Gyrista

Gyrista
Rendszertani besorolás
Domén:	Eukarióták (Eukaryota);
Csoport:	Diaphoretickes;
Csoport:	Tsar;
Csoport:	Sar;
Csoport:	Sárgásmoszatok (Stramenopila);
Törzs:	Gyrista;
Alcsoportok
	Bigyromonada Developea; Pirsonea; ; Pseudofungi Oomycetes; Hyphochytrea; ; Ochrophyta (=Heterokontophyta) Chrysista; Diatomista; ;
Hivatkozások
	A Wikifajok tartalmaz Gyrista témájú rendszertani információt.

A Gyrista a sárgásmoszatok törzse 3 különböző csoporttal, ezek a nagyrészt fotoszintetikus Ochrophyta, a parazita Pseudofungi és az 1998-ban leírt Bigyromonada. A törzs tagjai hélixszel vagy kettős hélix-gyűrű rendszerrel rendelkeznek a csilló átmeneti részében.

Genetika

Craig 2023-ban a Phaeophyceae, Chrysophyceae, Dictyochophyceae és Pelagophyceae családokban fedezett fel replitronokat, akárcsak a Bigyra Labyrinthulea kládjának két fajában, de ez utóbbiak nem voltak konszenzusos szekvenciák, melyek több példányban előfordultak.

Rendszertan

Taxonómiai történet

A Gyristát Thomas Cavalier-Smith protisztológus írta le A revised six-kingdom system of life című művében, eredetileg két törzsből (az algákat tartalmazó Ochrophytából és a Pseudofungiból, az Opalineából és Bigyromonadából álló Bigyrából) álló főtörzsként írta le. Később a Bigyrát módosították, így az Opalineát, a Bicosoecidát és a Labyrinthulomycetest is tartalmazta, míg az Ochrophyta, a Pseudofungi és a Bigyromonada a Gyristában maradtak.

Molekuláris filogenetika

A Gyristát 2017-ben a Sagenistát és az Opalozoát tartalmazó Bigyra testvércsoportjaként írták le. E két csoport közösen alkotja a Stramenopila, más néven Heterokonta főtörzset:

Stramenopiles

Bigyra

Opalozoa

	Placidozoa

	Bikosia

Gyrista

	Chrysista

	Diatomista

Egy 2022-es filogenetikai elemzés szerint a Bigyromonada a Pseudofungi monofiletikus testvércsoportja, a Bigyra parafiletikus:

Gyrista

	Developea

	Pirsonea

Pseudofungi

Ochrophyta

Besorolás

A 2018-as felosztása a következő az Ochrophyta 2020-ban és 2021-ben leírt új osztályaival együtt:

Subphylum Bigyromonada (Cavalier-Smith 1998)
- Classis Developea (Aleoshin et al. ex Cavalier-Smith 2017) [=Bigyromonadea (Cavalier-Smith 1997)]
- Classis Pirsonea (Cavalier-Smith 2017)
Subphylum Pseudofungi (Cavalier-Smith 1986) [=Heterokontimycotina (M.W. Dick 1976)]
- Classis Hyphochytrea (Cavalier-Smith 1986) [=Hyphochytriomycota (Whittaker 1969)]
- Classis Oomycetes (Winter in Rabenhorst 1879) [=Oomycota (Arx 1967); Peronosporomycetes (M.W. Dick 2001)]
Subphylum Ochrophytina (Cavalier-Smith 1995) [=Heterokontophyta (van den Hoek et al. 1978); Stramenochromes (Leipe et al. 1994)]
- Infraphylum Chrysista (Cavalier-Smith 1991)
  - Superclassis Limnistia (Cavalier-Smith 1996 emend. 2006)
    - Classis Eustigmatophyceae (Hibberd et Leedale (1971))
    - Classis Chrysomonadea (Saville-Kent 1881 stat. nov. Pascher 1910 emend. Cavalier-Smith 2017) [=Chrysophyceae (Pascher 1914)]
    - Classis Picophagea (Cavalier-Smith 2006 emend. 2017) [=Synchromophyceae (Horn et al. 2007)]
  - Superclassis Raphidoistia (Cavalier-Smith 1986 orth. mut. 2006)
    - Classis Raphidomonadea (Chadefaud ex Silva 1980)
      - Subclassis Raphidophycidae (Cavalier-Smith 2013)
      - Subclassis Raphopoda (Cavalier-Smith 2013)
  - Superclassis Fucistia (Cavalier-Smith 1995)
    - Classis Aurophyceae (Cavalier-Smith 2013)
      - Subclassis Aurearenophycidae (Kai Yoshii Nakayama et Inouye 2008 (Aurearenophyceaeként) stat. nov. Cavalier-Smith 2013)
      - Subclassis Phaeothamniophycidae (Andersen et Bailey 1998 (Phaeothamniophyceaeként) stat. nov. Cavalier-Smith 2006)
    - Classis Chrysomerophyceae (Cavalier-Smith 1995)
    - Classis Chrysoparadoxophyceae (Wetherbee et al. 2019)
    - Classis Phaeosacciophyceae (R.A.Andersen L.Graf et H.S.Yoon 2020)
    - Classis Schizocladiophyceae (Henry Okuda et Kawai 2003)
    - Classis Phaeophyceae (Kjellman 1891) [=Fucophyceae (Warming 1884); Melanophyceae (Rabenhorst 1863)]
      - Subclassis Discosporangiophycidae
      - Subclassis Ishigeophycidae (Silberfeld F. Rousseau et Reviers 2014)
      - Subclassis Dictyotophycidae (Silberfeld F. Rousseau et Reviers 2014)
      - Subclassis Fucophycidae (Cavalier-Smith 1986)
    - Classis Xanthophyceae (Allorge ex Fritsch 1935) [=Tribophyceae (Hibberd 1981); Heterokontae (Luther 1899)]
- Infraphylum Diatomista (Derelle et al. ex Cavalier-Smith 2017)
  - Superclassis Hypogyrista (Cavalier-Smith 1995 stat. nov. 2006)
    - Classis Dictyochophyceae (Silva 1980) [=Dictyochia (Haeckel 1894); Alophycidae (Cavalier-Smith 2006)]
      - Subclassis Pedinellia (Cavalier-Smith 1986 stat. nov. 2017) [=Actinochrysophyceae (Cavalier-Smith 1995); Axodines]
      - Subclassis Pelagophycidae (Andersen et Saunders 1993 (Pelagophyceaeként) ex Cavalier-Smith 2006)
      - ?Subclassis Sulcophycidae (Cavalier-Smith 2013) – ?Sulcochrysis
    - Classis Pinguiophyceae (Kawachi et al. 2002)
  - Superclassis Khakista (Cavalier-Smith 2000 stat. nov. 2017)
    - Classis Bolidophyceae
    - Classis Diatomeae [=Bacillariophyceae]
      - Subclassis Corethrophycidae (Round et Crawford 1990)
      - Subclassis Rhizosoleniophycidae (Round et Crawford 1990)
      - Subclassis Eucentricophycidae (Cavalier-Smith 2000)
      - Subclassis Bacillariophycidae [=Pennatia (Pennatia Schütt 1896); =Pennatophycidae]
- Ochrophytina incertae sedis
  - Classis Olisthodiscophyceae (Barcytė Eikrem et M. Eliáš 2021)

Vírusok

A Narnaviridae családba tartozik a Phytophthora infestans növénykártevőt fertőző PiRV-4, mely a ScNV-20S és az ScNV-23S közeli rokona. Ez az első nem gombában felfedezett narnavírus.

Megjegyzések

↑ Cavalier-Smith szerint a Sulchochrysis feltehetően kapcsolódik az Olisthodiscushoz, és mindkét nemzetséget ide sorolta. Azonban egy 2021-es tanulmány szerint az Olisthodiscales az Olisthodiscophyceae osztály része, mely kizárólag az Olisthodiscusból áll. A Sulcochrysis helyzete bizonytalan a DNS-szekvenciák hiánya miatt.

Hivatkozások

↑ Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019). "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006. PMID 30257078.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
1 2 3 4 5 6 7 Cavalier-Smith, Thomas (2017). "Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences". Protoplasma. 255 (1): 297–357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. PMC 5756292. PMID 28875267. S2CID 254085270.
1 2 Cavalier-Smith T (1998. augusztus). "A revised six-kingdom system of life". Biol Rev Camb Philos Soc. 73 (3): 203–266. doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x. PMID 9809012.
↑ Craig RJ (2023. június 20.). "Replitrons: A major group of eukaryotic transposons encoding HUH endonuclease". Proc Natl Acad Sci U S A. 120 (25): e2301424120. doi:10.1073/pnas.2301424120. PMC 10288648. PMID 37307447.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link)
↑ Derelle R, López-García P, Timpano H, Moreira D (2016. november). "A Phylogenomic Framework to Study the Diversity and Evolution of Stramenopiles (=Heterokonts)". Mol Biol Evol. 33 (11): 2890–2898. doi:10.1093/molbev/msw168. PMC 5482393. PMID 27512113.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
↑ Cho A, Tikhonenkov DV, Hehenberger E, Karnkowska A, Mylnikov AP, Keeling PJ (2022). "Monophyly of diverse Bigyromonadea and their impact on phylogenomic relationships within stramenopiles" (PDF). Molecular Phylogenetics and Evolution. 171 (107468): 107468. doi:10.1016/j.ympev.2022.107468. ISSN 1055-7903. S2CID 247815732.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
1 2 Graf L, Yang EC, Han KY, Küpper FC, Benes KM, Oyadomari JK, Herbert RJH, Verbruggen H, Wetherbee R, Andersen RA, Yoon HS (2020. december). "Multigene Phylogeny, Morphological Observation and Re-examination of the Literature Lead to the Description of the Phaeosacciophyceae Classis Nova and Four New Species of the Heterokontophyta SI Clade". Protist. 171 (6): 125781. doi:10.1016/j.protis.2020.125781. PMID 33278705. S2CID 227315556.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
1 2 3 Dovilė Barcytė; Wenche Eikrem; Anette Engesmo; Sergio Seoane; Jens Wohlmann; Aleš Horák; Tatiana Yurchenko; Marek Eliáš (2021. március 2.). "Olisthodiscus represents a new class of Ochrophyta". Journal of Phycology. 57 (4): 1094–1118. doi:10.1111/jpy.13155. hdl:10852/86515. PMID 33655496.
↑ Kai A, Yoshii Y, Nakayama T, Inouye I (2008). "Aurearenophyceae classis nova, a New Classis of Heterokontophyta Based on a New Marine Unicellular Alga Aurearena cruciata gen. et sp. nov. Inhabiting Sandy Beaches". Protist. 159 (3): 435–457. doi:10.1016/j.protis.2007.12.003. ISSN 1434-4610. PMID 18358776.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
1 2 Cavalier-Smith, Thomas; Scoble, Josephine Margaret (2012). "Phylogeny of Heterokonta: Incisomonas marina, a uniciliate gliding opalozoan related to Solenicola (Nanomonadea), and evidence that Actinophryida evolved from raphidophytes". European Journal of Protistology. 49 (3): 328–353. doi:10.1016/j.ejop.2012.09.002. PMID 23219323.
1 2 Silberfeld T, Rousseau F, de Reviers B (2014). "An Updated Classification of Brown Algae (Ochrophyta, Phaeophyceae)". Cryptogamie, Algologie. 35 (2): 117–156. doi:10.7872/crya.v35.iss2.2014.117. S2CID 86227768.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)
↑ Hibberd DJ (1981. február). "Notes on the taxonomy and nomenclature of the algal classes Eustigmatophyceae and Tribophyceae (synonym Xanthophyceae)". Botanical Journal of the Linnean Society. 82 (2): 93–119. doi:10.1111/j.1095-8339.1981.tb00954.x.
↑ Cai G, Myers K, Fry WE, Hillman BI (2011. október 5.). "A member of the virus family Narnaviridae from the plant pathogenic oomycete Phytophthora infestans". Arch Virol. 157 (1): 165–169. doi:10.1007/s00705-011-1126-5. PMID 21971871.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a Gyrista című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

Biológiaportál • összefoglaló, színes tartalomajánló lap

[13] Cavalier-Smith szerint a Sulchochrysis feltehetően kapcsolódik az Olisthodiscushoz, és mindkét nemzetséget ide sorolta. Azonban egy 2021-es tanulmány szerint az Olisthodiscales az Olisthodiscophyceae osztály része, mely kizárólag az Olisthodiscusból áll. A Sulcochrysis helyzete bizonytalan a DNS-szekvenciák hiánya miatt.

[Adl_2019-1] Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019). "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006. PMID 30257078.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

[8phyla-2] 1 2 3 4 5 6 7 Cavalier-Smith, Thomas (2017). "Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences". Protoplasma. 255 (1): 297–357. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. PMC 5756292. PMID 28875267. S2CID 254085270.

[6kingdoms1998-3] 1 2 Cavalier-Smith T (1998. augusztus). "A revised six-kingdom system of life". Biol Rev Camb Philos Soc. 73 (3): 203–266. doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x. PMID 9809012.

[Craig_2023-4] Craig RJ (2023. június 20.). "Replitrons: A major group of eukaryotic transposons encoding HUH endonuclease". Proc Natl Acad Sci U S A. 120 (25): e2301424120. doi:10.1073/pnas.2301424120. PMC 10288648. PMID 37307447.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link)

[FrameworkStramenopiles-5] Derelle R, López-García P, Timpano H, Moreira D (2016. november). "A Phylogenomic Framework to Study the Diversity and Evolution of Stramenopiles (=Heterokonts)". Mol Biol Evol. 33 (11): 2890–2898. doi:10.1093/molbev/msw168. PMC 5482393. PMID 27512113.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

[MonophylyOfBigyromonadea-6] Cho A, Tikhonenkov DV, Hehenberger E, Karnkowska A, Mylnikov AP, Keeling PJ (2022). "Monophyly of diverse Bigyromonadea and their impact on phylogenomic relationships within stramenopiles" (PDF). Molecular Phylogenetics and Evolution. 171 (107468): 107468. doi:10.1016/j.ympev.2022.107468. ISSN 1055-7903. S2CID 247815732.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

[Phaeosacciophyceae-7] 1 2 Graf L, Yang EC, Han KY, Küpper FC, Benes KM, Oyadomari JK, Herbert RJH, Verbruggen H, Wetherbee R, Andersen RA, Yoon HS (2020. december). "Multigene Phylogeny, Morphological Observation and Re-examination of the Literature Lead to the Description of the Phaeosacciophyceae Classis Nova and Four New Species of the Heterokontophyta SI Clade". Protist. 171 (6): 125781. doi:10.1016/j.protis.2020.125781. PMID 33278705. S2CID 227315556.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: oldalszám helyett cikk száma (link) CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

[Olisthodiscophyceae-8] 1 2 3 Dovilė Barcytė; Wenche Eikrem; Anette Engesmo; Sergio Seoane; Jens Wohlmann; Aleš Horák; Tatiana Yurchenko; Marek Eliáš (2021. március 2.). "Olisthodiscus represents a new class of Ochrophyta". Journal of Phycology. 57 (4): 1094–1118. doi:10.1111/jpy.13155. hdl:10852/86515. PMID 33655496.

[Aurearena-9] Kai A, Yoshii Y, Nakayama T, Inouye I (2008). "Aurearenophyceae classis nova, a New Classis of Heterokontophyta Based on a New Marine Unicellular Alga Aurearena cruciata gen. et sp. nov. Inhabiting Sandy Beaches". Protist. 159 (3): 435–457. doi:10.1016/j.protis.2007.12.003. ISSN 1434-4610. PMID 18358776.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

[Incisomonas-10] 1 2 Cavalier-Smith, Thomas; Scoble, Josephine Margaret (2012). "Phylogeny of Heterokonta: Incisomonas marina, a uniciliate gliding opalozoan related to Solenicola (Nanomonadea), and evidence that Actinophryida evolved from raphidophytes". European Journal of Protistology. 49 (3): 328–353. doi:10.1016/j.ejop.2012.09.002. PMID 23219323.

[UpdatedPhaeophyceae-11] 1 2 Silberfeld T, Rousseau F, de Reviers B (2014). "An Updated Classification of Brown Algae (Ochrophyta, Phaeophyceae)". Cryptogamie, Algologie. 35 (2): 117–156. doi:10.7872/crya.v35.iss2.2014.117. S2CID 86227768.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)

[Tribophyceae-12] Hibberd DJ (1981. február). "Notes on the taxonomy and nomenclature of the algal classes Eustigmatophyceae and Tribophyceae (synonym Xanthophyceae)". Botanical Journal of the Linnean Society. 82 (2): 93–119. doi:10.1111/j.1095-8339.1981.tb00954.x.

[Cai_2012-14] Cai G, Myers K, Fry WE, Hillman BI (2011. október 5.). "A member of the virus family Narnaviridae from the plant pathogenic oomycete Phytophthora infestans". Arch Virol. 157 (1): 165–169. doi:10.1007/s00705-011-1126-5. PMID 21971871.{{cite journal}}: CS1 karbantartás: több név: szerzőfelsorolás (link)