Barcelona
A 2008–2009-es szezonban Busquets már a második fordulóban bemutatkozhatott, és mint később kiderült, Guardiola komolyan számol vele. A szezon elején a szurkolók elégedetlenek voltak, mert sokszor Yaya Touré helyett játszott, de később mind a ketten lehetőséghez jutottak. Busquets bebizonyította, hogy nem véletlenül került a nagy csapathoz. A Basel elleni Bajnokok Ligája meccsen kivette a részét az 5-0 arányú győzelemből, és megszerezte első gólját a Barcelonában. Kiváló teljesítményének köszönhetően játszhatott a Real Madrid ellen is. Aláírta új szerződését, ami év végén lejárt volna, így 2013-ig hosszabbított. Az Athletic Bilbao elleni jó teljesítményét első bajnoki góljával tette még emlékezetesebbé. A Bajnokok Ligája döntőjében a kezdők között kapott szerepet, mivel Yaya Touré sérült volt és az eltiltott védők miatt hátvédként szerepelt.
Az 2009–2010-es előszezonban – a tavalyi 28-as után – a 18-as mezszámmal szerepelt. Ez a szám korábban Gabriel Militóé volt, de ő már több mint egy éve sérült. Az idényben már a 16-os mezszámmal szerepelt.
Busquets 2010–2011-ben ismét sokszor játszott, olykor középhátvédként. 2011. január 27-én szerződéshosszabbítást írt alá, amely 2015-ig szólt, a kivásárlási záradékot pedig 150 millió euróra emelték. 2011. március 8-án középhátvédként öngólt vétett az Arsenal ellen, szögletrúgásból a Bajnokok Ligája nyolcaddöntőjében, és ezzel kiegyenlítette az állást 1–1-re, a Barcelona végül 3–1-re (összesítésben 4–3-ra) megnyerte a meccset. Május 28-án a teljes meccset végigjátszotta csapata Manchester United 3–1-re megnyert Bajnokok Ligája-döntőjében a Wembley Stadionban.
2012. április 24-én gólt lőtt, de a Barcelona így is csak 2–2-t tudott játszani, végül pedig 2–3-ra összesítésben kikapott a Chelseatől a Bajnokok Ligája elődöntő visszavágóján.
2013. július 16-án 25. születésnapján ismételten kontraktust hosszabbított 2018-ig, a kivásárlási záradéka viszont változatlan maradt. 2014. augusztus 1-jén, Carles Puyol csapatkapitány és védő visszavonulása után, személyes kérésére megkapta az 5-ös számú mezt a következő idényre, és a csapat negyedik számú kapitánya lett Xavi, Andrés Iniesta és Lionel Messi mögött.
2015. június 6-án a Bajnokok Ligája döntőjében az olasz Juventus ellen kezdőként végigjátszotta az összecsapást, klubja 3–1 arányban diadalmaskodott a berlini Olimpiai Stadionban. Ezzel harmadik BL-győzelmét ünnepelhette a klub szerelésében. Ezzel Dani Alves, Iniesta, Messi, Pedro, Gerard Piqué és Xavi mellett az egyetlen játékos lett, aki elérte, hogy háromszor nyerte meg a hazai bajnokságot, a hazai kupát és a Bajnokok Ligáját is.
2015. október 3-án Busquets először volt a Barcelona csapatkapitánya Iniesta és Messi hiányában a Sevillától elszenvedett, idegenbeli 2–1-es vereség alkalmával.
2017. október 1-jén a Las Palmas elleni 3–0-s győzelmet arattak, a mérkőzést zárt kapuk mögött játszották a Camp Nouban a folyamatban lévő katalán függetlenségi népszavazás miatt. Egy évvel később új szerződést írt alá 2023 júniusáig, amely 200 millió euróról – 500 millió euróra növelte a kivásárlási záradékát. 2018. november 24-én 500. mérkőzését játszotta a Barcelona színeiben az Atlético Madrid vendégeként, december 11-én pedig 100. alkalommal lépett pályára a Bajnokok Ligájában a Tottenham Hotspur elleni 1–1-es csoportkörben.
2021. január 9-én már 600. alkalommal szerepelt a gránátvörös-kék szerelésben a Granada elleni 4–0-s győzelem során a Los Cármenesben. Nála csak kortársai, Xavi, Iniesta és Messi játszottak több meccset a klub történetében. Augusztusban kinevezték hivatalos csapatkapitánynak, miután Messi a Paris Saint-Germainhez távozott.
2023. május 10–én bejelentette, hogy 15-év után elhagyja a klubot.
spanyol
