TSAR

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TSAR
Intervallo geologico
Classificazione scientifica
DominioEukaryota
SottodominioBikonta
SupergruppoEubikonta
Brown et al., 2013
GruppoDiaphoretickes
SottogruppoAHTSAR
InfragruppoHTSAR
SuperregnoTSAR
regni
(filogenetica)

TSAR è uno dei due superregni (in tassonomia filogenetica) del sottogruppo HTSAR (l'altro è Haptista) TSAR comprende i due regni (T)Telonemia e SAR, chiamato così perché contenente i due subphylum (S) Stramenopiles e (A) Alveolata (del phylum Halvaria), e il Phylum (R) Rhizaria.

Filogenetica

Il superregno è stato stabilito sulla base di studi filogenetici basati su 248 geni e utilizzando modelli di mescolanza eterogenea, che risolvono l'origine evolutiva della Telonemia come gruppo fratello del supergruppo SAR.

Storia

La specie Telonemia subtile fu scoperta da Greissmann nel 1913. Fu classificata da Thomas Cavalier-Smith nella famiglia Telonemidae dell'ordine Telonemida del phylum Opalozoa, e nel 2006 Shalchian-Tabrizi collocò la classe Telonemea nella tribù Telonemia.

In passato, furono formulate diverse ipotesi sulla filogenesi dei Diaphoretickes al di fuori degli Archaeplastida: Okamoto nel 2009 creò Hacrobia, che secondo un altro studio del 2009 includeva Telonemia, Centroplasthelida, Cryptophyta e Haptophytina. Tuttavia, è stato dimostrato che Hacrobia è polifiletico: Haptista è più strettamente imparentato con Sar che con Cryptista.

Nel 2019, Strassert et al. hanno fornito un supporto significativo alla monofilia di TSAR nel loro studio filogenomico.

Nel 2022, Tikhonenkov et al. hanno riportato l'origine di TSAR da flagellati complessi e hanno suggerito che Telonemia dovrebbe essere considerata nello studio dell'evoluzione degli eucarioti. Nello stesso studio, hanno creato il genere Arpakorses, che comprende le specie Arpakorses versatilis e Arpakorses idiomastiga.

Genomica

La nucleoporina 210 (glicoproteina del poro nucleare gp210, aiuta ad ancorare il poro alla membrana nucleare e regola il trasporto di molecole tra nucleo e citoplasma).ha geni ortologhi (presenti in specie diverse che derivano da un unico gene ancestrale comune e si sono separati a causa di un evento di speciazione) nelle piante, in TSAR e in Excavata, quindi era probabilmente presente nell'ultimo antenato comune degli eucarioti, ma molti taxa sono privi di ortologhi di Nup210.

Note

  1. ↑ (EN) Matthew W. Brown et al., Phylogenomics demonstrates that breviate flagellates are related to opisthokonts and apusomonads, in Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences, vol. 280, n. 1769, 22 ottobre 2013, p. 20131755, DOI:10.1098/rspb.2013.1755, ISSN 0962-8452 (WC · ACNP), PMC 3768317, PMID 23986111.
  2. 1 2 Jürgen F H Strassert, New Phylogenomic Analysis of the Enigmatic Phylum Telonemia Further Resolves the Eukaryote Tree of Life, in Molecular Biology and Evolution, vol. 36, n. 4, April 2019, DOI:10.1093/molbev/msz012.
  3. ↑ (EN) J.F. Strassert, M. Jamy, A.P. Mylnikov, D.V. Tikhonenkov e F. Burki, New phylogenomic analysis of the enigmatic phylum telonemia further resolves the eukaryote tree of life., in Molecular biology and evolution, vol. 36, n. 4, 2019, pp. 757-765, DOI:10.1016/j.tree.2019.08.008.
  4. ↑ (EN) Gordon Lax et al., Hemimastigophora is a novel supra-kingdom-level lineage of eukaryotes, in Nature, vol. 564, n. 7736, 14 novembre 2018, pp. 410-414, Bibcode:2018Natur.564..410L, DOI:10.1038/s41586-018-0708-8, PMID 30429611.
  5. 1 2 Butterfield ER, Obado SO, Scutts SR, Zhang W, Chait BT, Rout MP, Field MC, A lineage-specific protein network at the trypanosome nuclear envelope, in Nucleus, vol. 15, n. 1, 11 aprile 2024, DOI:10.1080/19491034.2024.2310452.
  6. ↑ (EN) Fabien Burki, Andrew J. Roger, Matthew W. Brown e Alastair G.B. Simpson, The new tree of eukaryotes., in A cell press journal, vol. 35, n. 1, 2 gennaio 2020, pp. 43-55, DOI:10.1016/j.tree.2019.08.008.
  7. ↑ D. Klaveness, [http://ijs.sgmjournals.org/content/55/6/2595.long Telonema antarcticum sp. nov., a common marine phagotrophic flagellate], in International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 55, n. 6, 2005, DOI:10.1099/ijs.0.63652-0.
  8. ↑ Cavalier-Smith T, Kingdom Protozoa and its 18 phyla (PDF), in Microbiol Rev, vol. 57, n. 4, december 1993, DOI:10.1128/mr.57.4.953-994.1993.
  9. ↑ Telonemia, a new protist phylum with affinity to chromist lineages, in Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 273, n. 1595, 28 aprile 2006, DOI:10.1098/rspb.2006.3515.
  10. ↑ Burki, F, Large-scale phylogenomic analyses reveal that two enigmatic protist lineages, Telonemia and Centroheliozoa, are related to photosynthetic chromalveolates, in Genome Biology and Evolution, vol. 1, 2009, DOI:10.1093/gbe/evp022.
  11. ↑ F Burki, Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista, in Proc Biol Sci, vol. 283, n. 1823, 2016, DOI:10.1098/rspb.2015.2802.
  12. ↑ <Denis V. Tikhonenkov, On the origin of TSAR: morphology, diversity and phylogeny of Telonemia, in Open Biology, vol. 12, n. 3, The Royal Society, 2022, DOI:10.1098/rsob.210325.