CDNA

cDNA (od ang. complementary DNA), komplementarny DNA – DNA uzyskany poprzez odwrotną transkrypcję na matrycy mRNA.

Biblioteki cDNA

Zbiór klonów komórek bakteryjnych zawierający cDNA komplementarny do mRNA całego transkryptomu danego organizmu nazywamy biblioteką cDNA. Ze względu na to, że mRNA jest efektem transkrypcji genów, cDNA reprezentuje zestaw sekwencji produktów genów ulegających ekspresji w danej komórce, jest to istotne gdyż profile ekspresji białek różnią się między komórkami pochodzącymi z różnych tkanek.

Zastosowanie

Cechą charakterystyczną genów eukariotycznych są introny, które muszą być usunięte w procesie składania hn-mRNA. W związku z tym na podstawie cDNA i znajomości sekwencji genu, którą możemy uzyskać z baz danych lub z bibliotek genomowych możemy wykrywać introny w genach eukariotycznych oraz badać splicing alternatywny, który może być swoisty, na przykład na poziomie organelli komórkowych, tkanek lub narządów (tzw. profile ekspresji).

Przypisy

  1. ↑ F. M. Ausubel, R. Brent, R. E. Kingston, D. D. Moore, J.G. Seidman, J. A. Smith, K. Struhl, Current protocols in molecular biology, Chapter 5, Section I, Unit 5.2, Willey & Sons, 2003, ISBN 047150338-X (ang.)
  2. ↑ F. M. Ausubel, R. Brent, R. E. Kingston, D. D. Moore, J.G. Seidman, J. A. Smith, K. Struhl, Current protocols in molecular biology, Chapter 5, Section III, Unit 5.4, Willey & Sons, 2003, ISBN 047150338-X (ang.)
  3. ↑ "John Wagner at Cornell University Medical College, Isolation and use of cDNA clones".
  4. ↑ " A cDNA library contains only those DNA sequences that are transcribed into mRNA, Pierce, Benjamin. Genetics: A Conceptual Approach, 2nd ed. (New York: W. H. Freeman and Company).
  5. 1 2 Kanyon Colleg, Course BIOL114, Chapter 11. Development: Differentiation and Determination.
  6. ↑ L. Stryer, J. M. Berg, J. L. Tymoczko, Biochemia, rozdział 4, sekcja 4.6, wyd. IV, PWN 2011, ISBN 978-83-01-15811-8

Linki zewnętrzne