla of heterotrophic heterokont chromists". Archiv für Protistenkunde. 148 (3): 253–267. doi:10.1016/S0003-9365(97)80006-1.
  3. 1 2 3 Tsui, Clement K M; Marshall, Wyth; Yokoyama, Rinka; Honda, Daiske; Lippmeier, J Casey; Craven, Kelly D; Peterson, Paul D; Berbee, Mary L (2009. január). "Labyrinthulomycetes phylogeny and its implications for the evolutionary loss of chloroplasts and gain of ectoplasmic gliding". Molecular Phylogenetics and Evolution. 50 (1): 129–140. doi:10.1016/j.ympev.2008.09.027. PMID 18977305.
  4. ↑ Schärer, L.; Knoflach, D.; Vizoso, D. B.; Rieger, G.; Peintner, U. (2007). "Thraustochytrids as novel parasitic protists of marine free-living flatworms: Thraustochytrium caudivorum sp. nov. Parasitizes Macrostomum lignano" (PDF). Marine Biology. 152 (5): 1095. doi:10.1007/s00227-007-0755-4. S2CID 4836350.
  5. ↑ Pan, Jingwen (2016). Labyrinthulomycetes diversity meta-analysis (MSc). University of British Columbia. doi:10.14288/1.0223199.
  6. 1 2 Gomaa, Fatma; Mitchell, Edward A. D.; Lara, Enrique (2013). "Amphitremida (poche, 1913) is a new major, ubiquitous labyrinthulomycete clade". PLoS One. 8 (1): e53046. Bibcode:2013PLoSO...853046G. doi:10.1371/journal.pone.0053046. PMC 3544814. PMID 23341921.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link)
  7. ↑ Hamamoto Y, Honda D (2019. január 9.). "Nutritional intake of Aplanochytrium (Labyrinthulea, Stramenopiles) from living diatoms revealed by culture experiments suggesting the new prey-predator interactions in the grazing food web of the marine ecosystem". PLoS One. 14 (1): e0208941. PMC 6326421. PMID 30625142. {{cite journal}}: Text "doi: 10.1371/journal.pone.0208941" ignored (súgó)
  8. ↑ Cavalier-Smith, Thomas (2017). "Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences". Protoplasma. 255 (1): 297–357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. PMC 5756292. PMID 28875267.
  9. ↑ Thakur, Rabindra; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-ichiro (2019). "Taxon-rich Multigene Phylogenetic Analyses Resolve the Phylogenetic Relationship Among Deep-branching Stramenopiles". Protist. 170 (5): 125682. doi:10.1016/j.protis.2019.125682. ISSN 1434-4610. PMID 31568885. S2CID 202865459.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link)
  10. ↑ Cho A, Tikhonenkov DV, Lax G, Prokina KI, Keeling PJ (2023. november 10.). "Phylogenomic position of genetically diverse phagotrophic stramenopile flagellates in the sediment-associated MAST-6 lineage and a potentially halotolerant placididean". Mol Phylogenet Evol. 190 (107964). doi:10.1016/j.ympev.2023.107964. PMID 37951557.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
  11. 1 2 3 Bennett, Reuel M.; Honda, D.; Beakes, Gordon W.; Thines, Marco (2017). "Chapter 14. Labyrinthulomycota". In Archibald, John M.; Simpson, Alastair G.B.; Slamovits, Claudio H. (eds.). Handbook of the Protists. Springer. 507–542. o. doi:10.1007/978-3-319-28149-0_25. ISBN 978-3-319-28147-6.
  12. ↑ Anderson, O. Roger; Cavalier-Smith, Thomas (2012). "Ultrastructure of Diplophrys parva, a New Small Freshwater Species, and a Revised Analysis of Labyrinthulea (Heterokonta)". Acta Protozoologica. 8 (1): 291–304. doi:10.4467/16890027AP.12.023.0783.
  13. 1 2 FioRito, Rebecca; Leander, Celeste; Leander, Brian (2016). "Characterization of three novel species of Labyrinthulomycota isolated from ochre sea stars (Pisaster ochraceus)". Marine Biology. 163 (8): 170. doi:10.1007/s00227-016-2944-5. S2CID 43399688.
  14. ↑ Hassett, Brandon T.; Gradinger, Rolf (2018). "New Species of Saprobic Labyrinthulea (=Labyrinthulomycota) and the Erection of a gen. nov. to Resolve Molecular Polyphyly within the Aplanochytrids". Journal of Eukaryotic Microbiology (angol nyelven). 65 (4): 475–483. doi:10.1111/jeu.12494. hdl:10037/13570. ISSN 1550-7408. PMID 29265676. S2CID 46820836.
  15. ↑ Wideman, Jeremy G.; Monier, Adam; Rodríguez-Martínez, Raquel; Leonard, Guy; Cook, Emily; Poirier, Camille; Maguire, Finlay; Milner, David S.; Irwin, Nicholas A. T. (2019. november 25.). "Unexpected mitochondrial genome diversity revealed by targeted single-cell genomics of heterotrophic flagellated protists". Nature Microbiology (angol nyelven). 5 (1): 154–165. doi:10.1038/s41564-019-0605-4. hdl:10871/39819. ISSN 2058-5276. PMID 31768028. S2CID 208279678. {{cite journal}}: |first10= missing |last10= (súgó); |first11= missing |last11= (súgó); More than one of |last1= és |last= specified (súgó)
  16. ↑ Elzanowski, Andrzej; Ostell, Jim; Leipe, Detlef; Soussov, Vladimir. "The Genetic Codes". Taxonomy browser. National Center for Biotechnology Information (NCBI), U.S. National Library of Medicine. Hozzáférés: 2016. augusztus 11.

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a Labyrinthulomycetes című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

További információk

Fájl:Wikispecies-logo.svg
A Wikifajok tartalmaz Labyrinthulomycetes témájú rendszertani információt.