Campylobacterota

Como ler uma infocaixa de taxonomiaCampylobacterota
Classificação científica
Domínio: Bacteria
Filo: Campylobacterota
Garrity e Holt 2021
Classes
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Campylobacterota é um filo de bactérias gram-negativas. Até 2021, era considerado uma classe do filo Proteobacteria sob o nome Epsilonproteobacteria. Possui apenas alguns gêneros caracterizados, incluindo Wolinella, Helicobacter, e Campylobacter.

A maior parte das espécies conhecidas habitam o aparelho digestivo de animais, onde podem viver em simbiose com o hospedeiro, como Wolinella spp. em bovinos, ou atuam como patógenos, como Helicobacter spp. no estômago e Campylobacter spp. no duodeno. Contudo, indivíduos do filo já foram encontrados também em habitats ambientais como fissuras hidrotermais e áreas de emanação fria. Estes isolados ambientais incluem as espécies Sulfurimonas autotrophica, Sulfurimonas paralvinellae, Sulfurovum lithotrophicum eNautilia profundicola.

Muitas bactérias deste filo possuem motilidade através de flagelos. Alguns indivíduos encontrado em fissuras hidrotermais, são capazes de suprir suas demandas energéticas através da oxidação de enxofre, formiato, ou hidrogênio acoplada a redução de nitrato ou oxigênio. Outros são autotróficos, utilizando o ciclo de Krebs de maneira reversa para fixar dióxido de carbono em biomassa, A sensitividade a oxigênio desta via metabólica eh consistente com estes ambiente anaeróbio ou microaerófilicos. Acredita-se que esta característica foi desenvolvida nos oceanos durante o períodoMesoproterozoicos, os quais provavelmente possuíam baixos níveis de oxigênio disponível.


Filogenia

A taxonomia atualmente aceite baseia-se na List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) e National Center for Biotechnology Information (NCBI)


16S rRNA com base no LTP_10_2024 120 proteínas marcadoras com base em GTDB 09-RS220
 
Desulfurellia
Desulfurellales
 

Desulfurellaceae

 
 

Hippeaceae

 
 
 
Campylobacteria
Nautiliales
 

Nautiliaceae

 
 
Campylobacterales
 

Nitratiruptoraceae

 
 
 

Hydrogenimonadaceae

 
 
 

Thioreductoraceae

 
 
 

Helicobacteraceae

 
 
 
 

Sulfurovaceae

 
 

Sulfurimonadaceae

 
 
 
 

Sulfurospirillaceae

 
 
 

Arcobacteraceae

 
 

Campylobacteraceae

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Desulfurellia
Desulfurellales
 

Desulfurellaceae Kuever, Rainey & Widdel 2006

 
 

Hippeaceae Waite et al. 2020

 
 
{Campylobacterota_A}
Campylobacteria
Nautiliales

Nautiliaceae Miroshnichenko et al. 2004

 
Campylobacterales
 
 

Helicobacteraceae Garrity et al. 2006

 
 

Arcobacteraceae Waite et al. 2020

 
 
 
 
 

Sulfurospirillaceae Waite et al. 2020

 
 

Campylobacteraceae Vandamme & De Ley 1991

 
 
 
 
 

Thiovulaceae Waite et al. 2020

 
 

Sulfurimonadaceae Waite et al. 2020

 
 
 
 

Nitratiruptoraceae Waite et al. 2020

 
 
 

Hydrogenimonadaceae Waite et al. 2020

 
 

Sulfurovaceae Waite et al. 2020

 
 
 
 
 
 
{Campylobacterota}

Referências

  1. ↑ Oren A, Garrity GM (2021). «Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes». Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10). 5056 páginas. PMID 34694987. doi:10.1099/ijsem.0.005056Acessível livremente
  2. ↑ Oren, Aharon; Garrity, George M. (2021). «Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (10). 005056 páginas. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/ijsem.0.005056. Consultado em 20 de novembro de 2024
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  5. ↑ Inagaki, Fumio; Ken Takai; Kenneth H. Nealson; Koki Horikoshi (1 de setembro de 2004). «Sulfurovum lithotrophicum gen. nov., sp. nov., a novel sulfur-oxidizing chemolithoautotroph within the ε-Proteobacteria isolated from Okinawa Trough hydrothermal sediments». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 54 (5): 1477–1482. ISSN 1466-5026. PMID 15388698. doi:10.1099/ijs.0.03042-0Acessível livremente
  6. ↑ Julie L. Smith; Barbara J. Campbell; Thomas E. Hanson; Chuanlun L. Zhang; S. Craig Cary (2008). «Nautilia profundicola sp. nov., a thermophilic, sulfur-reducing epsilonproteobacterium from deep-sea hydrothermal vents». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 58 (7): 1598–1602. PMID 18599701. doi:10.1099/ijs.0.65435-0
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  8. ↑ Takai, Ken; et al. (2005). «Enzymatic and genetic characterization of carbon and energy metabolisms by deep-sea hydrothermal chemolithoautotrophic isolates of Epsilonproteobacteria». Applied and Environmental Microbiology. 71 (11): 7310–7320. Bibcode:2005ApEnM..71.7310T. PMC 1287660Acessível livremente. PMID 16269773. doi:10.1128/aem.71.11.7310-7320.2005
  9. ↑ Campbell, Barbara J.; Engel, Annette Summers; Porter, Megan L.; Takai, Ken (2 de maio de 2006). «The versatile ε-proteobacteria: key players in sulphidic habitats». Nature Reviews Microbiology. 4 (6): 458–468. ISSN 1740-1526. PMID 16652138. doi:10.1038/nrmicro1414
  10. ↑ Anbar, A. D.; A. H. Knoll (16 de agosto de 2002). «Proterozoic Ocean Chemistry and Evolution: A Bioinorganic Bridge?». Science. 297 (5584): 1137–1142. Bibcode:2002Sci...297.1137A. CiteSeerX 10.1.1.615.3041Acessível livremente. PMID 12183619. doi:10.1126/science.1069651
  11. ↑ A.C. Parte; et al. «Campylobacterota». List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Consultado em 9 de setembro de 2023
  12. ↑ Sayers; et al. «Campylobacterota». National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado em 9 de setembro de 2023
  13. ↑ «The LTP». Consultado em 10 de dezembro de 2024
  14. ↑ «LTP_all tree in newick format». Consultado em 10 de dezembro de 2024
  15. ↑ «LTP_10_2024 Release Notes» (PDF). Consultado em 10 de dezembro de 2024
  16. ↑ «GTDB release 09-RS220». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 de maio de 2024
  17. ↑ «bac120_r220.sp_labels». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 de maio de 2024
  18. ↑ «Taxon History». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 de maio de 2024